鸡源致病性大肠杆菌1型菌毛pilA基因的PCR、克隆及序列分析

鸡源致病性大肠杆菌1型菌毛pilA基因的PCR、克隆及序列分析

叶如俊[1]2002年在《鸡源致病性大肠杆菌1型菌毛pilA基因的PCR、克隆及序列分析》文中研究表明1 型菌毛是鸡源致病性大肠杆菌的重要毒力因子,在致病过程中介导细菌吸附于鸡呼吸道粘膜上皮细胞完成入侵的第一步。本研究将从四川规模化鸡场分离鉴定、经1日龄雏鸡致病性试验得到的鸡源致病性大肠杆菌45株,采用D-甘露糖敏感血凝试验(MSHA)检测1型菌毛,根据GenBank中公布的人源大肠杆菌1型菌毛pilA基因序列设计一对引物用PCR扩增鸡源致病性大肠杆菌1型菌毛pilA基因。结果表明:运用MSHA法检测1型菌毛的检出率为80%(36/45),PCR法的检出率为95.5%(43/45),PCR方法用于1型菌毛的检测比MSHA更加敏感、快速、特异性强; 选择5株优势血清型鸡源致病性大肠杆菌代表株(O_(89),O_(119),O_(141),O_(127))的1型菌毛pilA基因的PCR扩增片段经纯化后,分别定向克隆到pUC18质粒的多克隆位点,构建了含有目的基因片段的克隆质粒,并转化到DH5α株大肠杆菌载体菌中,筛选获得阳性克隆菌株。对目的基因的序列测定结果表明,5个克隆片段均含有1型菌毛pilA基因的全序列,全长459bp,编码信号肽和结构蛋白。 在国内首次将5株分离于四川的鸡源致病性大肠杆菌1型菌毛pilA基因在国际基因库(GeneBank)中注册,基因序列号分别为:MS2-1:AY082805;LS3-1:AY082806;LS2-1:AY082807;HY1-2:AY082808;HY1-1:AY082809; 用生物软件(DNASTAR)对5株四川分离的鸡源致病性大肠杆菌菌株、GenBank中公布的人源大肠杆菌pSH2及文献报道的鸡源致病性大肠杆菌O1,O78,O88的1型菌毛pilA基因序列、氨基酸序列、菌毛蛋白质二级结构预测及抗原性进行了分析比较,结果显示:本研究分离的5株试验菌株与人源大肠杆菌1型菌毛pilA基因的同源率为89.8%-91.1%,氨基酸序列同源率为88.5%-91.8%;与文献报道的O_1,O_(78),O_(88)鸡大肠杆菌1型菌毛pilA基因核苷酸序列同源率为87.8%-90.2%,氨基酸序列同源率为84.6%-91.2%;鸡源致病性大肠杆菌1型菌毛间具有同源性,1型菌毛间存在一定的相同抗原位点。 本研究为鸡源致病性大肠杆菌菌毛基因工程疫苗的研究,制备核酸探针检测pilA基因提供了重要材料,对鸡大肠杆菌病的分子流行病学研究、诊断和防治研究具有重要意义。

叶如俊, 王红宁, 谭炳乾[2]2004年在《鸡源致病性大肠杆菌1型菌毛pilA基因的PCR扩增、克隆及序列分析》文中研究指明研究选择从四川规模化鸡场分离鉴定的5株优势血清型鸡源致病性大肠杆菌代表株(O89,O119,O141,O127)的1型菌毛pilA基因的PCR扩增片段分别定向克隆到pUC18质粒的多克隆位点,并转化到DH5α株大肠杆菌载体菌中,对目的基因的序列测定结果表明:5个克隆片段均含有1型菌毛pilA基因的全序列,全长459bp,编码信号肽和结构蛋白。用生物软件(DNASTAR)对9株大肠杆菌1型菌毛pilA基因序列、氨基酸序列、菌毛蛋白质二级结构预测及抗原性进行了分析比较,结果显示:鸡源致病性大肠杆菌1型菌毛间具有同源性,1型菌毛间存在一定的相同抗原位点。

