吴颜晖[1]2003年在《中国人食管癌10q23杂合性缺失和PTEN基因突变及表达研究》文中研究表明目的：探讨10q23的杂合性缺失(LOH)和微卫星不稳定(MSI)及定位在这一区域的抑癌基因PTEN(phosphatase and tensin homologue deleted on chromosome 10)在中国人原发性食管鳞癌的发生、发展中的意义。 方法：收集24对原发性食管癌的癌组织和相应正常食管组织，分别抽提基因组DNA。选择位于10q23的D10S215、D10S541、D10S551、D10S2491四个基因组DNA微卫星多态性标记，采用PCR-PAGE-银染技术分析等位基因不平衡(AI)情况；PCR扩增抑癌基因PTEN的4、5、6、7、8外显子，采用PCR-SSCP技术，检测这些外显子的突变。应用免疫组化S-P法检测24对食管癌组织及相应正常食管组织中抑癌基因PTEN的蛋白质表达水平。 结果：杂合性缺失研究结果表明，中国人原发性食管鳞癌组织中10q23的LOH发生率为29.2％(7／24)、MSI为8.3％(2／24)、总等位基因不平衡率为37.5％(9／24)。10q23的杂合性缺失和微卫星不稳定性与食管癌的TNM分期及淋巴结转移表型无显着相关性(P＞0.05)。PCR-SSCP分析未发现PTEN基因的第4～8外显子区域的核苷酸变异。免疫组织化学染色分析表明，PTEN蛋白质主要于胞浆表达。24对对应的癌组织与正常组织中PTEN蛋白质的表达水平无显着差异(P＞0.05)；食管癌组织中的PTEN蛋白质表达强度与其TNM分期无相关性(P＞0.05)。有淋巴结转移的食管癌组织中PTEN蛋白质的表达强度明硕士学位论文 摘 要显低于无淋巴结转移的食髓组织，经 X’检验证实两组间 PTEN蛋白质表达强度呈现显着性差异oo．05人 结论：本研究表明：10q23的杂合性缺夫和微卫星不稳定性与食管癌的TN’M分期及淋巴结转移表型无明显相关性，但可能累及此区域的其他肿瘤抑制基因；PTEN基因突变在食管癌的发生、发展中不起主要作用；食管癌组织中的PTEN蛋白质的表达强度与TIM分期无相关性，但与淋巴结转移呈显着性相关，在食管癌淋巴结转移的发生、发展过程中呈现PTEN基因表达下调；PTEN蛋白质的表达水平可能作为判断食管癌患者有无淋巴结转移的重要参数之一。
吴颜晖, 陈汉春, 刘新发, 李新梅, 曹燕飞[2]2004年在《中国人食管鳞癌10q23微卫星不稳定和杂合性缺失初步探讨》文中认为食管癌是较常见的恶性肿瘤之一,早期诊断和积极治疗十分重要。食管癌在癌变发展的不同阶段均有原癌基因的激活和抑癌基因的失活。近年主要集中于研究癌基因c-myc、c-erbB-2、cyclinD1及抑癌基因Rb、p53、p16、APC/MCC等,但尚未发现与食
刘亮[3]2014年在《新疆维、汉族胶质瘤临床特点及基因表达差异的研究》文中研究指明目的：总结新疆地区维、汉族胶质瘤患者的临床特点，分析相关临床因素的分布特点，结合随访资料，进行生存分析。通过对P53、MGMT、PTEN蛋白及Ki-67在胶质瘤中表达及其与胶质瘤临床特征的关系，探讨胶质瘤相关分子标记如P53、MGMT、PTEN、Ki-67蛋白在新疆维、汉族胶质瘤患者间的表达差异及其与胶质瘤发生、发展中的关系。首次进行新疆维、汉族患者胶质母细胞瘤的mRNA基因表达谱及全基因组甲基化表达谱差异检测，筛选并初步探讨差异表达的相关基因在新疆维、汉族患者胶质母细胞瘤的发病机制及预后转归中的意义。方法：1）收集新疆医科大学附属肿瘤医院及新疆医科大学第一附属医院神经外科自建院以来经治的成人脑胶质瘤患者共985例，其中维吾尔族、汉族胶质瘤患者共有843例，其他民族如哈萨克族、回族、蒙古族等共有142例。收集并整理842例胶质瘤患者的一般资料、临床表现、影像学特征、临床病理学特点等信息，初步比较维、汉族胶质瘤患者在发病和临床特点分布情况，进行统计学分析。选取2010年1月～2013年5月新疆医科大学附属肿瘤医院的111例胶质瘤患者进行回顾性电话随访及复诊随访，其中维吾尔族、汉族患者共有80例，其他民族共有31例。