一、ESR基因型与青年母猪外周血液激素浓度的关系(论文文献综述)
赵云[1](2021)在《视黄醇结合蛋白4对猪卵泡颗粒细胞功能的影响及其机制研究》文中研究表明卵泡发育不但受“下丘脑-垂体-卵巢轴”分泌的激素调节,而且受旁分泌和自分泌因子调控。卵泡颗粒细胞是卵泡内体细胞的主要类型,主要功能为合成分泌激素和细胞因子,为卵母细胞成熟和卵泡发育提供营养物质。颗粒细胞分泌的细胞因子通过复杂的信号转导,参与优势卵泡选择和卵泡闭锁的调控。研究证实,颗粒细胞凋亡是卵泡闭锁的潜在机制。因此,阐明颗粒细胞凋亡机制,为提高雌性动物繁殖能力和治疗卵巢疾病具有重要的科学意义。视黄醇结合蛋白4(RBP4)属于载脂蛋白家族成员之一,是视黄醇的特异性转运蛋白,负责将视黄醇从肝脏转运至外周组织。研究表明,RBP4在许多哺乳动物卵巢中表达,血液中RBP4含量与人的胰岛素抵抗和多囊卵巢综合症相关,猪囊肿卵泡液中有高浓度的RBP4蛋白,推测RBP4可能参与调控颗粒细胞功能。但目前有关RBP4对卵泡颗粒细胞的调控研究相对较少。为了探讨RBP4的功能,通过构建RBP4过表达载体包装慢病毒和设计干扰RNA,改变猪卵泡颗粒细胞RBP4的表达量,采用流式细胞术、RT-qPCR和Western blotting等分子生物学技术,从基因和蛋白表达水平检测RBP4对猪卵泡颗粒细胞凋亡和孕酮合成分泌的影响。通过高通量测序分析,发现RBP4处理组差异表达基因富集在胰岛素通路中,结合胰岛素下游通路ERK1/2位点的抑制剂(U0126)处理,阐明RBP4通过ERK1/2信号通路影响颗粒细胞凋亡和孕酮分泌的分子机制。本研究主要结果如下:1.构建猪RBP4基因慢病毒表达载体并成功包装pLVX-RBP4重组慢病毒,病毒滴度达到3×108TU/m L;重组慢病毒成功感染原代培养的猪卵泡颗粒细胞,并且细胞中RBP4基因的表达水平显着升高。过表达RBP4能显着降低BCL2和XIAP的表达水平,增加BAX的表达量,促进猪卵泡颗粒细胞凋亡,抑制孕酮分泌。2.设计合成RBP4干扰序列,确定siRBP4_01干扰片段转染颗粒细胞72 h,能显着降低RBP4的表达水平。干扰RBP4能增加细胞活力,显着降低CASPASE和BAX表达量,抑制颗粒细胞凋亡。3.使用慢病毒处理猪卵泡颗粒细胞72 h,利用高通量测序检测mRNA表达图谱的变化。结果显示,与对照组相比,检测到113个差异基因,71个基因上调,42个基因下调;差异基因主要富集在氧化磷酸化通路、胰岛素通路、AMPK等16个信号通路。4.干扰RBP4能激活ERK1/2通路,siRBP4_01能减弱U0126对ERK1/2通路的抑制作用,siRBP4_01组与siRBP4_01+U0126组相比,细胞活力增加,凋亡基因的表达量显着下降,抑制颗粒细胞凋亡。因此,RBP4主要通过抑制ERK1/2通路激活,调控颗粒细胞凋亡,抑制孕酮合成分泌。综上所述,本研究通过慢病毒过表达和干扰RNA处理猪卵泡颗粒细胞,利用RT-qPCR、Western blotting以及分子网络分析等研究手段,证明了RBP4可通过抑制ERK1/2信号通路,促进颗粒细胞凋亡基因的表达,降低颗粒细胞活力,促进颗粒细胞凋亡;同时,抑制颗粒细胞中孕酮合成基因的表达,降低孕酮分泌。本研究的结果为RBP4在卵泡发育及颗粒细胞发育过程中所涉及的调控机制提供了新的见解。
孙燕勇[2](2021)在《整合eGWAS和eQTL分析绵羊全血转录组与繁殖激素的关联》文中进行了进一步梳理血液中繁殖激素的动态变化对于评估家畜繁殖性能具有重要意义,血液转录组不仅用来鉴定多个物种的免疫相关调控因子,近年来在家畜生产管理中的应用也逐渐开展。为解析绵羊全血转录组的动态时序表达与繁殖激素调控的关联,本研究以巴美肉羊为研究对象,对血液转录组及其表达基因型进行深入挖掘,将有助于提升血液应用于家畜繁殖性能辅助管理的新认识。本研究获得的主要研究结果如下:1、对绵羊血液转录组的时序动态表达进行研究,检测3、4和5月的不同经产羔类型绵羊的血液转录组,对基因表达与可变剪接进行组间差异分析初探。结果不同经产羔类型之间共检测到1417个差异表达基因,3332个差异可变剪接基因,相比无羔组,单羔组与双羔组基因表达模式更接近。差异表达基因与差异可变剪接共同功能富集结果说明血液表征产羔类型与卵母细胞减数分裂、激素调节和免疫应答等相关。不同月份之间共鉴定到660个差异表达基因,3135个差异可变剪接基因,动态时序表达的基因在功能层面直接或者间接影响激素水平,由此推断绵羊血液时序表达基因可能与激素紧密相关。2、在研究一差异基因分析的基础上,扩大到237个样本,构建加权基因共表达网络(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA),并结合表达全基因组关联分析(expression genome-wide association study,e GWAS)重点研究促卵泡素(follicle-stimulaing hormone,FSH)、促黄体素(luteinizing hormone,LH)、生长分化因子9(growth differentiation factor 9,GDF9)和骨形态发生蛋白15(bone morphogenetic protein 15,BMP15)血清浓度与基因动态表达、变异的关联。结果产羔类型差异表达基因分布在红色和紫色基因模块中较多,且全局网络中红色和紫色基因模块与产羔数关联度较高。通过e GWAS发现模块的显着关联基因主要位于X染色体,包括COIL、NELFE和GCLM等,参与调控卵母细胞成熟、颗粒细胞毛细血管再生、季节性繁殖和免疫应答等。时序差异表达基因主要分布在黄色和蓝色基因模块中,且在全局网络中黄色、蓝色基因模块与激素关联度较高。e GWAS显着关联基因包括CASP9和SRP68基因等,功能富集到催产素信号通路,均影响激素调控过程。最后使用机器学习和先验的绵羊GWAS数据库的方法对样品分组与全局网络模块的功能进行验证补充,证明了小样本差异表达基因在大样本分析中的支持度与可行性。总之,通过表达基因组层面解析了绵羊繁殖激素的关联网络,为繁殖激素时序生理状态的基因表达与变异体之间提供互补信息。3、为进一步挖掘高繁绵羊血清LH/FSH比值调控的深层机制。发现不同LH/FSH比值的差异表达基因在50~150之间。这些基因影响核糖体、催乳激素信号通路、促性腺激素信号通路、卵巢类固醇生成、催产素信号通路和花生四烯酸代谢等与激素调控相关的通路。共鉴定了涉及黄色与蓝色基因模块的1 823个显着关联与1 433个e QTL-SNP,且不均一的分布在各染色体,e QTL-SNP共影响到690个基因。鉴定到26 445个ASE-SNP,影响了4 970个基因,均一分布在各染色体,可见LH/FSH比值与绵羊血液基因表达关联过程中受到广泛的顺式调控作用。结果共筛选出8个候选标记物:PCNX4、FAS、RPL36AL、JCHAIN、LOC101113346、IQSEC1、RPL21和RPL8,大多数的表达基因型特征显现出等位基因不平衡现象,且受到至少一个e QTL-SNP与两个ASE-SNP的影响。4、为了挖掘高繁绵羊GDF9和BMP15影响的深层机制。我们分别对不同GDF9和BMP15血清浓度下的转录组进行比较与关联研究。结果血清中BMP15和GDF9的浓度可能依赖于调节它们共享的差异表达基因RPL23A、LOC101110403、PAQR5、LOC114116858,LOC114114874和NAIP建立内分泌信号交换。其中RPL23A、PAQR5与NAIP直接或者间接地参与到卵母细胞发育和卵巢功能,证明了血液在识别激素影响下的主要基因及关联生物学过程方面的潜力。同时发现血液中广泛存在对GDF9、BMP15的ASE-SNP与e QTL-SNP的调控,共鉴定到502个ASE-SNP,包含58个同时与e QTL-SNP关联。共同调控GDF9与BMP15的e QTL-SNP与ASE-SNP表达的候选血液生物标志物JAK1,IL6R,ITGA4,GAA,PRKD3,CAMK2D,TAB2和IQGAP1的基因型存在明显的等位基因表达失衡现象。综上,本研究描绘了绵羊血液转录组与繁殖激素的网络全景,并对繁殖激素关联的调控元件进行深层探讨,证明了血液在识别激素影响下的主要基因及关联生物学过程方面的潜力,也为任何以血液为适合代理组织的复杂性状提供重要借鉴。