冯秀丽[3]2005年在《抗鸡大肠杆菌的1型菌毛的单克隆抗体的研究和pilA基因的融合表达及其重组菌毛蛋白免疫原性研究》文中研究指明1,提取JM10大肠杆菌菌毛,经12%的聚丙烯酰胺凝胶电泳.切取菌毛蛋白条带制成油乳剂抗原,免疫BALB/c小鼠,取其脾细胞与小鼠骨髓瘤细胞融合,经间接ELISA筛选获得2株能稳定分泌针对1型菌毛的单克隆抗体杂交瘤细胞株。单抗阻断甘露糖敏感血凝试验和Westernblot试验证明,这两株单抗都是1型菌毛特异的。这2株单抗的直接凝集价分别为2~5~2~6、2~8~2~9,ELISA效价分别为10~3、10~4~10~5。应用这2株单抗对46株带1型菌毛的禽病原性大肠杆菌优势血清型分离株进行了检测,单抗可以快速,简便的鉴定致病性的分离株,同时还可为后来的抗原性检测试验提供标准菌毛抗体。 2.根据人大肠杆菌的pilA序列设计一对引物,从基因组中扩增大小为551bp目的基因pilA,定向克隆到T载体质粒,测序,然后克隆到表达载体pET-32a(+)中。阳性重组质粒转化至BL21(DE3)中,经IPTG诱导,SDS-PAGE检测,接着,对此重组菌株的表达条件从表达的情况、表达时间、IPTG的浓度等各方面进行优化.从而确立高效表达的条件。利用镍柱,提纯JM10菌株1型菌毛结构基因的重组蛋白。通过间接ELISA和Western-blot方法,与相应的单抗4D3和相关血清型O_(78)的单抗和血清型O_(18)的多价抗血清反应,试验结果证实该重组pilA基因重组蛋白具有菌毛蛋白的抗原性,存在交叉反应,进一步的说,1型菌毛之间存在相同的抗原位点,有一定的相关性。 3.将提纯的重组蛋白和天然菌毛疫苗免疫小鸡,第叁周,用同源致病性菌株气囊攻毒。同时设立非免疫鸡只攻毒对照,和非免疫非攻毒对照。观察鸡只的情况。攻毒4日后,非免疫攻毒组87.5%死亡。重组菌毛免疫组死亡率为25%,天然菌毛免疫组死亡率仅为12.5%,而天然菌毛疫苗的保护率高达87.5%。所有试验组鸡群剖解,从肝、心和气囊等部位观察机体的病理变化,免疫攻毒的两组鸡群且在肝脏、心包、气囊的病变比未免疫鸡显着轻微,重组菌毛免疫组比天然菌毛免疫组症状显着。从而说明,重组蛋白具有免疫保护作用。重组菌毛疫苗的保护力比天然菌毛疫苗低。