运用免疫组织化学SP法分别检测随访资料完整的80例胶质瘤组织的P53、MGMT、PTEN蛋白及Ki-67的表达情况；比较维、汉族胶质瘤中P53、MGMT、PTEN、Ki-67的表达差异以及P53、MGMT、PTEN、Ki-67蛋白表达与胶质瘤患者临床特征的关系；2）运用Illumina HT-12mRNA表达谱芯片检测6例胶质母细胞瘤（其中维、汉族各3例）组织中的基因表达情况，初步筛选维、汉族胶质母细胞瘤中存在的相同基因及差异表达基因。通过提取组织总RNA，反转录成cDNA，将标记的cDNA与基因表达谱芯片杂交，最后读取数据及获得图像，进行生物功能信息学分析。所有检测样品均通过6类内参质控检测；运用免疫组织化学SP法检测胶质母细胞瘤相关分子标记物，与筛选出来的表达谱差异表达基因进行综合分析和验证；3）运用Illumina Methylation450K全基因组甲基化芯片检测6例胶质母细胞瘤（其中维、汉族各3例）组织中的甲基化表达情况，初步筛选维、汉族胶质母细胞瘤中差异表达的甲基化位点及其对应的相关基因。通过提取组织DNA，经过亚硫酸盐处理，与甲基化芯片杂交，读取数据及获得图像，进行生物功能信息学分析。所有样品均通过11类内参质控检测；对维、汉族胶质母细胞瘤中筛选出来的差异甲基化位点对应的差异基因，与mRNA表达谱芯片筛选的差异基因的结果分别进行高甲基化且基因低表达及低甲基化且基因高表达的联合分析，筛选新疆维、汉族胶质母细胞瘤中可能存在的关键差异基因。结果：1）在所有入组842例胶质瘤病例中，男性481例，女性362例，年龄1～79岁，平均年龄40.14±18.03岁，其中维族342例，汉族501例。维、汉族胶质瘤患者在不同WHO组织学分级的分布差异有统计学意义（P＜0.05）。所选病例的组织学类型中，星形细胞瘤（含胶质母细胞瘤）的例数最多达554例（554/842，65.72%）；室管膜肿瘤共149例（149/842，17.67%）；少突胶质细胞肿瘤共50例（50/842，5.93%）；少突星形细胞肿瘤共12例（12/842，1.42%）；脉络丛肿瘤共7例（7/842，0.83％）；神经元混合性神经元-胶质瘤共11例（11/842，1.30%）；胚胎性肿瘤共54例（54/842，6.41％）；松果体肿瘤共6例（6/842，0.71%）。80例随访资料完整的胶质瘤病例中。胶质瘤患者中民族（P=0.000）、肿瘤病理分级（P=0.000）、是否行放、化疗（P=0.009）和肿瘤是否全切（P=0.003）这四项指标可能是影响患者预后的独立危险因素。P53、MGMT、PTEN蛋白和Ki-67的阳性率分别为66.25%（53/80）、65%（52/80）、45%（36/80）和47.5%（38/80）。维、汉族胶质瘤患者中MGMT、P53蛋白和Ki-67表达在不同WHO组织学分级组中的差异有统计学意义（P＜0.05），而在不同年龄、性别、民族及肿瘤部位、病灶大小、侵犯临近脑叶情况等各组中的差异均无统计学意义（P＞0.05）；PTEN蛋白表达在不同肿瘤部位及WHO组织学分级组中的差异有统计学差异（P＜0.05），而在不同年龄、性别、民族、病灶大小、是否侵犯临近脑叶情况等各组中的差异均无统计学意义（P＞0.05）。2）将芯片杂交扫描图片导入IlluminaGenomeStudio软件，得到校正后的数据，利用R语言lumi包进行标准化处理及差异基因筛选（P＜0.05）；利用Web Gestalt软件，对差异基因进行GO和KEGG分析（P＜0.05），维、汉族患者胶质母细胞瘤mRNA表达谱的比较分析发现，筛选出显着差异表达的基因共有1475个，其中表达上调的基因有669个（44.84％），表达下调的基因有807个（55.16％）（其中有1个基因（STRC）对应2个转录本，1个转录本表达上调1个转录本表达下调），差异基因主要参与了代谢过程、生物调节、对刺激反应、多细胞的有机过程等，其中包含小GTP酶调节信号通路、Ras信号通路、神经元反应蛋白调节、中枢神经系统髓鞘形成等多个功能节点；同时也参与了多条与肿瘤发生相关的信号通路，如：代谢通路、癌通路、MAPK信号通路、TGF-β信号通路、神经营养因子信号转导通路、mTOR信号通路等。