“DNA粗提鉴定”实验优化与研究_dna提取论文

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      “DNA的粗提取与鉴定”是高中生物学中分子生物学的实验,安排在人教版《选修1·生物技术实践》的“DNA和蛋白质技术”的专题5中。根据教材的介绍,该实验的材料可以选择动物材料(如鸡血),也可以选择植物材料(如菜花、洋葱等)。实践表明:鸡血取材不方便、成本高、实验操作步骤多、耗时长,且成功率低;菜花含水量少、细胞破裂情况及DNA溶出量少[1];洋葱有刺激性气味,学生操作时眼睛难以睁开,且在实验中不易研磨[2]。因此,选择一种合适的实验材料显得十分重要。另外,高中实验受条件限制(如无EDTA、Tris和离心设备,氯仿-异戊醇具有毒性等),如何在普通高中实验室条件下做好这个实验,一直是不少中学教师研究的重点。

      笔者查阅大量资料,并利用校本课程时间分别采用香蕉和人体口腔上皮细胞进行“DNA的粗提取与鉴定”实验并进行优化,收到了良好教学效果,可以让更多的学生从简单材料中提取DNA,增加了学生的感性认识,提高了学生的动手能力。

      一、香蕉DNA的粗提取与鉴定

      1.制取香蕉研磨液

      ①取一段约2cm长的去皮香蕉,剪碎置于研钵中。

      ②加入10mL温水、2g食盐,研磨5min~10min。

      ③用单层纱布过滤研磨液,并收集于小烧杯中。

      2.粗提取DNA

      ①向装有香蕉研磨液的烧杯中加入2mL洗手液,按一定方向轻摇5min。

      ②沿玻璃棒从杯壁缓慢加入两倍体积的95%的冰酒精。

      ③静置5min后,有白色絮状物漂浮于上层(见图1)。

      ①取两支试管,分别编为1号和2号,各加入2mol/L的氯化钠溶液3mL。

      ②用木筷子缓缓卷起所得上层漂浮白色絮状物(见图2)放入2号试管,搅拌使其充分溶解。

      ③分别向两支试管中加入4mL二苯胺试剂。

      ④混合均匀后在沸水浴中加热5min~10min,并冷却一段时间,观察颜色的变化。

      

      4.结果及说明

      为了减少DNA的损失,粗提取DNA时采用了木筷子倾斜引流和挑出沉淀物。在加入2倍体积95%冰酒精时,立即产生大量白色絮状沉淀,效果相当明显。且这些白色絮状沉淀,能溶解于2mol/L的氯化钠溶液,说明其中含有DNA。但鉴定DNA时,试管中出现的颜色并非蓝色而是浅蓝色,说明含DNA量较少、纯度较低,可能还含有蛋白质等杂质。学生提议用双缩脲去鉴定白色絮状物,果然呈紫色。如何提取到更多的DNA,并去除滤液中的杂质,获取较为纯净的DNA呢?学生提出问题,并根据教材尝试优化结果方案。

      二、香蕉DNA的粗提取与鉴定优化方案

      优化方案中首先将洗手液加入的时间改为研磨中。由于洗手液中含有SDS(十二烷基磺酸钠),能够裂解细胞膜,使蛋白质变性,利于蛋白质和DNA的分离。如果在研磨时加入适量的洗手液,既促进DNA释放,又有助于DNA提取。另外根据DNA和蛋白质在高温和酶处理时耐受力的差别,尝试在粗提取液中加入含蛋白酶的嫩肉粉,并在55℃~60℃(嫩肉粉中木瓜蛋白酶最适温度)处理10min~15min,不仅使蛋白质被分解,且高温能使部分蛋白质变性,达到纯化DNA提取物的效果。

      1.制取香蕉研磨液

      ①取一段约2cm长的去皮香蕉,剪碎置于研钵中。

      ②加入10mL温水、2g食盐和2mL洗手液,研磨5min~10min。

      ③用单层纱布过滤研磨液,滤液于小烧杯中。

      2.粗提取DNA

      ①向滤液中加入2g嫩肉粉,轻摇小烧杯,让嫩肉粉和滤液充分接触。

      ②把小烧杯置于60℃的水浴锅中加热10min。

      ③待小烧杯冷却后,沿木筷子从烧杯壁缓慢加入2倍体积的95%的酒精。这步是关键,需小心缓慢加入酒精。

      ④静置5min后,用木筷子缓缓卷起上层漂浮的白色纤维状黏稠物(见图3)。

      3.鉴定(同上)

