曹少先[1]2000年在《应用RAPD和AFLP分析波尔山羊和江苏本地山羊的遗传多样性及其与生长发育和繁殖的关系》文中指出为了充分发挥波尔山羊优秀的肉用性能和江苏本地山羊耐粗放、适应性强的优点，加快我国肉用山羊新品系的培育，本研究应用AFLP和RAPD技术通过分析共116只波尔山羊、徐淮山羊和海门山羊的遗传多样性，以及RAPD标记与波尔山羊公羊生长发育、繁殖的关系，旨在：①与RAPD技术对比，探讨AFLP技术在山羊遗传多样性研究方面的优越性；②寻找与波尔山羊体重、体尺相关的RAPD标记，以及与波尔山羊公羊繁殖力相关的RAPD标记，为山羊育种的标记辅助选择和基因定位及作图的研究提供科学依据，实现经济性状的早期选择，加快我国肉用山羊新品系培育进程。③为更好地利用和保护江苏本地山羊种质资源提供理论依据。 1．应用AFLP和RAPD分析波尔山羊、徐淮山羊和海门山羊的遗传多样性 实验山羊共105只，采自三个品种，其中60只波尔山羊（采血样20个，组织样40个，公母羊各半）；30只徐淮山羊（每羊采血样1个，公母羊各半）；15个海门山羊（每羊采血样1个，公羊7个，母羊8个）。分别提取DNA，按品种构建池DNA。应用36个选择性引物组合对波尔山羊、徐淮山羊和海门山羊种间AFLP多样性进行研究，其中29个引物组台表现出多态性。29个引物组合共扩增出3253个标记，其中可变标记92个，平均每个引物组合3.17个，多态频率2.8％。可变标记数较多的引物组合为：E00+ACG/M00+CAC（13个）、E00+ACG/M00+CAG（10个）、E00+AAC/M00+CAC（8个）、E00+AAC/M00+ACT（7个）。从93个随机引物中筛选出品种间多态性较强、重复性好的引物22个。22个引物对三个品种池DNA进行随机扩增，共扩增出183个标记，其中可变标记60个，平均每个引物2.73个，多态频率32.8％。统计表明，两种方法得到一致结果：徐淮山羊与海门山羊遗传距离最近，徐淮山羊与波尔山羊次之，海门山羊与波尔山羊遗传距离最远；按UPGMA法将海门山羊与徐淮山羊聚为一类，其次为波尔山羊。两种方法均能较好地反映三个山羊品种的遗传差异，但AFLP方法可变标记数更多，因而比RAPD方法更高效。 2．RAPD标记与波尔山羊体重体尺的关系 应用19个波尔山羊个体间多态性较强、重复性好的随机引物对20个5-6月龄的波尔山羊公羊组织样DNA进行扩增，共得到156个标记，其中可变标记47个。t检验表明，OPH07.4、OPH13.6、OPH13.8、OPH15.6、OPE17.4、OPE18.8对断奶重、哺乳期平均日增重有显著影响；OPH05.1、OPH13.6、OPH13.8、OPE18.2对多个体尺性状有显著影响。 3．RAPD标记与波尔山羊公羊繁殖性能的关系 应用10个波尔山羊个体间多态性较强、重复性好的随机引物对11个波尔山羊公羊精液样DNA进行随机扩增，共得到113个标记，其中可变标记31个。t检验表明，OPN14.3、OPK09.5对平均每次采精量有显著影响；OPK09.5对总采精量有显著影响； 应用WD和AFLP分析波尔山羊和江苏本地山羊的邀传多样性及其与生长发育和繁殖的关系OPH．5对冻后活力有显著影响。