3）将芯片杂交扫描图片导入Illumina GenomeStudio软件，得到校正后的数据，使用controls标准化；通过IlluminaCustom进行差异位点筛选，结果经过多重检验校正和筛选条件为，筛选条件为|DiffScore|≥13&&|DeltaBeta|≥0.2；利用WebGestalt软件，对差异甲基化位点对应的基因进行GO和KEGG的功能注释（P＜0.05），维、汉族患者胶质母细胞瘤全基因组甲基化表达谱的比较分析发现，筛选出显着差异表达的6406个差异位点所对应的1903个基因中，表达上调的位点有1953个（1953/6406，30.49％），表达下调的位点有4453个（4453/6406，69.51％），这些差异位点对应的相关基因主要参与了生物调节、代谢过程、多细胞的有机过程、对刺激反应、发育过程等，其中包含小GTP酶调节信号通路、Ras信号通路、神经元反应蛋白调节、中枢神经系统髓鞘形成等多个功能节点；同时也参与了多条与肿瘤发生相关的信号通路，如：神经分化、神经发育、MAPK信号通路、TGF-β信号通路、神经营养因子信号转导通路、mTOR信号通路等。4）通过对维、汉族胶质母细胞瘤mRNA基因表达谱及其全基因组甲基化状态的关联性分析，初步通过对差异表达基因及差异甲基化位点所对应的差异基因表达上调、下调关系进行比对发现，维、汉族胶质母细胞瘤中全基因组甲基化芯片筛选的高甲基化位点（表达上调）对应的基因中与表达谱筛选的差异基因中低表达（表达下调）的基因共同的有12个，分别是ADARB2，ATP11C，ATPGD1，C1orf59，GPR62，PIK3C2B，PIR，PLLP，SLC5A11，ZFYVE27，ZNF415，ZNF536；而维、汉族胶质母细胞瘤全基因组甲基化芯片筛选的低甲基化位点（表达下调）对应的基因中与表达谱筛选的差异基因中高表达（表达上调）的基因共同的有4个，分别是HSD17B10，MRPL3，ZBTB5，ZNF662。结论：1）与新疆地区汉族胶质瘤患者相比，维族胶质瘤患者有发病年龄轻、男性比例高、低级别胶质瘤比例较高、星形细胞瘤比例高的趋势。胶质瘤患者临床特点中的民族、肿瘤病理分级、是否行放、化疗和肿瘤是否全切等指标可能是影响胶质瘤患者预后转归的因素。联合检测MGMT、P53、PTEN蛋白和Ki-67在胶质瘤中的表达可以作为判定胶质瘤生物学行为和预后的参考指标。2）新疆维、汉族患者胶质母细胞瘤mRNA表达谱芯片和全基因组甲基化芯片筛查出的众多相同基因及相同甲基化位点，也筛选出不同民族间的差异表达基因及差异甲基化位点。这些差异基因主要参与了代谢过程、生物调节、对刺激反应、多细胞的有机过程、发育过程等，其中包含小GTP酶调节信号通路、Ras信号通路、神经元反应蛋白调节、中枢神经系统髓鞘形成等多个功能节点；同时也参与了多条与肿瘤发生相关的信号通路，如：代谢通路、癌通路、神经分化、神经发育、MAPK信号通路、TGF-β信号通路、神经营养因子信号转导通路、mTOR信号通路等。3）mRNA表达谱及甲基化状态的关联性分析提示维、汉族胶质母细胞瘤全基因组甲基化芯片筛选的高甲基化位点（表达上调）对应的基因中与mRNA表达谱筛选的差异基因中低表达（表达下调）的基因共同的有12个，分别是ADARB2，ATP11C，ATPGD1，C1orf59，GPR62，PIK3C2B，PIR，PLLP，SLC5A11，ZFYVE27，ZNF415，ZNF536；而维、汉族胶质母细胞瘤全基因组甲基化芯片筛选的低甲基化位点（表达下调）对应的基因中与mRNA表达谱筛选的差异基因中高表达（表达上调）的基因共同的有4个，分别是HSD17B10，MRPL3，ZBTB5，ZNF662。对这些基因的进一步研究有助于在基因层面上揭示新疆地区维、汉族胶质瘤患者发病机制、预后转归等方面可能存在的差异，也为将来的进一步在分子水平上对新疆胶质瘤患者的的研究和靶向治疗提供新的依据。