王子玉[3](2019)在《体况影响山羊卵泡发育的机制及哺乳期母仔一体化技术研究》文中研究表明我国山羊存栏量1.45亿只,居世界第一位,但目前山羊养殖仍比较粗放,尚未实现母羊繁殖的精准营养调控,导致其繁殖潜能未能充分发挥,规模化自繁自养山羊场中母羊年生产力(LEY)低已成为制约其效益的瓶颈因素。母畜的繁殖力受遗传、环境、营养和管理等多种因素的影响。LEY主要由产羔数、母羊产后返情时间和羔羊断奶成活率等决定。产仔(羔)数主要取决于排卵数,母畜排卵期/配种期体况对其影响较大,而母畜产后返情时间长短主要取决于哺乳期体况的恢复情况,因此母畜不同阶段的体况对繁殖性状有重要影响。卵泡的生长、发育(包括募集、选择和优势化)既受到下丘脑-垂体-卵巢轴的生殖激素的调控,也受到卵泡内基因表达的影响。Folliculome(卵泡转录组)的概念最早在奶牛上提出,目标是建立奶牛上从小卵泡到排卵前卵泡及闭锁卵泡的卵泡基因表达谱,但在山羊上的Folliculome研究尚未见报道。虽然目前人们观察到母畜体况会影响山羊的繁殖力,但是体况对卵泡发育、排卵、发情等的调控机制的研究仍然缺乏,而探索体况对山羊卵泡发育的影响、对卵泡发育过程中的关键基因表达的影响将对通过优化饲养管理、使各阶段的母羊达到适宜体况,进而提高排卵数、缩短繁殖间隔,提高母畜年生产力具有重要意义。本论文主要内容包括:(1)选择72只海门山羊育成期母羊(3.5月龄)进行TMR(全混合日粮)饲喂5个月,从5月龄开始每天试情,根据初情时的体况评分将其分成4组,分别为A瘦组(2.0-2.7)、B中等体况组(对照组,2.8-3.2)、C中等偏上体况组(3.3-3.5)和D偏胖组(3.6-4.0)。记录初情日龄、初情体重等,在第2次发情时进行屠宰测定。结果表明:母羊的体况评分与背膘厚、体重、胴体重、屠宰率高度相关。山羊不同体况对直径>1.0 mm、1.0-1.9 mm、2.0-3.0 mm和1.0-3.0 mm卵泡的数目无显着影响,但随着体况分值的增大,直径>3.0mm卵泡的数目显着增加,特别是中等偏上体况组中直径>4.0mm的优势卵泡数目显着高于中等体况组和瘦组。与瘦组和中等体况组相比,中等偏上体况组和偏胖组山羊初情日龄提早7-10 d,表明育成期母羊保持中等以上的膘情有利于大卵泡的发育,有利于增加育成羊的排卵数进而提高产羔数。根据山羊体型特点,借鉴牛、绵羊的评分标准,优化山羊的体况评分方法,为分阶段精细化饲喂保持母羊最适体况提供参考。(2)以不同体况育成期母羊2.0-3.5 mm卵泡为研究对象,采用RNA-Seq技术进行转录组测序,利用生物信息学方法筛选体况调节繁殖的关键通路和差异基因,并进行功能验证。结果表明:与正常体况羊2.0-3.5 mm的卵泡相比,偏胖羊卵泡中筛选到2019个差异表达基因,其中381个基因上调,1638个基因下调。KEGG富集分析表明体况可能通过影响精氨酸代谢、类固醇激素生成、细胞凋亡、缝隙连接、孕酮分泌等影响卵泡发育和排卵率。qRT-PCR验证表明偏胖组山羊的2.0-3.5 mm卵泡中3β-HSD的表达量显着上升,PRLR、cholesterol、APAF1、PDE5A、IGF-1 和 Leptin R 的表达量显着下调。凋亡诱导因子AIF-1在健康卵泡的颗粒细胞中有较强的表达,而随着卵泡的闭锁,颗粒细胞中AIF-1表达逐渐减弱。偏胖组卵泡AIF-1的表达较正常组和瘦组相同阶段卵泡中的表达较低。此外,偏胖组卵泡液中的P4水平显着低于正常组,脂联素水平有降低的趋势(P>0.05),瘦素和雌激素有升高的趋势(P>0.05)。本研究建立了不同体况山羊卵泡的转录组数据库,为筛选体况影响山羊卵泡发育的关键基因及分子机制提供了参考。(3)以中等体况山羊排卵前卵泡波中的小卵泡(1.0-1.9 mm),中卵泡(2.0-3.5 mm,从属卵泡)和大卵泡(5.0-8.0 mm,优势卵泡)为研究对象,通过RNA-Seq测序和生物信息学分析筛选并验证与山羊有腔卵泡发育相关的关键调控基因和通路。KEGG富集分析发现,卵泡发育过程中差异表达的基因主要富集到Focal adhesion、Cell adhesion molecule、Cytokine-cytokine receptor interaction、ECM-receptor interaction、D-Arginine and D-ornithine metabolism 和 TGF-beta signaling pathway 等通路。依据本试验的结果并结合在其他物种上的相关报道,筛选出39个与卵泡选择和优势化有关的基因,列出了其在山羊小、中、大卵泡中的基因相对表达量以及升降趋势。从中选择10个与卵泡发育密切相关的基因(FoxL2,Nobox,GDF-9,KIT,INHBA,CYP19A1,BCL-2,FSHR,LHR,ESR)进行趋势分析和qRT-PCR验证进一步证明了其在卵泡发育过程中的作用。本试验建立了不同直径卵泡的Folliculome,筛选出在卵泡优势化过程中起作用的差异表达基因和相关的调节通路,对后期深入探讨山羊有腔卵泡发育的调控机理提供了参考。(4)上述卵泡测序结果发现,精氨酸及其代谢产物(多胺、NO等)在卵泡发育中起着重要作用。为研究精氨酸替代物N-氨基甲酰谷氨酸(NCG)在哺乳期山羊上的应用效果,将分娩当天的32只哺乳母羊及其64只羔羊随机分为4组(每组8只母羊,16只羔羊),母羊日粮中NCG的添加量分别为0 g/d、1 g/d、2 g/d和3 g/d,连续饲喂42 d后断奶。结果表明:补饲NCG的哺乳期羔羊平均日增重显着高于对照组。哺乳期第21 d和第42 d,2 g/d NCG补饲组山羊的产奶量高于对照组。添加NCG会增加母羊血清中NO、胰岛素、精氨酸、瓜氨酸和鸟氨酸的浓度,降低血清中NH3、尿素的浓度。2g/dNCG补饲组羊奶的乳蛋白、腐胺、胰岛素、NO和GH含量显着高于对照组。哺乳期第42 d时屠宰部分羔羊,证明添加NCG显着增加了羔羊瘤胃肌层厚度和乳头密度。哺乳母羊体重损失减少,哺乳期末体况有所改善。本试验表明哺乳母羊日粮中添加NCG提高了母羊产奶量和羔羊的生长性能,也为NCG在母羊提早返情、进而提高母羊年生产力上的应用提供了参考。
陈浩[4](2018)在《利用全基因组重测序鉴别法系大白猪的高产仔基因》文中提出家猪分别由欧亚野猪独立驯化而成,至今已近万年。在不同的地理资源禀赋、气候条件以及选育目标等因素影响下,全球形成了丰富多样的家猪品种。中国是全球猪种资源最丰富的国家,中国地方猪种占全球猪种的三分之一,在历史上曾多次被引入欧洲,为欧洲现代商业猪种的育成作出了重要贡献。法系大白猪(FLW)以高繁殖性能着称,并被认为与近几十年来曾导入中国高产的梅山猪血缘有关。为验证这一推测,本研究利用266头欧亚野猪及家猪的高深度基因组重测序数据,采用多种遗传学分析手段,深入揭示了法系大白猪中的中国地方猪血缘及其与高产仔数等表型性状的关联性。本研究首先在两家育种公司的核心群采集了36头高产法系大白猪样本,并从保种场采集了13个品种的111头中国地方猪和6头中国野猪样本,对这些个体开展了高深度(大于25×)的基因组重测序;与公共数据库中113头欧亚野猪和家猪的重测序数据合并为266个样品的数据集;应用GATK软件鉴别到19,375,740 SNP用于后续分析。通过主成分分析、NJ聚类分析、ADMIXTURE和TreeMix分析证实了中西方猪种之间存在显着的遗传分化,且中国华东猪(梅山猪、二花脸猪和金华猪)与华南猪(陆川猪、巴马香猪和五指山猪)之间的遗传差异明显。接着,通过全基因组的共享IBD单倍型分析(rIBD),揭示出法系大白猪中分别渗入了华南猪和华东猪血缘;根据历史记载和单倍型长度分析可知,华南猪被更早导入法系大白猪中。通过祖先血缘分析,推测法系大白猪中约0.9%血缘来自华东猪,值得一提的是,法系大白猪中华东猪血缘最强渗入信号含KATNAL1基因,该基因与精子形成与活力相关。通过深入分析,再次验证了法系大白猪中KATNAL1基因位点导入了华东猪血缘,并在法系大白猪中受到强选择;进一步通过关联性分析发现华东猪的KATNAL1单倍型能显着提高公猪与配母猪的产仔数,加性效应达到0.4,具有重要的育种应用价值。采用上述同样的方法,分析了法系大白猪基因组中华南猪血缘的渗入信号,分别在10号和16号染色体中发现与抗病性相关的NAA35-GOLM1单倍型和与线粒体和细胞中ATP含量相关的ATP5H单倍型,由华南猪导入法系大白猪的单倍型受到强选择,很可能对法系大白猪抗病性和能量平衡的选育改良起到关键作用。对此前已报道的AHR基因区域进行深入分析时,发现大白猪(包括法系大白猪)中源自中国猪的AHR单倍型在高繁殖力华东猪呈高频率分布。通过等位基因频率差异分析、基因流(fD)分析、单倍型网络分析及群体间核苷酸距离(Dxy)分析等,发现华东猪的AHR单倍型是一个古老单倍型,源自另一个可能灭绝了的猪属(Sus)物种,该单倍型导入到法系大白中并受到强选择。关联性分析再次证实古老AHR单倍型与经产母猪产仔数EBV显着相关联,加性效应达0.25,即优势单倍型能为每头母猪每胎增产0.25头仔猪,具有重要的育种应用价值。