      结果表明,空白对照组不变色,加入嫩肉粉组实验结果呈蓝色,比不加嫩肉粉组颜色稍深,见图4(从左依次为:1对照组、2不加嫩肉粉组、3加嫩肉粉组)。

      

      三、人体口腔上皮细胞DNA的粗提取与鉴定

      ①获取口腔上皮细胞:在获取之前先用清水漱口减少杂质。然后取10mL盐水并用其漱口,使盐水尽可能与口腔内壁上皮细胞接触,收集漱口水于小烧杯中。

      ②释放DNA:在小烧杯的漱口水中加2mL洗手液,充分振荡。

      ③析出DNA:沿烧杯内壁,缓缓加入2倍体积的95%的酒精,静置5min后,观察到白色丝状析出物(见图5)。用牙签轻轻搅动,将丝状沉淀缠绕在牙签上(见图6)。将牙签剪断溶解在3mL 2mol/L的氯化钠溶液中以备鉴定。

      

      

      ④鉴定DNA:方法同香蕉DNA的鉴定。结果如图7(1对照组、2实验组)。由于获取的人体口腔上皮细胞DNA有限,实验组颜色呈浅蓝色,结果和香蕉DNA结果相同。证明口腔上皮细胞中的DNA被成功提取。学生试图纯化提取的DNA,但由于获取的口腔上皮细胞DNA有限,如果再加入嫩肉粉或高温处理,效果不佳且易带入其他杂质无法处理,只好放弃纯化。

      四、分析与讨论

      1.实验材料

      改进后的实验材料易得,价格低廉。如果采用香蕉作为材料,每班只需4斤香蕉,与用鸡血相比,成本降低97.5%以上。如果采用人口腔上皮细胞为材料则几乎零成本。这样就解决了实验经费不足的问题,特别是对经费紧张的农村学校而言更有推广价值,可以保证实验课能够正常开出。另外从自己的口腔上皮细胞的细胞核中提取DNA,容易激起学生的实验探索兴趣。同时,通过这个实验更容易建立细胞核、染色体、DNA之间的联系。

      2.实验仪器和药品

      改进后的实验不要离心机、铁架台、铁环、镊子、三脚架、滤纸等实验仪器,烧杯数量也减少一半。同时节省了大量的药品,如蒸馏水、柠檬酸钠等,只增加了家用洗手液、嫩肉粉和研钵。通过实验还发现,不同类型的洗涤剂如洗手液、洗洁精、洗发水和沐浴露等实验效果没有明显差异。

      3.课前准备和实验用时

      采用鸡血提取DNA,课前需要配制抗凝剂、采鸡血、离心、冷藏鸡血24h等。改进后的实验只需到市场购买香蕉即可,不仅简化了制备过程,且保证取材新鲜,操作简便易行。整个实验过程省时省力,学生的兴趣大大增强,人人动手参与。采用香蕉提取需要用时30min,采用口腔上皮细胞提取则只要5min~7min。这样,大部分学生在一节课均能完成两个实验。学生还能有时间比较动植物细胞提取的差别(如植物细胞需要研磨破坏细胞壁,而动物细胞则不需要)及如何改进优化实验,更加符合实验教学的初衷。学生通过实验亲自参与、收集和探索生物学事实,为重要生物学概念的学习提供支撑。

      4.实验效果

      原实验采用鸡血成功率较低,在30%以下。改进后的实验操作性强,实验效果明显。不管是香蕉还是口腔上皮细胞,学生均可成功提取DNA,成功率达到100%。需要注意的是在香蕉优化组时,加入酒精需缓慢且静置时间可适当延长,以增加DNA的析出量。后面的木筷子卷起漂浮沉淀时也要求动作轻柔,以减少DNA的损失并防止杯底的嫩肉粉等杂质被带入。另外,发现鉴定DNA时,二苯胺溶液容易被氧化变质,必须严格按照比例现配现用。沸水浴的时间必须保证10min或以上,才会有较明显的实验现象。沸水浴后待静置冷却一段时间后蓝色更为明显。

      综上,本实验方案与教材和教参书上的相比,材料易得,实验步骤简单,只需要研磨、过滤、二苯胺显色鉴定等简单步骤,方法简便易于操作。另外,所用研磨液、洗手液为日常生活中常用之物,而且实验现象明显,成功率高。本方案能达到预期教学目标,对提高学生的科学素养有一定的价值,因此易于在普通中学中普及和推广。

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