于学辉[4]2008年在《鸭致病性E.coli外膜蛋白及相关毒力基因和新血清型发现及病原特性研究》文中提出大肠杆菌(Escherichia coli,E.coli)是正常肠道菌群的组成部分,一些特殊血清型的E.coli对人和动物有病原性,动物的E.coli常常通过食物链的途径对人类健康造成严重的危害。随着集约化养殖的普及,鸭致病性E.coli对养鸭业的危害和导致的经济损失日益严重,已成为目前危害养鸭业最严重的传染病之一。现有禽病原性大肠杆菌(Avian Pathogenic Escherichia coli,APEC)的研究资料绝大多数来源于鸡,到目前为止,缺乏鸭源E.coli病原特性的系统研究。本研究旨在对我国西南地区规模化养鸭场鸭大肠杆菌病的致病性E.coli进行分离和血清型鉴定、了解鸭源致病性E.col外膜蛋白型(outer membrane protein patterns,OMP型)特征和相关毒力基因携带情况,对发现的一株致鸭腿水肿为特征的O46分离株的病原特性进行了系统研究,为阐明鸭源致病性E.col的致病机理和该病的防制提供科学数据。1.规模化养鸭场鸭源致病性大肠杆菌的分离鉴定及病原特性和系统发育学分析从我国四川、重庆、云南3个省(市)规模化养鸭场患典型大肠杆菌败血症雏鸭分离的282株致病性E.coli(临床分离株),通过玻板凝集和试管凝集试验,测定出210个分离株的血清型,占分离株的74.45%,分离株覆盖了37个血清型,其中O93、O78、O92、O76占43.8%(96/210)为优势血清型,O46、O32&O93混合型、O60&O93混合型为首次从鸭群中分离到。35株临床健康雏鸭泄殖腔分离的E.coli(泄殖腔分离株)鉴定出28株(包含14种血清型),其中O109和O154占46.4%为优势血清型。对207个临床分离株进行了药敏试验,在所选的29种抗生素中,鸭大肠杆菌?分离株耐药性非常严重,平均耐药率28.83%,以多重耐药为主,耐10~18种药物的菌株占59.4%。选取82个分离株(37个血清型,其中优势血清型各选8株共32株,其他血清型50株)进行致病性试验,以每株0.2ml(10~9CUF/ml)腿部肌肉接种7日龄鸭,确定出高致病株、中等致病株和低致病株分别占受试菌株的80.5%(66/82)、17.1%(14/82)和2.4%(2/82),四个优势血清型均为高、中致病株分别占受试菌株的84.4%(27/32)、15.6%(5/32)。根据16SrRNA基因的序列同源性,对14个鸭致病性E.coli代表株进行系统发育分析,结果显示:14个代表株形成2个主要分枝,3株鸭致病性E.coli单独形成一个较远的分支:11株鸭致病性E.coli与人及其他动物源E.coli形成一个大的分支,6株与人的O157亲缘关系近,其中有2株与O157sakai聚为一支;另外5株与猪、牛、禽和人源E.coliK12亲缘关系近,同时还发现O血清型与菌株的亲缘关系无直接联系。2.鸭源致病性大肠杆菌外膜蛋白型测定了130株(34个血清型)鸭E.coli临床分离株外膜蛋型(OMP型),其中O93等优势血清型53株,O46等30个其他血清型77株,这些分离株共产生了4个OMP型,其中OMP-1型81株,占62.3%(81/130),覆盖O93、O92、O78和O76等29个血清型,为主要OMP型;根据GenBank中大肠杆菌K-12外膜蛋白A基因(ompA)的核苷酸序列设计引物,对9株优势血清型和1株O46血清型分离株的ompA进行克隆、序列测定和分析,发现优势血清型9个菌株的ompA开放性阅读框(ORF)长1053bp,编码由350个氨基酸组成的前外膜蛋白A(pro-OmpA),前21个氨基酸残基组成信号肽,成熟的OmpA由329个氨基酸残基组成;O46分离株的开放性阅读框全长1041bp,在400bp~411bp的地方缺失了12个碱基,成熟的OmpA由325个氨基酸残基组成;10个分离株的ompA序列其核苷酸序列高度同源,达95.8%~100%。对10个分离株ompA进行系统发育分析,O46分离株单独聚为一支,其他9个分离株聚为一支;菌株血清型、外膜蛋白型与ompA的亲缘关系无直接联系。3.鸭源致病性大肠杆菌相关毒力基因分析应用PCR结合核酸序列测定对210株临床分离株和28株泄殖腔分离株进行包括强毒力岛(HPI)中的鼠疫菌素受体基因(fyuA)和铁调节蛋基因(irp2)、I型菌毛必须蛋白基因(fimC)、P型菌毛结构基因(papA)和血清耐受基因(iss)进行检测,结果表明:fyuA、irp2、fimC、papA和iss在临床分离株的携带率分别为41.0%、43.3%、92.9%、97.6%和96.7%,在泄殖腔分离株的携带率分别为21.4%、25.0%、92.9%、100%和92.9%,临床分离株和泄殖腔分离株Iss、I型菌毛和P型菌毛基因携带率差异不显着(P>0.05),但P型菌毛基因的携带率均显着高于其他宿主(鸡、猪和人)源E.coli;HPI毒力岛在鸭源E.coli中分布较广,其携带率表现为临床分离株极显着高于泄殖腔分离株。