程元[5](2017)在《伊犁鹅繁殖规律及生殖激素调控的研究》文中提出本研究通过对伊犁鹅繁殖周期中主要生殖激素浓度的测定,结合卵巢及卵泡发育情况的研究,探讨伊犁鹅繁殖周期中生殖激素的变化规律;通过外源性激素调控的方式,对就巢期伊犁鹅生殖激素、卵巢及卵泡发育情况进行测定;采用PCR-SSCP(Single-Strand Conformation Polymorphism,SSCP)技术,检测伊犁鹅产蛋性能相关基因的多态性。通过以上研究为改善和提高伊犁鹅的繁殖性能,扩大其种群数量,以及进一步研究伊犁鹅的生殖调控技术和分子标记辅助选择提供理论基础。试验一:试验选取健康状况良好,体重相近的2岁伊犁鹅,分别在产蛋期、就巢期及休产期各随机选取32只,采集1次血样,测定激素水平;并分别在各时期随机选取5只采集卵巢组织,观察并测定卵巢及卵泡发育情况。结果表明:在产蛋期,伊犁鹅的促性腺激素释放激素(Gonadotropin-releasing hormone,GnRH)分别极显着高于就巢期和休产期16.70%(P<0.0l)和58.28%(P<0.0l);催乳素(prolactin,PRL)显着低于就巢期13.00%(P<0.05),极显着高于休产期28.94%(P<0.01);促卵泡素(follicle-stimulating hormone,FSH)高于于就巢期6.98%(P>0.05),极显着高于休产期21.12%(P<0.0l);促黄体生成素(luteinizing hormone,LH)极显着低于就巢期8.38%(P<0.0l),极显着高于休产期16.84%(P<0.05);雌二醇(Estradiol,E2)分别极显着高于就巢期和休产期29.80%(P<0.0l)和112.40%(P<0.0l);孕酮(progesterone,P4)水平分别极显着高于就巢期和休产期28.89%(P<0.0l)和30.34%(P<0.0l)。产蛋期伊犁鹅的卵巢重量和体积均极显着大于就巢期和休产期(P<0.01)。产蛋期卵巢上多等级卵泡生长发育活跃,层次分明;就巢期卵巢的内部有多个不同大小的各级萎缩及闭锁卵泡;休产期卵巢明显萎缩,卵泡胞质空腔变大,向内凹陷。试验二:选取健康状况良好,体重相近的30只2岁伊犁鹅随机分成5组,对照组为空白对照组及肌注生理盐水组,试验组分为肌注丙酸睾丸酮组、肌注LHRH-A3组及口服甲磺酸溴隐亭片组。分别在试验的1 d、3 d、5 d、7 d、9 d及14 d,空腹翅静脉采血4 mL/只,测定相关生殖激素指标。试验第14 d,每组随机选取4只采集卵巢组织,观察并测定卵巢及卵泡发育情况。结果表明:通过肌注丙酸睾丸酮处理后,伊犁鹅血浆GnRH、PRL整体呈下降趋势,FSH呈上升趋势,LH、E2呈波动变化,P4浓度变化不大。试验组卵巢重量、宽度和厚度分别比对照组增加81.40%(P<0.05)、57.93%(P<0.05)和41.65%(P<0.05)。经肌注LHRH-A3后,试验组LH、GnRH先上升,之后下降,PRL、P4呈上升的变化趋势;伊犁鹅卵巢的体积和重量均比对照组高,但无显着性差异;卵巢宽度比对照组增加66.19%(P<0.05),卵巢厚度比对照组增加62.99%(P<0.01)。口服甲磺酸溴隐亭片后,可使就巢期伊犁鹅PRL、P4、E2浓度显着下降,FSH浓度显着上升;试验组的原始卵泡直径、卵母细胞直径和颗粒层厚度分别显着高于对照组34.43%(P<0.05)、35.00%(P<0.05)和50.00%(P<0.05);试验组的初级卵泡直径和卵母细胞直径分别显着高于对照组24.68%(P<0.05)和30.09%(P<0.05)。试验三:采集68只2岁伊犁鹅血样(4 mL/只),利用PCR-SSCP技术和测序方法分析了伊犁鹅GnRH基因5’端调控区、PRL基因外显子5、ESR基因外显子4和FSHβ基因外显子2多态性。结果显示:GnRH得到两种基因型为AA、AB,该群体中基因型频率分别为0.70和0.30;FSH得到三种基因型为AA、AG和GG,该群体中基因型频率分别为0.53、0.10和0.36。ESR基因外显子4和PRL基因外显子5未检测到多态性。GnRH和FSHβ基因位点的多态信息含量(PIC)分别为0.222和0.367。
黄贺[6](2013)在《北极狐ESR和FSHR基因多态性、表达及其与产仔关系的研究》文中认为产仔数是养狐业的一个重要的经济性状,提高产仔数可以减少种狐饲养数量,降低生产成本,增加皮张产量,给养狐业带来巨大的经济效益;同时,提高产仔数也是北极狐育种工作的主要目标。北极狐的产仔性状是遗传力低的数量性状,采用常规的育种方法难以在短期内取得较大的遗传进展,而分子标记辅助选择(MAS)为显着改良产仔数性状提供了有效途径。到目前为止,ESR基因和FSHR基因与产仔性状的关系已经基本明确,并且在多种动物中进行了大量的研究,但是关于ESR基因和FSHR基因与北极狐产仔数关系的研究未见报道。因此,本研究以FSHR基因和ESR基因作为北极狐高产仔性状的候选基因,采用PCR技术对FSHR基因和ESR基因进行克隆测序,获得FSHR基因和ESR基因序列并进行序列分析和同源性比较;采用PCR-RFLP技术和PCR-SSCP技术对FSHR基因和ESR基因进行多态性检测,对多态位点进行测序和序列分析,确定变异类型,并将多态位点与北极狐的产仔数性状进行关联分析;采用realtime PCR技术研究不同FSHR基因和ESR基因型卵巢组织中FSHR和ESR的表达量及其对产仔数的影响;采用realtime PCR技术和免疫组化技术研究FSHR基因在北极狐发情周期卵巢中的表达规律,并对FSHR基因表达进行定位。研究结果如下:(1)北极狐ESR基因全长1824bp,包含ATG起始密码子,开放读码框编码607个氨基酸,序列中的A、T、G、C比例分别为25.23%、22.69%、25.92%、26.16%,G+C含量(52.08%)高于A+T的含量(47.92%)。DNA结合区存在八个保守的半胱氨酸残基(C),构成两个锌指结构(Zn-C4), D-box (EGCKA)、P-box (PATNQ),还存在一核定位信号(aa244-250) DRNRRKS。(2)北极狐FSHR基因序列长1947bp,包含ATG起始密码子,可编码648个氨基酸,序列中的A, T、G、C比例分别为25.17%、26.55%、21.42%、26.86%,G+C含量(48.28%)低于A+T的含量(51.72%)。(3)北极狐ESR基因的氨基酸序列与鸡、小鼠、羊、牛、人、猪的同源性分别为74%、77%、87%、88%、85%、89%,在进化关系上北极狐与猪的亲缘关系较近,与鸡最远,氨基酸组成分析表明丝氨酸含量最高,色氨酸含量最低。(4)北极狐FSHR基因的氨基酸序列与鸡、小鼠、羊、牛、人、猪的同源性分别为59%、73%、83%、83%、82%、84%,在进化关系上北极狐与人的亲缘关系较近,与鸡最远,氨基酸组成分析表明丝氨酸含量最高,酪氨酸含量最低。(5)北极狐ESR蛋白在56~60、88~89、108~121、154-172、198-205、215-220、238~239、263~266、315~337、353~359、366~374、394~420、454~503、518~526、548-556氨基酸存在15个显着的疏水区域并且不存在跨膜结构,氨基酸序列从196至267存在ZnFC4模序结构域,氨基酸序列360至530存在HOLI结构域。(6)北极狐FSHR蛋白在5-16、25~33、288-296、304-309、332-338、340-349、357~366、374~379、402~417、443~456、485~553、565~572、587~600、618~647氨基酸存在14个显着的疏水区域,氨基酸序列367至389、402至424、444至466、490至512、532至554、575至597、607至629的存在的7个跨膜结构。(7)在北极狐的FSHR基因5’端侧翼没有发现多态性;在FSHR基因外显子10发现多态性,检测到AA、AB和BB三种基因型, AA基因型为优势基因型,A等位基因频率为0.82,B等位基因频率为0.18;BB基因型个体初产的TNB和NBA分别比AA基因型的高1.08只和1.58只(P<0.05),BB基因型个体经产的TNB和NBA分别比AA基因型的高1.72只和1.03只(P<0.05)。FSHR基因外显子10第120bp发现C→T单碱基变异。(8)北极狐ESR基因外显子1存在多态性,优势等位基因为A等位基因,A等位基因频率为0.68,B等位基因频率为0.32;BB基因型个体初产的TNB和NBA分别比AA基因型的高2.61只和1.25只(P<0.05),BB基因型个体经产的TNB和NBA分别比AA基因型的高2.08只和1.29只(P<0.05)。ESR基因外显子1第539bp发现G→C单碱基变异。(9) FSHR基因和ESR基因合并基因型表现出AA、AB、BB逐步递增的趋势,基因型AAAA的初产TNB和NBA分别为7.42和6.22,基因型ABAB的TNB和NBA分别为7.46和7.07,基因型BBBB的TNB和NBA分别为8.92和8.56,经产的TNB和NBA也基本存在同样的规律。(10)在发情期,北极狐BB基因型个体右侧卵巢FSHR的mRNA水平显着高于AA基因型个体(P<0.01),左侧卵巢BB基因型个体与AA基因型个体差异显着(P<0.05)。(11)在发情期,北极狐两侧卵巢ESR的mRNA水平在基因型间无显着差异(P>0.05)。(12)北极狐发情周期不同阶段卵巢组织中均有FSHR mRNA的存在,从发情后期、间情期、发情前期到发情期,FSHR mRNA的表达量呈上升趋势,发情期表达量最高,发情后期表达量最低。(13)北极狐发情周期不同阶段卵巢各期卵泡中均有FSHR阳性细胞分布,FSHR阳性细胞主要存在于卵泡细胞、颗粒细胞、卵泡膜细胞和初级卵母细胞中。从发情后期、间情期、发情前期到发情期,FSHR阳性细胞数量呈上升趋势,发情期最多,发情后期最少。阳性细胞数量随着卵泡的发育和卵泡体积的增大不断增多。
