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九十年代我国经济发展的核心问题，是在经济高速增长的同时改善经济的整体素质，特别是优化产业结构。因此，必须不断调整和优化产业结构，以提高经济增长的质量。
一、我国产业结构调整中的难点
其一，价格信号扭曲，使得生产要素在部门和地区之间被错误导向。以工农业产品比价看，农产品价格偏低；从工业品内部比价看，能源、交通、原材料价格偏低。由于价格信号不能反映资源的稀缺程度，在企业和地方本位利益的驱动下，地方财政和预算外投资向“短、平、快”产业倾斜，致使中央政府的宏观倾斜政策失效。
其二，国家进行资产增量的能力较小，调整效果不明显。经过十几年的经济体制改革，投资主体和投资渠道出现了多元化的局面，与此同时，也存在着国家财力不足，国家预算内投资在投资总额中的比重持续下降的情况。事实上，在调整产业结构中出现这样两种现象：一方面中央努力从投资增量安排上去调整产业结构，另一方面由于本位利益驱动，许多地方把投资向回报高的加工业倾斜，致使国家难以对全社会固定资产投资规模和投资方向进行有效调节。
其三，资产存量的调整受到现行经济体制的约束，难度很大。近几年来尽管国家对企业进行了一系列放权改革，但企业受行政隶属关系的制约仍比较大，尤其是国有企业，其实际的利益主体也常常是某个部门、某个地方政府，它们既是生产资料的所有者，又是经济运行的指挥者，还掌握着企业各生产要素的控制权。正是由于这种产权格局，导致企业的资产长期处于一种凝固的状态，使生产要素在不同地区、不同部门、不同所有制之间的合理流动受到重重阻碍，存量资产的结构难以进行重组或调整，资源就不能优化配置。
其四，投资体制和企业经营机制的缺陷，也是产业结构调整一大困难。一是投资主体、产权关系、经济责任与风险承担不够明确，经常造成建设项目超概算，工期拖长，投资效益低下，延缓了结构调整的步伐。二是资金分散，降低了投资效益。对需要支持发展的产业，常有不同的资金来源渠道，但这些资金往往属于不同部门所有，难以集中使用，短期内难以形成生产能力。三是由于企业尚未真正成为自主经营、自负盈亏的商品生产者和经营者，不少企业仍然习惯依靠高能耗、高物耗来维持低效益运行，由此也影响到产业结构的调整，加剧了交通、能源、原材料等基础部门与产业的“瓶颈”效应。
二、运用证券市场促进产业结构调整的对策选择
由于证券融资具有直接性、及时性以及证券投资的风险性，它能较好地克服产业结构调整中存在的大部分难点：
1.加强证券市场的规范化建设，促进证券市场的发育与完善。目前，我国证券市场量的扩张较为迅速，但是还不是以对经济产生主导性作用，不足以担负起引导资金合理流向的重任。我国证券市场还处于成长、发育阶段。是从其规模和在整个经济生活中占的地位来看，都与国际证券市场有相当的差距，截至1993年末，我国的证券发行额只占全社会金融资产总额的11.3%，而美国和日本的证券发行额都超过该国银行贷款数的1倍以上。再从国际上常用的评价证券市场功能的两个指标看， 新发行证券总额占国内投资总额的比重：美国为37%，日本为41.4%，中国为8.5%。新发行证券总额占国民生产总值的比重：美国为12.4 %，日本为11.3%，中国为2.3%。 证券市场所筹集的资金除弥补财政赤字外，主要投入第二产业：在企业发行证券中，第二产业中的工业企业发行比重最大，其次是第三产业中的商业企业。利润比较低的能源、交通、原材料等基础产业，在证券市场上筹集资金都遇到了困难。这种现象表明，我国证券市场的发育与产业结构调整还没有达到理想的结合点。为此，必须在深化改革中加快证券市场的发育与完善。包括：（1 ）增加证券发行种类，扩大证券上市交易数量。（2 ）处理好发行市场与流通市场的关系，变过去依靠行政手段发行为社会自愿发行，放宽流通限制，加快资金周转速度。（3）建立健全证券市场管理法规， 保证证券交易的公正、公平与公开，与之相应的会计师制度，证券评级机构也应逐步建立与完善。
2.运用证券市场调整资产存量结构。资产存量结构调整一般可采取以下三种方式：（1）通过企业兼并或破产实现存量的调整。（2）企业之间通过参股、控股实现存量调整。（3 ）股份制企业可以通过跨行业、跨部门的多向经营和发展来实现存量调整。
目前，我国可适量出售国有大中型企业股份，就回收的资金用于国家急需发展的产业与部门，推动产业投资结构优化，改善国有资产存量结构。举例来说，在电价调整到合理水平之前，国家可以通过出售效益好的商业或加工业的国家股，收回资金用于能源开发。当电价上升，发电厂变为高效益企业时，又可出售电厂股份转而投资于其它基础产业与基础设施。
3.运用证券市场调整资产增量结构。健全的证券市场对投资者决策具有较强的影响力和约束力，使企业投资项目决策的随意性和盲目性大为减弱，从而促使产业结构的增量调整得以顺利进行。当前，针对因能源、交通等“瓶颈”制约而致使企业生产能力不能充分发挥的现状，可先让那些资金紧张、规模较大的经营性基础产业，如电力公司、能源和交通运输公司等较易回收投资的大中型企业发行上市股票，以改变这类企业增量不足，形不成规模经营，进而制约产业正常运转的恶性循环，从而带动整个其它企业结构的增量调整。
4.灵活运用证券融资，依据产业特点进行结构调整。目前，我国一些基础产业产品价低利小，加工工业产品价高利大的格局仍未有根本的改变。基础产业在证券市场的资金竞争中明显处于不利地位。针对这种不合理状况，应对基础产业分门别类，按其利润率大小和行业特点采取相应的筹集方式，求得最佳的投资组合。近期，可对利税较高的经营性基础产业，如资金利税率在13%以上的邮电、铁路、银行三个产业，以及高于或略低于工业平均资金利税率的钢铁、建材等原材料工业，推入市场筹资轨道，主要依靠商业贷款和发行股票、债券进行建设；对于环保、水利、林业、一部分道路工程等非经营性的基础产业，应主要以中央和地方财政资金加上少量政府债券来投资；而对于经营性的、利税率极低甚至亏损的基础产业，主要依靠国家政策性金融投资，一方面对其进行国家贴息贷款，另一方面可发行较大规模的由国家贴息的重点建设债券。
5.深化各方面的配套改革。证券市场的发展与完善，不能单方面盲目突进，应与目前社会经济系统中其它方面的改革配套进行。首先，实行政资分开，把政府的行政管理职能同国有资产所有权管理职能分开。在清理界定国有资产产权的基础上，将国有资产委托给国有资产管理机构，以保证国有资产的权益，实现资产的增值和盈利，国有资产管理机构派出产（股）权代表，参与企业发展规划和重要决策。政府行政部门不再直接管理企业，而是通过制定政策法规，运用经济杠杆间接调控全社会的经济运行。其次，改革企业的组织机制，少量非经营性的公益型国有骨干企业，由政府派出机构直接经营，以成本最小化为目标；对经营性的垄断行业，应加强公众监督，减少浪费，提高效率；对其它行业的小型企业，可实行租赁经营，大量的一般企业在理顺产权关系的基础上，逐步建成有限责任公司或股份公司。同时完善对证券投资的税收政策，合理引导资金流向，实现对不同产业的支持或限制。