HPI毒力岛的携带率与菌株的致病性呈明显的正相关,与O78等特定的血清型有一定的关系。临床分离株有37.6%(79/210)同时携带fyuA、irp2、fimC、iss和papA基因,极显着高于泄殖腔分离株14.3%(4/28)(P<0.01)。4.鸭源致病性大肠杆菌志贺毒素相关基因分子流行病学根据GenBank中编码大肠杆菌stx1(志贺毒素1基因)、stx2(志贺毒素2基因)、hlyA(溶血素基因)和eaeA(黏附素基因)的特异性序列,设计合成4对引物,建立了快速鉴定产志贺毒素大肠杆菌(STEC)多重PCR方法。该方法能直接特异性鉴定多种毒力因子,检测敏感度细菌纯培养物为10~3CFU/ml。用此方法结合核酸序列测定对210株临床分离株和28株泄殖腔分离株进行相关基因检测,结果表明:临床分离株有6株具有six1序列、4株具有hlyA序列、1株具有eaeA序列;stx1、hlyA和eaeA阳性率分别为2.85%(6/210)、1.90%(4/210)和0.47%(1/210);5株基因型为stx1~+,3株基因型为hlyA~+,1株基因型为stx1~++hlyA~++eaeA~+,分别为2.38%(5/210)、1.43%(3/210)和0.47%(1/210);临床分离株stx2均为阴性。泄殖腔分离株未检出这4种基因。对所有阳性基因进行序列测定及分析,hlyA与GenBank中提供的EHECO157:H7 Sakai株序列的同源性为100%,stx1和eaeA与O157:H7 Sakai株序列高度同源。在发病鸭中发现并分离到O158、O60、O78、O36、O77、O46、O137和O192(携带stx1、hlyA、eaeA)的非-O157的STEC菌株,具有重要的公共卫生学意义。5.一株致鸭腿水肿为特征的O46大肠杆菌的发现及其实验病理模型建立从临床急性死亡,以腿水肿为特征的病鸭群中分离的SYW004株,通过形态学、培养特性、生化特征的研究和血清型鉴定,确定为大肠杆菌O46血清型;16S rRNA基因序列分析表明,该分离株与人源志贺氏菌及大肠杆菌O157:H7的亲缘关系最近,序列同源性为99%~99.5%,而和鸡源E.coli亲缘关系较远;对hlyA等9种毒力基因检测表明,O46分离株携带hlyA、fyuA、irp2、fimC、papA和泌六种毒力基因,是一株携带多种毒力基因的出血性大肠杆菌(EHEC);该分离株对雏鸭具有高致病性,实验病理模型能复制出与自然感染相同的病例,组织病理学检查表明,肝脏、肺脏、心脏、肾脏、肠道和脑等器官出现不同程度的组织细胞变性、坏死和大面积淤血、出血;超薄切片电镜观察可在心脏、肺脏、脾脏、肝脏和小肠中观察到大肠杆菌,其侵害的主要靶细胞包括淋巴细胞、巨噬细胞、肠道上皮细胞、心肌纤维细胞。超微结构变化最早发生于心脏、肝脏和肠道,各种细胞的变化主要为肿胀、坏死,染色质凝聚,线粒体肿胀,嵴断裂、扭曲变形,心肌肌原纤维间距增宽、溶解断裂,肠腺上皮细胞肿胀,微绒毛脱落、固有层充血出血。6.鸭源致病性大肠杆菌O46分离株对人工感染鸭的侵染规律为了观察O46分离株在人工感染鸭体内的分布,以O46定型血清建立免疫组化方法,应用建立的方法对O46分离株人工感染雏鸭的不同时间的不同组织器官进行观察。结果显示:免疫组化的方法只对大肠杆菌O46感染致死鸭的肝脏、脾脏、肾脏呈现阳性反应而与大肠杆菌O78、鸭瘟、鸭源禽流感、鸭疫里默氏杆菌、沙门氏菌、多杀性巴氏杆菌感染致死鸭的肝组织呈现阴性反应,具有直观、敏感、特异性强的优点,能够进行精确抗原定位;实验结果还表明,O46分离株能在鸭体内进行大面积的侵嗜,心脏、肺脏、脾脏、肾脏和肠道是感染的主要靶器官,阳性信号最早出现于心脏,气管未检测到细菌抗原。我们的实验数据可以为大肠杆菌O46分离株在体内分布和复制提供重要的证据,同时可以为O46分离株感染的致病机制提供一定的知识。

参考文献:

[1]. 鸡源致病性大肠杆菌1型菌毛pilA基因的PCR、克隆及序列分析[D]. 叶如俊. 四川农业大学. 2002

[2]. 鸡源致病性大肠杆菌1型菌毛pilA基因的PCR扩增、克隆及序列分析[J]. 叶如俊, 王红宁, 谭炳乾. 畜牧兽医学报. 2004

[3]. 抗鸡大肠杆菌的1型菌毛的单克隆抗体的研究和pilA基因的融合表达及其重组菌毛蛋白免疫原性研究[D]. 冯秀丽. 南京农业大学. 2005

[4]. 鸭致病性E.coli外膜蛋白及相关毒力基因和新血清型发现及病原特性研究[D]. 于学辉. 四川农业大学. 2008

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