郜军伟[7](2012)在《猪NCOA1基因和ADAMTS1基因多态性及其与繁殖性状相关性分析》文中认为核受体辅激活蛋白1(NCOA1)基因通过与结合到DNA上的核受体相互作用并增强转录活性,受到影响的雄激素受体、雌激素受体等受体在动物的生长发育和繁殖等生理过程起到重要作用。含凝血酶敏感蛋白模体的去解联金属蛋白酶(ADAMTS1)是新发现的影响排卵数的基因。本试验主要以豫南黑猪、杜洛克猪和大约克猪为试验材料,对这两种基因的多态性及其与繁殖性能的关系进行研究,以探讨这两种基因作为分子标记在猪育种工作中的应用。本实验采用酚氯仿抽提法提取猪血和猪毛囊基因组DNA。构建DNA池,进行NCOA1全基因测序,对猪NCOA1基因的遗传变异位点进行筛选。应用PCR-RFLP技术,对3个品种346头猪NCOA1外显子和ADAMTS1基因的SNP位点G223A、T196C、T427C和ADAMTS1基因的SNP位点G72A进行群体遗传学分析;并用SPSS17.0分析这4个多态位点对猪繁殖性状的影响。主要研究结果如下:1. NCOA1基因遗传变异分析根据提取的猪基因组DNA构建DNA池,进行混合DNA池测序,发现在外显子3、8和12中存在可能的多态位点,分别设计引物,应用PCR-RFLP技术检测外显子3、8和12中的3个SNP位点分别为G223A、T196C和T427C。测序结果表明,这3个SNP位点分别为G/A、T/C和T/C突变,3个位点都有2个等位基因和3种基因型。遗传变异分析发现,G223A位点A是优势等位基因(0.509),优势基因型为AB型(0.624),该位点处于Hardy-Weinberg非平衡状态,多态信息含量(PIC)、杂合度(He)、有效等位基因数(Ne)分别为0.375、0.500、2.000,属于中度多态。T196C位点C是优势等位基因(0.626),优势基因型为CD型(0.460),该位点处于Hardy-Weinberg平衡状态,PIC、He、Ne分别为0.359、0.468、1.881,属于中度多态。T427C位点E是优势等位基因(0.652),优势基因型为EF型(0.517),该位点处于Hardy-Weinberg非平衡状态,PIC、He、Ne分别为0.351、0.454、1.831,属于中度多态。将检测到3个SNP位点与繁殖性能进行关联分析。结果显示:G223A位点各基因型间在总产仔数、产活仔数、出生窝重都表现差异极显着(p<0.01)。T196C位点CC型与CD型基因型间在总产仔数、产活仔数差异不显着(p>0.05),CC型和CD型与DD型差异极显着(p<0.01),出生窝重CC型与CD型差异显着(p<0.05),CC型和CD型与DD型差异极显着(p<0.01),21日龄窝重都表现差异极显着(p<0.01);T427C位点各基因型间在总产仔数、产活仔数差异极显着(p<0.01),出生窝重和21日龄窝重方面表现相同,均呈现EE型与EF型差异显着(p<0.05),与FF型差异极显着(p<0.01),EF型与FF型差异极显着(p<0.01)。2. ADAMTS1基因遗传变异分析在ADAMTS1基因的第7外显子多态位点的区域内设计引物用来扩增含有插入片度的一段序列,应用PCR-RFLP技术检测多态性位点G72A。测序结果表明该SNP位点是G/A突变,存在2个等位基因,3种基因型。遗传变异分析发现,G72A位点A是优势等位基因(0.633),优势基因型为AB型(0.457),该位点处于Hardy-Weinberg平衡状态,多态信息含量(PIC)、杂合度(He)、有效等位基因数(Ne)分别为0.357、0.465、1.868,属于中度多态。将该多态性位点与繁殖性状相关的生产数据进行关联分析。结果显示:G72A位点各基因型间在总产仔数和产活仔数均表现为AA型与AB型和BB型差异极显着(p<0.01),AB型和BB型差异不显着(p>0.05),出生窝重和21日龄窝重都表现为差异极显着(p<0.01)。3.根据单因素LSD法分析不同位点相同基因型以及对豫南黑猪、杜洛克猪和大约克夏猪繁殖相关性状分析得到:大约克夏猪在总产仔数、产活仔数、出生窝重和21日龄窝重与豫南黑猪和杜洛克猪两品种间整体呈现极显着(p<0.01),豫南黑猪和杜洛克猪在总产仔数、产活仔数和出生窝重整体差异不显着(p>0.05),在21日龄窝重差异极显着(p<0.01)。
张虎[8](2012)在《日粮纤维水平对母猪繁殖性能、生殖激素及受体mRNA表达的影响》文中提出为研究日粮粗纤维水平对母猪繁殖性能、生殖激素及组织中受体mRNA表达量的影响,试验选用30头胎次、配种时间及体况均相近的经产PIC配套系父母代母猪,按要求随机分成5组,每组三个重复,妊娠期间分别饲喂含3%、5%、7%、9%和11%的粗纤维日粮,通过调节各组的饲喂量,使其所摄入的能量、蛋白、钙、磷等基本一致。3%为对照组,日粮中不另加粗纤维。研究结果显示:1对母猪规避行为的影响日粮中添加粗纤维对母猪的一般行为和规避行为都有显着影响,以粗纤维含量为9%组效果最明显,比对照组的采食时间平均增加33.49%、饮水时间平均降低了1.52%、走动时间平均减少了24.92%,无食咀嚼行为发生的时间平均降低了54.80%、与围栏有关行为发生的时间平均降低了15.68%、犬坐行为发生的时间平均降低了37.45%。2对母猪繁殖性能的影响不同日粮纤维水平对母猪繁殖性能影响差异显着(P<0.05),其中,粗纤维含量为9%组显着优于对照组(P<0.05),提高母猪的繁殖性能效果最好,当粗纤维含量超过9%时呈下降趋势;在妊娠周期内,粗纤维含量9%组的背膘厚度和体况改变显着低于对照组(P<0.05),并低于其它各试验组,效果最显着。试验结果表明添加适宜比例的粗纤维能够降低繁殖母猪背标厚度的损失,减少哺乳期间母猪体重的流失,增加母猪的产仔数及断奶仔猪数,缩短了断奶再发情时间,提高了母猪的繁殖性能。3对母猪血液生化指标的影响提高日粮中粗纤维水平可以降低血清甘油三酯和总胆固醇含量,各试验组母猪的血液生化指标与对照组相比有不同程度的改变,当添加水平为9%时,显着优于其它试验组(P<0.05),为最佳添加组。4对母猪生殖激素的影响提高日粮中粗纤维水平可以增加各阶段孕酮和催乳素的含量,其中,当日粮中粗纤维含量达到9%时,效果最显着,当日粮粗纤维水平超过9%时,各实验指标均有所降低。5对受体mRNA表达量的影响胎衣组织中的ERmRNA表达量以11%粗纤维组最低,PRmRNA表达量以9%粗纤维组最高且各试验组均显着高于对照组,PRLRmRNA表达量以9%粗纤维组最高且各试验组均显着高于对照组。在日粮中添加粗纤维能够降低胎衣组织中ERmRNA的表达量,提高胎衣组织中PRmRNA和PRLRmRNA的表达量。
王怀禹[9](2010)在《猪雌激素受体(ESR)基因多态性与繁殖性能的关系》文中认为雌激素受体是一种配体激活转录因子家族中的核酸受体,具有转录调控蛋白质的功能,对动物的繁殖性能具有重要作用。雌激素广泛的生理作用必须通过雌激素受体介导才能发挥。综述了ESR基因的结构与定位,ESR的生物学功能,以及ESR基因多态性与猪繁殖性能的关系。
刘燕[10](2008)在《甘肃省猪种ESR和FSHβ基因多态性与繁殖性状的相关性研究》文中提出猪的繁殖性状是制约养猪生产效益的关键因素之一。目前,影响猪产仔数性状的数量性位点(QTL)已被定位于猪的8号染色体的连锁图上,为进一步应用位置克隆技术研究这些复杂的多基因性状的遗传机制奠定了基础。猪繁殖性状的遗传力非常低(h2<0.13),常规的育种技术对繁殖性状的遗传改良有限。在猪的高繁殖力特性研究中,现已证实雌激素受体基因和卵泡刺激素β亚基基因是两个影响猪产仔数的主效基因,可影响产仔数1~1.15头,但这两种基因的频率在外来猪品种和中国本地猪品种的分布却有较大差别。雌激素受体是母猪正常生殖周期所必须的物质,在第二性征发育和繁殖周期的维持及影响繁殖力方面起着关键的作用,并且直接影响胚胎着床前的发育和胚胎着床。促卵泡素(FSH)影响生长卵泡的数量,在促黄体素的协同作用下能激发卵泡的最后成熟,诱发排卵并使颗粒细胞变成黄体细胞。对雄性动物,促卵泡素的作用主要是促进生精上皮发育和精子形成。本实验把甘肃省现有的猪种长白猪、大约克、皮特兰、杜洛克、华特A系、华特B系、合作猪作为研究对象。试验动物共计300头,采样来源于甘肃省三个大型猪场。对影响猪的繁殖性状的两个候选基因雌激素受体基因(ESR)和促卵泡素β亚基基因(FSHβ)进行研究。利用PCR-RFLP、PCR-SSCP分析方法,采用最小二乘法拟合曲线模型进行突变位点的多态性与繁殖性状的关联性分析。以期通过对ESR基因中突变位点的检测和研究、FSHβ插入序列的结构的分析,以及其与繁殖性状的相关性分析,达到利用分子生物学技术与常规育种技术相结合对猪的繁殖性状进行选择从而获得较好的繁殖性状的目的。研究发现ESR基因第一外显子部分片段没有发现有多态现象,这一片段并不存在由突变形成的多态性。7个猪群中经遗传学分析均表现为中度多态(0.5>PIC>0.25)。华特A系、华特B系、长白猪、大约克、皮特兰、杜洛克6个群体中ESR基因A基因频率较高,FSHβ亚基基因B基因频率较高。而我国地方猪种合作猪则相反。ESR基因、FSHβ亚基基因各基因型以BB型具有高的产仔数,产仔数在不同的基因型间有BB>AB>AA的趋势。华特配套系表现出较高的繁殖生产成绩,因而有必要进行进一步的研究,合理保护利用这一优良的地方培育品种资源。
二、ESR基因型与青年母猪外周血液激素浓度的关系(论文开题报告)
(1)论文研究背景及目的
此处内容要求:
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例:
本文主要提出一款精简64位RISC处理器存储管理单元结构并详细分析其设计过程。在该MMU结构中,TLB采用叁个分离的TLB,TLB采用基于内容查找的相联存储器并行查找,支持粗粒度为64KB和细粒度为4KB两种页面大小,采用多级分层页表结构映射地址空间,并详细论述了四级页表转换过程,TLB结构组织等。该MMU结构将作为该处理器存储系统实现的一个重要组成部分。