张芬[4]2013年在《良恶性胃溃疡组织中PTEN、survivin蛋白的表达及意义》文中研究说明目的胃癌是我国常见的恶性肿瘤之一，胃溃疡性病变是常见的胃黏膜病变，良恶性胃溃疡的正确区分及寻找高特异性及敏感性的肿瘤标志物以发现早期胃癌是人们一直所关心的问题，为此，本研究通过免疫组化法检测第10号染色体同源缺失性磷酸酶-张力蛋白基因（phosphatase and tensin homolog deleted onchromosome ten, PTEN）和生存素（survivin）在无癌前病变胃溃疡组、伴有癌前病变胃溃疡组、溃疡型胃癌组中的蛋白表达情况，进一步探讨其对良、恶性胃溃疡的鉴别诊断价值及其在溃疡演变过程中的意义。方法收集合肥市第二人民医院2006年1月~2011年6月临床病例资料完整且组织标本保存完好的胃溃疡组织标本共214例，采用免疫组化S-P法检测63例无癌前病变的胃溃疡、68例有癌前病变胃溃疡及83例溃疡型胃癌组织中PTEN和survivin蛋白的表达，分析PTEN和survivin蛋白在各组中的表达情况及与临床病理特征之间的关系、二者的相关性、良恶性胃溃疡的鉴别诊断价值、对癌前病变胃溃疡演变过程中的意义。结果1.PTEN蛋白主要在良性胃溃疡组中表达，在恶性胃溃疡中也可有表达，在无癌前病变胃溃疡组、有癌前病变的胃溃疡组及溃疡型胃癌组织中PTEN表达阳性率分别为98.41%、61.76%、46.99%，呈逐渐下降趋势（P<0.01）。2.survivin蛋白主要在恶性胃溃疡组中表达，在良性胃溃疡中也可有表达，在无癌前病变胃溃疡组、有癌前病变的胃溃疡组及溃疡型胃癌组织中survivin表达阳性率分别为25.40%、58.82%、71.08%，呈逐渐升高趋势（P<0.01）。3.PTEN及survivin蛋白在各组中的表达呈负相关（r=-0.489，P<0.01）。4.PTEN蛋白表达与溃疡型胃癌患者的性别、年龄、溃疡部位、Hp感染无显着相关（P>0.05）；PTEN蛋白阳性表达与溃疡型胃癌分化程度有关，高分化者高于低分化者（2=6.103，P<0.05）；PTEN蛋白阳性表达与溃疡型胃癌患者肿瘤指标CEA水平相关，在CEA正常组中高于CEA升高组（2=4.275,P<0.05）。5.survivin蛋白表达与溃疡型胃癌患者的性别、年龄、溃疡部位、Hp感染无显着相关（P>0.05）。survivin蛋白表达在中高分化胃癌中低于低分化胃癌，但差异无统计学意义（P>0.05），在CEA正常组中低于CEA升高组,但差异无统计学意义（P>0.05）。6.PTEN、survivin在溃疡型胃癌检测中特异度分别为79.39%、57.25%，灵敏度分别为52.38%、71.08%。7.survivin蛋白表达与癌前病变胃溃疡不同随访结果有关（P<0.05），PTEN蛋白表达与癌前病变胃溃疡不同随访结果无关（P>0.05）。结论无癌前病变胃溃疡、有癌前病变的胃溃疡及溃疡型胃癌组织中PTEN蛋白表达呈逐渐下降趋势，而survivin蛋白表达呈逐渐升高趋势，二者的表达呈负相关，PTEN蛋白表达与溃疡型胃癌分化类型、CEA水平有关（P<0.01），survivin蛋白表达与有癌前病变胃溃疡病理进展有关，检测其组织中PTEN和survivin蛋白对良、恶性胃溃疡的鉴别及观察溃疡的组织演变可能具有重要意义。
参考文献：
[1]. 中国人食管癌10q23杂合性缺失和PTEN基因突变及表达研究[D]. 吴颜晖. 中南大学. 2003
[2]. 中国人食管鳞癌10q23微卫星不稳定和杂合性缺失初步探讨[J]. 吴颜晖, 陈汉春, 刘新发, 李新梅, 曹燕飞. 中国肿瘤临床. 2004
[3]. 新疆维、汉族胶质瘤临床特点及基因表达差异的研究[D]. 刘亮. 新疆医科大学. 2014
[4]. 良恶性胃溃疡组织中PTEN、survivin蛋白的表达及意义[D]. 张芬. 安徽医科大学. 2013
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