(2)本文研究方法
调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
三、ESR基因型与青年母猪外周血液激素浓度的关系(论文提纲范文)
(1)视黄醇结合蛋白4对猪卵泡颗粒细胞功能的影响及其机制研究(论文提纲范文)
中文摘要 |
abstract |
英文缩略词表 |
前言 |
第一篇 文献综述 |
第1章 哺乳动物卵泡发育调控的研究进展 |
1.1 哺乳动物卵泡发育的特点 |
1.2 哺乳动物卵泡发育和闭锁的调控 |
1.3 颗粒细胞对哺乳动物卵泡发育和闭锁的影响 |
第2章 RBP4的研究进展 |
2.1 RBP蛋白简介 |
2.2 RBP基因简介 |
2.3 RBP4生物学功能 |
第3章 RBP4在动物繁殖中的研究进展 |
3.1 RBP4的基因多态性与母猪繁殖性能 |
3.2 RBP4在生殖系统中的表达和定位 |
3.3 RBP4与卵巢颗粒细胞 |
第二篇 研究内容 |
第1章 pLVX-RBP4慢病毒过表达载体的构建、包装和鉴定与si RNA干扰效果研究 |
1.1 材料 |
1.2 方法 |
1.3 结果 |
1.4 讨论 |
1.5 小结 |
第2章 RBP4对猪卵泡颗粒细胞凋亡和孕酮分泌的影响 |
2.1 材料 |
2.2 方法 |
2.3 结果 |
2.4 讨论 |
2.5 小结 |
第3章 RBP4调控猪卵泡颗粒细胞功能的分子机制解析 |
3.1 材料 |
3.2 方法 |
3.3 结果 |
3.4 讨论 |
3.5 小结 |
第4章 RBP4通过ERK1/2通路调控猪卵泡颗粒细胞凋亡和孕酮分泌的机制研究 |
4.1 材料 |
4.2 方法 |
4.3 结果 |
4.4 讨论 |
4.5 小结 |
结论 |
参考文献 |
导师简介 |
作者简介 |
攻读博士期间取得的科研成果 |
致谢 |
(2)整合eGWAS和eQTL分析绵羊全血转录组与繁殖激素的关联(论文提纲范文)
摘要 |
abstract |
1 引言 |
1.1 血液转录组的应用研究 |
1.1.1 预测疾病生物标记物 |
1.1.2 鉴定免疫调控因子 |
1.1.3 家畜生产管理中的应用 |
1.2 绵羊繁殖转录组研究进展 |
1.2.1 巴美肉羊概况 |
1.2.2 基于性腺轴的研究进展 |
1.2.3 可变剪接与单核苷酸多态性的调控研究 |
1.3 绵羊产羔与排卵的调节机制 |
1.3.1 BMP15、GDF9 对排卵和产羔数的调节 |
1.3.2 FSH、LH对排卵和产羔数的调节 |
1.4 研究的主要内容 |
1.5 研究目的与意义 |
2 研究一不同产羔类型绵羊血液转录组时序动态表达初探 |
2.1 材料与方法 |
2.1.1 试验材料 |
2.1.2 试验主要仪器与试剂 |
2.1.3 RNA提取 |
2.1.4 转录组文库构建与测序 |
2.1.5 测序数据质量评估和过滤去噪 |
2.1.6 参考序列比对与转录本检测定量分析 |
2.1.7 差异表达基因分析 |
2.1.8 差异可变剪接分析 |
2.1.9 差异表达基因与差异可变剪接的聚类分析 |
2.1.10 短时序表达分析 |
2.1.11 功能富集分析 |
2.1.12 统计显着性分析 |
2.2 结果与分析 |
2.2.1 绵羊产羔类型的差异表达基因分析 |
2.2.2 绵羊产羔类型差异可变剪接分析 |
2.2.3 绵羊产羔类型差异表达基因与差异可变剪接的聚类分析 |
2.2.4 绵羊转录组时序表达变化 |
2.2.5 绵羊转录组时序动态表达模块分析 |
2.2.6 绵羊转录组时序可变剪接变化 |
2.2.7 绵羊产羔类型与时序性表达的整合分析 |
2.2.8 试验重复性验证 |
2.3 讨论 |
2.4 结论 |
3 研究二大样本动态血液基因整合e GWAS解析绵羊繁殖激素共表达网络 |
3.1 材料与方法 |
3.1.1 试验材料 |
3.1.2 试验主要仪器与试剂 |
3.1.3 RNA 提取与建库测序 |
3.1.4 测度数据质量评估与过滤去噪 |
3.1.5 参考序列比对与转录本检测定量分析 |
3.1.6 血清LH、FSH、GDF9与BMP15 的浓度测定 |
3.1.7 加权基因共表达网络分析 |
3.1.8 eGWAS分析 |
3.1.9 基因功能注释与候选位点的确定 |
3.1.10 构建主题文献摘要与全文的绵羊GWAS数据库 |
3.1.11 机器学习验证分析 |
3.2 结果与分析 |
3.2.1 全局样本构建繁殖激素调控的共表达网络 |
3.2.2 基于表达的全基因组关联研究 |
3.2.3 产羔类型相关的模块 |
3.2.4 激素调控相关模块 |
3.2.5 产羔类型与月份之间的关联模块 |
3.2.6 绵羊GWAS数据库验证全局网络的功能属性 |
3.2.7 机器学习验证小样本产羔类型差异表达基因对于大样本的支持度 |
3.3 讨论 |
3.4 结论 |
4 研究三 LH/FSH 血清浓度比值的绵羊等位基因特异性表达与遗传关联研究 |
4.1 材料与方法 |
4.1.1 试验样品 |
4.1.2 试验主要仪器与设备 |
4.1.3 RNA提取 |
4.1.4 转录组文库构建与测序 |
4.1.5 测序数据质量评估与过滤去噪 |
4.1.6 参考序列比对与转录本检测定量分析 |
4.1.7 LH、FSH激素浓度的测定 |
4.1.8 差异表达基因分析 |
4.1.9 差异ASE分析 |
4.1.10 eQTL分析 |
4.1.11 功能富集分析 |
4.2 结果与分析 |
4.2.1 LH与FSH血清浓度相关性分析 |
4.2.2 LH/FSH比值在不同月份的方差分析 |
4.2.3 LH/FSH比值在不同月份的转录组差异分析 |
4.2.4 LH/FHS比值差异表达基因通路富集分析 |
4.2.5 ASE证实血液存在广泛的顺式调控影响 |
4.2.6 eQTL-SNP和 ASE-SNP联合分析 |
4.2.7 eQTL-SNP与 ASE-SNP富集分析 |
4.2.8 LH/FSH比值生物标志物的表达基因型 |
4.2.9 LH/FSH比值生物标志物的遗传调控网络 |
4.3 讨论 |
4.4 结论 |
5 研究四 GDF9、BMP15 血清浓度的绵羊等位基因特异性表达与遗传关联研究 |
5.1 材料与方法 |
5.1.1 试验样品 |
5.1.2 试验主要仪器与设备 |
5.1.3 RNA提取 |
5.1.4 转录组文库构建与测序 |
5.1.5 测序数据质量评估与过滤去噪 |
5.1.6 参考序列比对与转录本检测定量分析 |
5.1.7 血清GDF9、BMP15 激素浓度的测定 |
5.1.8 差异表达基因分析 |
5.1.9 差异ASE分析 |
5.1.10 eQTL分析 |
5.1.11 功能富集分析 |
5.2 结果与分析 |
5.2.1 不同GDF9 血清浓度的差异表达基因分析 |
5.2.2 不同GDF9 血清浓度的ASE分析 |
5.2.3 不同BMP15 血清浓度的差异表达基因分析 |
5.2.4 不同BMP15 血清浓度的ASE分析 |
5.2.5 GDF9与BMP15 的联合分析 |
5.3 讨论 |
5.4 结论 |
6 全文主要结论、创新点及展望 |
6.1 论文主要结论 |
6.2 论文创新点 |
6.3 论文未来研究展望 |
致谢 |
参考文献 |
附录 |
作者简介 |
(3)体况影响山羊卵泡发育的机制及哺乳期母仔一体化技术研究(论文提纲范文)
摘要 |
ABSTRACT |
缩略词 |
前言 |
第一部分 文献综述 |
第一章 哺乳动物卵泡发育的影响因素及调控机制 |
1 哺乳动物卵泡发育过程 |
1.1 卵泡发育 |
1.2 卵泡闭锁 |
2 哺乳动物卵泡发生波 |
2.1 卵泡的募集 |
2.2 卵泡的选择 |
2.3 卵泡的优势化 |
3 影响卵泡发育的因素 |
3.1 代谢激素和生长因子 |
3.2 下丘脑-垂体-卵巢轴生殖激素对卵泡发育和发情周期的调节 |
3.3 卵母细胞与体细胞间的互作对卵泡发育的影响 |
4 哺乳动物卵巢卵泡发育的基因调控机制研究进展 |
4.1 基因差异表达的研究手段概述 |
4.2 与卵巢卵泡发育相关的基因筛选研究进展 |
参考文献 |
第二章 体况对哺乳动物卵泡发育及繁殖力的影响研究进展 |
1 哺乳动物体况评分研究进展 |
1.1 牛的体况评分研究进展 |
1.2 猪的膘情评价的研究进展 |
1.3 羊的体况评分研究进展 |
1.4 人胖瘦评价方法 |
2 体况对动物繁殖性能的影响 |
3 营养水平对母畜繁殖和卵泡发育的影响 |
3.1 日粮能量水平对卵泡发育的影响 |
3.2 日粮中蛋白质对母畜卵泡发育和繁殖力的影响 |
4 精细化营养调控体况提高母畜年生产力的研究进展 |
4.1 母猪体况调整提高年生产力研究进展 |
4.2 奶牛体况调整方案 |
4.3 提高母羊年生产力的体况调整方案 |
参考文献 |
第二部分 试验研究 |
第三章 育成期海门山羊体况对生产性能及初情的影响 |
引言 |
1 材料与方法 |
1.1 试验动物 |
1.2 发情鉴定 |
1.3 屠宰测定及样品采集 |
1.4 测定指标 |
1.5 统计分析 |
2 结果与分析 |
2.1 山羊体况评分标准的优化 |
2.2 育成期山羊体况对血常规指标的影响 |
2.3 育成期山羊体况评分对脂代谢相关血清生化指标的影响 |
2.4 育成期山羊体况评分与屠宰性状的相关性分析 |
2.5 育成期山羊母羊体况评分对体尺指标的影响 |
2.6 育成期山羊母羊体况评分对初情指标的影响 |
2.7 育成期山羊体况对发情期卵泡数目的影响 |
2.8 育成期山羊体况对发情期血清生殖激素水平的影响 |
3 讨论 |
3.1 山羊体况评分标准的优化及与生产性能指标的相关性 |
3.2 育成期海门山羊体况对初情指标的影响 |
3.3 育成期海门山羊体况对卵泡发育的影响 |
3.4 育成期海门山羊体况对血液生化指标的影响 |
4 小结 |
参考文献 |
第四章 体况对海门山羊卵泡发育相关基因表达的影响研究 |
引言 |
1 材料与方法 |
1.1 试验仪器与试剂 |
1.2 样本采集 |
1.3 RNA-Seq文库的构建 |
1.4 基因表达量分析 |
1.5 基因的聚类 |
1.6 qRT-PCR验证 |
1.7 卵泡液的收集及激素测定 |
1.8 卵巢组织样品石蜡包埋与切片 |
1.9 卵巢免疫组化试验 |
1.10 数据统计分析 |
2 结果与分析 |
2.1 不同体况对发情山羊2.0-3.5 mm卵泡液中激素水平的影响 |
2.2 不同体况山羊卵泡转录组的Illumina测序及质量控制 |
2.3 不同体况山羊卵泡中表达的基因及差异表达基因数目及分布 |
2.4 不同体况山羊卵泡基因表达聚类分析 |
2.5 不同体况山羊卵泡中差异表达基因的GO富集分析 |
2.6 不同体况山羊卵泡中差异表达基因的KEGG富集分析 |
2.7 不同体况山羊卵泡中差异表达基因聚类分析 |
2.8 qRT-PCR验证 |
2.9 体况对山羊卵巢凋亡相关蛋白AIF-1定位和表达的影响 |
3 讨论 |
3.1 山羊体况对卵泡液中生殖激素及代谢激素的影响 |
3.2 山羊体况对卵泡发育相关信号通路的影响 |
3.3 山羊体况对卵泡发育关键基因差异表达的影响 |
3.4 体况对山羊卵巢凋亡相关蛋白AIF-1的影响 |
4 小结 |
参考文献 |
第五章 山羊有腔卵泡发育过程中的基因差异表达研究 |
引言 |
1 材料与方法 |
1.1 卵泡的收集 |
1.2 卵泡RNA的提取 |
1.3 cDNA测序文库的构建 |
1.4 RNA-Seq测序 |
1.5 山羊小、中、大卵泡中基因表达趋势分析 |
1.6 qRT-PCR验证 |
2 结果与分析 |
2.1 山羊不同直径卵泡的转录组建库质量评价 |
2.2 Reads过滤信息统计 |
2.3 山羊卵泡发育过程中的差异表达基因研究 |
2.4 山羊小、中、大卵泡中差异表达基因的GO功能富集分析 |
2.5 山羊小、中、大卵泡中差异表达基因的KEGG富集分析 |
2.6 山羊卵泡发育过程中的基因差异表达趋势研究 |
2.7 山羊卵泡发育过程中的关键差异表达基因验证 |
3 讨论 |
3.1 山羊不同直径卵泡差异表达基因数量比较 |
3.2 山羊卵泡发育过程涉及的信号通路 |
3.3 山羊有腔卵泡发育过程中与生殖激素相关的基因差异表达研究 |
3.4 山羊有腔卵泡发育过程中与细胞增殖相关的基因差异表达研究 |
4 小结 |
参考文献 |
第六章 补饲N-氨基甲酰谷氨酸对哺乳期山羊体况、泌乳及其羔羊生长性能的影响 |
引言 |
1 材料与方法 |
1.1 试验动物与试验设计 |
1.2 试验样品采集 |
1.3 血清和羊奶中代谢物和激素的测定 |
1.4 羔羊瘤胃、回肠组织形态学观察 |
1.5 数据统计分析 |
2 结果与分析 |
2.1 补饲NCG对哺乳期山羊体重及产奶量的影响 |
2.2 补饲NCG对哺乳山羊泌乳期第21d血清学指标和氨基酸谱的影响 |
2.3 补饲NCG对哺乳期母羊乳成分、多胺和氨基酸谱的影响 |
2.4 补饲NCG对哺乳期羔羊生长和屠宰性状的影响 |
2.5 补饲NCG对羔羊瘤胃乳头和回肠绒毛形态的影响 |
3 讨论 |
3.1 补饲NCG对哺乳山羊泌乳力、血清学参数和氨基酸谱的影响 |
3.2 母羊补饲NCG对羔羊瘤胃乳头和回肠绒毛形态的影响 |
4 小结 |
参考文献 |
全文结论 |
创新点 |
进一步研究的内容 |
攻读学位期间发表论文情况 |
致谢 |
(4)利用全基因组重测序鉴别法系大白猪的高产仔基因(论文提纲范文)
摘要 |
Abstract |
第一章 文献综述 |
1.1 研究背景 |
1.2 猪产仔性状的研究价值 |
1.3 影响猪产仔性状的生理机制 |
1.3.1 排卵数 |
1.3.2 受精率 |
1.3.3 胚胎着床率 |
1.3.4 子宫容积 |
1.3.5 胎盘效率 |
1.3.6 胚胎成活率 |
1.3.7 公猪精液品质 |
1.4 猪产仔性状遗传解析的研究进展 |
1.4.1 影响猪产仔性状的基因位点(QTL) |
1.4.2 影响猪产仔性状的候选基因 |
1.5 中国地方猪对西方商业品种产仔性状遗传改良的贡献 |
1.5.1 华南猪对西方商业品种产仔性状遗传改良的贡献 |
1.5.2 华东猪对西方商业品种产仔性状遗传改良的贡献 |
1.6 全基因组重测序在猪复杂性状遗传解析中的应用 |
1.6.1 新一代全基因组重测序技术及其原理 |
1.6.2 应用全基因组重测序技术解析猪复杂性状遗传机理的成功案例 |
1.7 本研究的目的与意义 |
第二章 研究正文 |
1 前言 |
2 材料与方法 |
2.1 实验动物 |
2.2 全基因组重测序 |
2.3 重测序数据质控及过滤 |
2.4 群体遗传学分析 |
2.4.1 主成分分析(Principal Component Analysis, PCA) |
2.4.2 Neighbor-joining(NJ)聚类树构建 |
2.4.3 TreeMix分析 |
2.4.4 群体结构(STRUCTURE)分析 |
2.5 群体间基因交流分析 |
2.5.1 rIBD分析 |
2.5.2 等位基因频率差异分析(血缘鉴定) |
2.5.3 单倍型热图分析 |
2.5.4 群体间遗传分化(Fst)分析 |
2.5.5 连锁不平衡(LD)抽样分析 |
2.5.6 单倍型网络(haplotype network)分析 |
2.6 选择信号分析 |
2.6.1 核苷酸差异(π)分析 |
2.6.2 基于单倍型的群体内选择分析(iHS) |
2.6.3 基于单倍型的群体间选择分析(XPEHH) |
2.7 古老单倍型分析 |
2.7.1 基因流(f D)分析 |
2.7.2 群体间核苷酸差异(Dxy)分析 |
2.7.3 等位基因频率差异 |
2.8 单倍型关联分析 |
3 结果与讨论 |
3.1 测序数据的准确度 |
3.1.1 测序深度及基因组覆盖度 |
3.1.2 SNP检出率 |
3.1.3 大白猪品系鉴定 |
3.2 群体遗传学分析揭示中西方猪种的遗传分化 |
3.3 法系大白猪中存在华东猪和华南猪血缘 |
3.3.1 rIBD分析揭示法系大白猪中存在华东猪和华南猪血缘 |
3.3.2 NJ聚类树、Fst和单倍型网络分析验证法系大白猪中存在华东猪和华南猪血缘 |
3.3.3 基因频率分析再次揭示法系大白猪中混有华南猪及华东猪的血缘 |
3.3.4 渗入片段长度揭示华东猪与华南猪血缘渗入法系大白猪的时间可能不同 |
3.4 KATNAL1 基因区域的深入分析 |
3.4.1 法系大白猪在KATNAL1 基因区域存在华东猪血缘渗入信号 |
3.4.2 NJ聚类树揭示法系大白猪与华东猪的部分KATNAL1 单倍型高度相似 |
3.4.3 Fst分析揭示法系大白猪与华东猪在KATNAL1 位点的遗传分化显着降低 |
3.4.4 单倍型网络分析进一步揭示华东猪的KATNAL1 单倍型导入了法系大白猪 |
3.4.5 LD分析提示法系大白猪中华东猪KATNAL1 单倍型可能受到了偏好选择 |
3.4.6 KATNAL1 位点在法系大白猪中受到选择 |
3.4.7 导入法系大白猪的华东猪KATNAL1 单倍型与产仔数显着关联 |
3.5 NAA35-GOLM1 基因区域的深入分析 |
3.5.1 法系大白猪在NAA35-GOLM1 基因区域存在华南猪血缘渗入信号 |
3.5.2 NJ聚类树揭示部分法系大白猪与华南猪在NAA35-GOLM1 基因区域的亲缘关系很近 |
3.5.3 Fst分析揭示法系大白猪与华南猪在NAA35-GOLM1 位点的遗传分化显着降低 |
3.5.4 单倍型网络分析进一步揭示华南猪的NAA35-GOLM1 单倍型导入了法系大白猪 |
3.5.5 LD分析提示导入法系大白猪中的NAA35-GOLM1 单倍型可能受到选择 |
3.5.6 NAA35-GOLM1 位点在法系大白猪中受到选择 |
3.5.7 导入法系大白猪的华南猪NAA35-GOLM1 单倍型与产仔数无关但可能与抗病力相关联 |
3.6 法系大白猪在16 号染色体区域存在华南猪血缘渗入信号 |
3.7 提高产仔数的AHR单倍型源自古老物种并先后被导入了中国地方猪和法系大白猪 |
3.7.1 rIBD分析证实中国家猪的AHR单倍型导入了大白猪 |
3.7.2 NJ聚类树和单倍型热图揭示华东猪和法系大白猪的部分AHR单倍型高度相似 |
3.7.3 单倍型网络分析表明AHR区域存在古老单倍型 |
3.7.4 基因频率差异分析提示中国地方猪AHR单倍型来源于另一个猪属物种 |
3.7.5 Dxy和f D分析再次验证AHR古老单倍型渗入了中国地方猪并高频率存在于华东猪中 |
3.7.6 LD分析表明法系大白猪的AHR古老单倍型受到了偏好选择 |
3.7.7 AHR古老单倍型在法系大白猪中受到强选择,且与产仔数显着关联 |
4 全文总结 |
参考文献 |
附录 |
附录1 作者简历 |
附录2 在读期间发表论文 |
致谢 |
(5)伊犁鹅繁殖规律及生殖激素调控的研究(论文提纲范文)
摘要 |
abstract |
第1章 绪论 |
1.1 伊犁鹅 |
1.2 影响雌鹅繁殖性能的因素 |
1.3 雌性禽类生殖系统的显微结构研究 |
1.4 本试验研究目的 |
1.5 技术路线图 |
第2章 伊犁鹅繁殖周期生殖激素变化及卵巢卵泡发育规律的研究 |
2.1 材料与方法 |
2.2 结果与分析 |
2.3 讨论 |
第3章 不同外源性激素处理对伊犁鹅就巢期生殖内分泌调控的研究 |
3.1 材料与方法 |
3.2 结果与分析 |
3.3 讨论 |
第4章 伊犁鹅繁殖性状相关基因多态性分析 |
4.1 材料与方法 |
4.2 结果与分析 |
4.3 讨论 |
第5章 结论 |
参考文献 |
附录 |
致谢 |
作者简介 |
(6)北极狐ESR和FSHR基因多态性、表达及其与产仔关系的研究(论文提纲范文)
摘要 |
Abstract |
1 引言 |
1.1 北极狐综述 |
1.1.1 北极狐的生物学特征 |
1.1.2 北极狐的经济学价值 |
1.1.3 我国北极狐发展历史 |
1.1.4 我国北极狐发展存在的问题 |
1.1.5 我国北极狐的育种现状 |
1.1.6 我国北极狐的育种方向 |
1.1.7 影响北极狐产仔性能的因素 |
1.2 分子标记概述 |
1.2.1 分子标记的概念 |
1.2.2 分子标记的种类 |
1.2.3 分子标记分析技术 |
1.3 激素与受体的关系 |
1.3.1 受体的类型 |
1.3.2 受体的功能 |
1.3.3 受体的特点 |
1.3.4 受体与激素作用机理 |
1.3.5 受体的调节 |
1.3.6 下丘脑-垂体-卵巢轴对动物生殖的影响 |
1.4 与产仔数有关的基因 |
1.4.1 促乳素受体基因 |
1.4.2 促卵泡素β亚基基因 |
1.4.3 雌激素受体基因 |
1.4.4 视黄醇结合蛋白4基因和视黄酸受体γ基因 |
1.5 雌激素受体基因研究进展 |
1.5.1 ESR基因的结构 |
1.5.2 ESR基因的功能 |
1.5.3 ESR基因的作用机理 |
1.5.4 ESR基因与产仔性能的关系 |
1.6 FSHR基因研究进展 |
1.6.1 FSH和FSHR的生物学功能 |
1.6.2 FSH和FSHR基因的结构 |
1.6.3 FSHR多态性与产仔数的关系 |
1.6.4 FSHR基因在卵巢中的表达调控 |
1.7 本研究的目的及意义 |
2 北极狐ESR和FSHR基因的克隆与序列分析 |
2.1 材料与方法 |
2.1.1 实验动物 |
2.1.2 主要试剂 |
2.1.3 主要设备 |
2.1.4 溶液的配制 |
2.1.5 分析软件及相关网站 |
2.1.6 实验方法 |
2.2 结果与分析 |
2.2.1 基因组DNA的提取 |
2.2.2 北极狐FSHR和ESR基因的PCR扩增结果 |
2.2.3 北极狐ESR和FSHR基因的测序结果 |
2.2.4 不同物种间ESR和FSHR基因编码的氨基酸序列同源性比较 |
2.2.5 北极狐ESR和FSHR基因的氨基酸组成分析 |
2.2.6 北极狐ESR和FSHR蛋白结构分析 |
2.3 讨论 |
2.3.1 北极狐ESR基因的克隆 |
2.3.2 北极狐ESR基因蛋白结构分析 |
2.3.3 ESR基因对繁殖性能的影响 |
2.3.4 北极狐FSHR基因的克隆 |
2.4 本章小结 |
3 FSHR基因和ESR基因多态性对北极狐产仔数的影响 |
3.1 材料与方法 |
3.1.1 实验动物 |
3.1.2 主要设备 |
3.1.3 主要试剂 |
3.1.4 溶液配制 |
3.1.5 实验方法 |
3.2 结果与分析 |
3.2.1 基因组DNA的提取结果 |
3.2.2 PCR扩增结果 |
3.2.3 FSHR基因扩增区PCR产物酶切结果 |
3.2.4 FSHR基因外显子10和ESR基因外显子1 PCR-SSCP电泳结果 |
3.2.5 FSHR基因外显子10和ESR基因外显子1扩增区的测序分析 |
3.2.6 FSHR和ESR基因多态位点的等位基因频率和基因型频率 |
3.2.7 FSHR和ESR基因多态性与产仔性状的相关性分析 |
3.3 讨论 |
3.3.1 胎次对北极狐产仔数的影响 |
3.3.2 FSHR基因5’端多态性与产仔数的相关性 |
3.3.3 FSHR基因外显子10多态性与产仔数的相关性 |
3.3.4 ESR基因多态性与产仔数的相关性 |
3.4 本章小结 |
4 北极狐FSHR、ESR基因变异对其表达量的影响 |
4.1 材料与方法 |
4.1.1 实验动物 |
4.1.2 主要设备 |
4.1.3 主要试剂 |
4.1.4 溶液配制 |
4.1.5 实验方法 |
4.2 结果与分析 |
4.2.1 总RNA的提取结果 |
4.2.2 FSHR基因和ESR基因PCR扩增的结果 |
4.2.3 循环数确定的结果 |
4.2.4 目的基因和内参基因的标准曲线 |
4.2.5 北极狐卵巢中FSHR基因和ESR基因的表达 |
4.2.6 FSHR、ESR基因表达量与产仔数的相关性分析 |
4.3 讨论 |
4.3.1 FSH和FSHR的相互调节对产仔数的影响 |
4.3.2 FSHR基因不同基因型与卵巢mRNA表达量的相关性 |
4.3.3 左右卵巢差异对FSHR基因表达量的影响 |
4.3.4 ESR基因不同基因型与卵巢mRNA表达量的相关性 |
4.3.5 生殖激素受体调节对卵巢功能的影响 |
4.4 本章小结 |
5 北极狐发情周期中卵巢内FSHR的定位及表达规律 |
5.1 材料与方法 |
5.1.1 实验动物 |
5.1.2 主要试剂 |
5.1.3. 主要仪器 |
5.1.4 溶液配制 |
5.1.5 实验方法 |
5.2 结果与分析 |
5.2.1 总RNA提取结果 |
5.2.2 FSHR基因PCR扩增的结果 |
5.2.3 标准曲线及其目的基因的扩增效率 |
5.2.4 发情周期中FSHR mRNA在卵巢中的表达规律 |
5.2.5 FSHR免疫阳性细胞在卵巢中的定位 |
5.2.6 FSHR免疫阳性细胞在卵巢中的分布规律 |
5.3 讨论 |
5.3.1 FSHR mRNA在卵巢中的表达规律 |
5.3.2 卵巢中FSHR mRNA表达量与产仔数的相关性 |
5.3.3 卵巢中FSHR表达对卵泡发育的影响 |
5.3.4 FSHR对卵巢功能的影响 |
5.4 本章小结 |
结论 |
参考文献 |
攻读博士学位期间发表的学术论文 |
致谢 |
(7)猪NCOA1基因和ADAMTS1基因多态性及其与繁殖性状相关性分析(论文提纲范文)
致谢 |
摘要 |
Abstract |
1 文献综述 |
1.1 猪繁殖性能相关的候选基因的研究 |
1.1.1 催乳素受体(Prolactin receptor)基因 |
1.1.2 雌激素受体(Estrogen receptor,ESR)基因 |
1.1.3 促卵泡素(Follicle stimulating hormone,FSH)β亚基基因 |
1.1.4 视黄醇结合蛋白 4(Retinol-binding protein,RBP4)基因 |
1.1.5 其他候选基因 |
1.2 核受体辅激活蛋白 1 基因(Nuclear receptor co-activator1 gene,NCOA1)的研究进展 |
1.2.1 核受体辅激活蛋白 1(NCOA1)基因概况 |
1.2.2 核受体的结构和功能 |
1.2.3 核受体与辅调节因子 |
1.2.4 核受体辅激活蛋白及其作用机制 |
1.2.5 核受体辅激活蛋白的生物学特性 |
1.2.6 NCOA1 基因与猪繁殖性状的研究动态 |
1.3 含凝血酶敏感蛋白模体的去解联金属蛋白酶 1(ADAMTS1)基因研究 |
1.3.1 含凝血酶敏感蛋白模体的去解联金属蛋白酶 |
1.3.2 ADAMTS1 基因及其蛋白质的结构特征和功能 |
1.3.3 ADAMTS1 在排卵过程中的作用 |
1.3.4 ADAMTS1 在卵巢中的表达与调控 |
1.3.5 含凝血酶敏感蛋白模体的去解联金属蛋白酶对猪产仔性状的影响 |
1.4 研究目的与意义 |
2 引言 |
2.1 豫南黑猪 |
2.1.1 豫南黑猪育种素材 |
2.1.2 豫南黑猪培育背景 |
2.1.3 豫南黑猪培育过程 |
2.2 杜洛克猪 |
2.2.1 杜洛克猪的产地及育成史 |
2.2.2 杜洛克猪品种特征特点 |
2.2.3 杜洛克猪杂交利用 |
2.3 约克夏猪 |
2.3.1 约克夏猪产地及育成史 |
2.3.2 约克夏猪特征特性 |
2.3.3 约克夏猪杂交利用 |
2.4 选猪品种的意义 |
2.5 核受体辅激活蛋白 1 基因和含凝血酶敏感蛋白模体的去解联金属蛋白酶的关系 |
3 豫南黑猪、杜洛克猪和大约克夏猪核受体辅激活蛋白 1 基因(NCOA1)的多态性与繁殖性能的关联性分析 |
3.1 材料与方法 |
3.1.1 材料 |
3.1.2 仪器与试剂 |
3.1.3 溶液配制 |
3.1.4 试验方法 |
3.2 结果与分析 |
3.2.1 猪 NCOA1 基因 SNP 位点 PCR 扩增结果 |
3.2.2 猪 NCOA1 基因 SNP 位点 PCR-RFLP 分型及测序 |
3.2.3 猪 NCOA1 基因 SNP 的遗传特征分析 |
3.3 讨论 |
3.3.1 SNP 位点在群体内的遗传变异分析 |
3.3.2 猪 NCOA1 基因外显子多态性与繁殖性状的关系 |
3.4 小结 |
4 豫南黑猪、杜洛克猪和大约克夏猪 ADAMTS1 基因多态性与繁殖性能关联性分析 |
4.1 材料与方法 |
4.1.1 材料 |
4.1.2 方法 |
4.1.3 统计分析 |
4.2 结果与分析 |
4.2.1 PCR 扩增结果 |
4.2.2 猪 ADAMTS1 基因 SNP 位点 PCR-RFLP 分型及测序 |
4.2.3 猪 ADAMTS1 基因 SNP 的遗传特征分析 |
4.3 讨论 |
4.3.1 SNP 位点在群体内的遗传变异分析 |
4.3.2 猪 ADAMTS1 基因多态性与繁殖性状的关系 |
4.4 小结 |
研究展望 |
参考文献 |
作者简介 |
(8)日粮纤维水平对母猪繁殖性能、生殖激素及受体mRNA表达的影响(论文提纲范文)
摘要 |
Abstract |
第一章 文献综述 |
1.1 日粮纤维的概念及理化特性 |
1.2 日粮纤维的营养生理作用 |
1.3 国内外有关母猪对日粮纤维利用情况的概述 |
1.4 国内外研究中存在的问题 |
1.5 论文总体研究思路 |
第二章 日粮纤维水平对妊娠母猪行为的影响 |
2.1 材料与方法 |
2.2 实验结果与分析 |
2.3 讨论 |
2.4 小结 |
第三章 日粮纤维水平对妊娠母猪繁殖性能的影响 |
3.1 材料与方法 |
3.2 实验结果与分析 |
3.3 讨论 |
3.4 小结 |
第四章 日粮纤维水平对妊娠母猪血液生化指标及生殖激素的影响 |
4.1 材料与方法 |
4.2 实验结果与分析 |
4.3 讨论 |
4.4 小结 |
第五章 日粮纤维水平对妊娠母猪生殖激素受体 MRNA 表达量的影响 |
5.1 材料与方法 |
5.2 实验结果与分析 |
5.3 讨论 |
5.4 小结 |
第六章 论文总体结论与展望 |
6.1 论文总体结论 |
6.2 本论文创新点 |
6.3 开展进一步研究的建议 |
致谢 |
参考文献 |
附录1 |
附录2 |
作者简历 |
(9)猪雌激素受体(ESR)基因多态性与繁殖性能的关系(论文提纲范文)
1 ESR基因的结构与定位 |
1.1 ESR的分子结构 |
1.2 ESR基因的染色体定位 |
2 ESR的生物学功能 |
3 ESR基因多态性与猪繁殖性能的相关性研究 |
3.1 ESR基因多态性对猪血清激素浓度变化的影响 |
3.2 ESR基因多态性与母猪乳头数的关系 |
3.3 ESR基因多态性与猪产仔数的关系 |
3.4 ESR基因和其他基因的互作与猪产仔数的关系 |
4 问题与展望 |
(10)甘肃省猪种ESR和FSHβ基因多态性与繁殖性状的相关性研究(论文提纲范文)
摘要 |
Summary |
第一章 文献综述 |
1 甘肃省猪种 |
1.1 华特配套系 |
1.2 合作猪 |
1.3 大约克夏猪 |
1.4 长白猪 |
1.5 皮特兰猪 |
1.6 杜洛克猪 |
2 猪繁殖性状相关的部分基因的研究进展 |
2.1 雌激素受体基因(Estrogen Receptor,ESR) |
2.1.1 ESR 基因的结构 |
2.1.2 ESR 基因的生物学作用 |
2.1.3 ESR 基因对繁殖性能影响的研究情况 |
2.2 卵泡刺激素基因(Follicle-Stimulating Hormone,FSH) |
2.2.1 FSH 基因的结构 |
2.2.2 FSH 基因的生物学作用 |
2.2.3 FSH 基因对繁殖性能影响的研究情况 |
2.3 催乳素受体(PRLP)基因 |
2.4 视黄醇结合蛋白4 基因(RBP4) |
2.5 骨桥蛋白基因(OPN) |
2.6 褪黑素受体基因(IA gene) |
3 分子标记的研究进展 |
3.1 随机扩增多态性DNA(Random Amplified Polymorphic DNA,RAPD) |
3.2 限制性片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP) |
3.3 扩增片段长度多态性(Amplified Fragment Length Polymorphism,AFLP) |
3.4 小卫星和微卫星DNA 标记 |
3.5 单链构象多态性(Single Strand Conformation Polymorphism,SSCP) |
3.6 单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNPs) |
4 研究的目的及意义 |
第二章 材料与方法 |
1 试验材料 |
1.1 试验动物,采样方法,地点 |
1.2 仪器设备 |
1.3 试剂 |
1.4 实验地点 |
2 试验方法 |
2.1 试剂的配置 |
2.2 基因组DNA 的4 种制备方法 |
2.2.1 耳组织基因组DNA 的制备 |
2.2.2 血液基因组DNA 的制备 |
2.2.3 FTA 采样卡提取基因组DNA |
2.2.4 试剂盒提取基因组DNA |
2.3 基因组DNA 的电泳检测 |
2.3.1 琼脂糖凝胶电泳检测 |
2.3.2 DNA 纯度及浓度的检测 |
2.3.3 核酸分析仪检测 |
2.4 PCR 反应 |
2.4.1 PCR 扩增反应体系 |
2.4.2 PCR 产物检测 |
2.5 PCR 扩增产物的PCR-SSCP 分析及基因型判定 |
2.6 PCR 扩增产物的RFLP 分析及基因型判定 |
2.6.1 酶切反应组成 |
2.6.2 酶切产物的检测 |
3 统计分析方法 |
3.1 等位基因频率(Allele frequencies) |
3.2 遗传纯合度(Homozygosity)与杂合度(Heterozygosity) |
3.3 多态信息含量(Polymorphic Information Content,PIC) |
3.4 有效等位基因数 |
3.5 群体Hardy-Weinberg 平衡检验 |
3.6 基因效应统计分析 |
3.7 繁殖性状统计分析 |
第三章 结果与分析 |
1 基因组DNA 的提取结果 |
2 PCR 产物扩增检测结果 |
3 PCR 产物酶切检测结果 |
4 PCR 扩增产物的PCR-SSCP 分析检测结果 |
5 不同猪群基因型频率和基因频率分析 |
6 基因位点多态信息量(PIC)、纯合度(HO)、杂合度(HE)和有效等位基因数(NE)分析 |
7 ESR 基因和 FSHβ亚基基因多态性与繁殖性状的相关性分析 |
第四章 讨论 |
1 样本的数量 |
2 DNA 的提取 |
2.1 提取分析 |
2.2 常规酚-氯仿抽提法 |
2.3 FTA 采样卡提取DNA |
2.4 试剂盒提取 |
3 关于HARDY-WEINBERG 定律 |
4 ESR 基因和 FSHβ亚基基因多态性与繁殖性状的相关性分析 |
5 影响PCR 扩增反应的因素分析 |
5.1 模板质量 |
5.2 引物设计及其浓度 |
5.3 Mg2+浓度 |
5.4 dNTPs |
5.5 退火温度 |
5.6 影响PCR 扩增的其它因素 |
6 SSCP 分析方法的优化 |
6.1 凝胶的浓度 |
6.2 电泳条件 |
6.3 甘油浓度 |
7 染色和显色及其它方面的影响 |
7.1 染色和显色的影响 |
7.2 其它方面的影响 |
第五章 结论 |
参考文献 |
致谢 |
作者简介 |
导师简介 |
四、ESR基因型与青年母猪外周血液激素浓度的关系(论文参考文献)
- [1]视黄醇结合蛋白4对猪卵泡颗粒细胞功能的影响及其机制研究[D]. 赵云. 吉林大学, 2021(01)
- [2]整合eGWAS和eQTL分析绵羊全血转录组与繁殖激素的关联[D]. 孙燕勇. 内蒙古农业大学, 2021
- [3]体况影响山羊卵泡发育的机制及哺乳期母仔一体化技术研究[D]. 王子玉. 南京农业大学, 2019
- [4]利用全基因组重测序鉴别法系大白猪的高产仔基因[D]. 陈浩. 江西农业大学, 2018(05)
- [5]伊犁鹅繁殖规律及生殖激素调控的研究[D]. 程元. 新疆农业大学, 2017(02)
- [6]北极狐ESR和FSHR基因多态性、表达及其与产仔关系的研究[D]. 黄贺. 东北林业大学, 2013(02)
- [7]猪NCOA1基因和ADAMTS1基因多态性及其与繁殖性状相关性分析[D]. 郜军伟. 河南农业大学, 2012(06)
- [8]日粮纤维水平对母猪繁殖性能、生殖激素及受体mRNA表达的影响[D]. 张虎. 黑龙江八一农垦大学, 2012(09)
- [9]猪雌激素受体(ESR)基因多态性与繁殖性能的关系[J]. 王怀禹. 畜牧与兽医, 2010(11)
- [10]甘肃省猪种ESR和FSHβ基因多态性与繁殖性状的相关性研究[D]. 刘燕. 甘肃农业大学, 2008(09)