王瑞芳[2]2008年在《山羊高繁殖力候选基因抑制素Alpha亚基基因研究》文中提出为了提高山羊的繁殖性能,增加山羊规模化生产的经济效益,为高繁殖力山羊的标记辅助育种提供基础材料,以江苏省地方山羊品种(黄淮山羊和长江三角洲白山羊)和波尔山羊为试验对象,对抑制素-α亚基(inhibin-α,INHA)基因进行了PCR-SSCP和数量遗传学分析。本研究建立了检测山羊INHA基因的单核苷酸突变的PCR-SSCP方法,并且分析了三个山羊群体INHA基因的遗传变异。采用PCR-SSCP技术检测INHA基因启动子区、5调控区和外显子1在高繁殖力山羊品种(黄淮山羊和长江三角洲白山羊)以及低繁殖力山羊品种(波尔山羊)中的单核苷酸多态性,同时研究INHA基因对黄淮山羊高繁殖力的影响。研究结果发现:黄淮山羊、长江三角洲白山羊和波尔山羊在INHA基因5'调控区引物2位点检测到3种基因型,测序发现发生了两处碱基突变(260T→G和353A缺失);黄淮山羊、长江三角洲白山羊和波尔山羊AA基因型频率分别为0:8434、0.8421、0.9167,AB基因型频率分别为0.1084、0.1053、0.0278,BB基因型频率分别为0.0482、0.0526、0.0556;基因型与产羔数相关分析发现突变纯合型(BB)和突变杂合型(AB)的黄淮山羊平均产羔数分别比野生型(AA)多1.25只(P＜0.01)和0.78只(P＜0.05)。三个群体在该位点的基因型分布极显著偏离Hardy-Weinberg平衡(P＜0.01),说明该位点有经过人工选择的可能。在INHA基因外显子1引物4位点也检测到3种基因型,测序发现发生了1处碱基突变(1006C→A),该突变导致编码氨基酸由脯氨酸改变为苏氨酸;突变在三个山羊群体中都检测到;黄淮山羊、长江三角洲白山羊和波尔山羊CC基因型频率分别为0.3214、0.4444、0.5526,CD基因型频率分别为0.3929、0.4167、0.3421,DD基因型频率分别为0.2857、0.1389、0.1053;基因型与产羔数相关分析发现突变纯合型(DD)和突变杂合型(CD)黄淮山羊平均产羔数分别比野生型(CC)少0.65只(P＜0.05)和0.41只(P＞0.05)。该位点在黄淮山羊群体基因型分布显著偏离Hardy-Weinberg平衡状态(P＜0.05),而长江三角洲白山羊和波尔山羊的基因型分布处于平衡状态(P＞0.05)。黄淮山羊、长江三角洲白山羊和波尔山羊在引物2位点的多态信息含量(PIC)分别是0.1669、0.1706、0.1209,属于低度多态位点;在引物4位点分别是0.3747、0.3506、0.3200,属于中度多态位点。本研究结果初步表明INHA基因可能是影响黄淮山羊高繁殖力的一个主效基因或是与之存在紧密遗传连锁的一个分子标记。
滑国华[3]2006年在《山羊繁殖性状五个候选基因多态性及其与产羔数性状关联分析》文中进行了进一步梳理在现代动物育种实践中，应用分子标记辅助选择(Marker-assisted selection，MAS)对低遗传力性状、伴性性状或表达较晚的性状进行选育具有非常重要的意义。利用这种方法进行山羊繁殖性状改良和选择的前提，是必须找到尽可能多的分子标记。 本研究选取骨形态发生蛋白受体IB基因(Bone morphogenetic protein receptor IB，BMPR-IB)、骨形态发生蛋白15基因(Bone morphogenetic protein 15，BMP15)、抑制素a亚基基因(Inhibin-a subunit gene，INHA)、褪黑激素1型受体a亚型基因(Mel_(1a)melatonin receptor，MTNR1A)和促卵泡素β亚基基因(Follicle stimulating hormone β，FSHβ)为候选基因，以及与FecB(Booroola Fecundity)基因连锁的3个微卫星位点BMS2508、BM143和OARHH35，分析它们在波尔山羊(209只)、海门山羊(54只)、努比山羊(37只)和马头山羊(23只)4个山羊品种共323个样本中的多态性，并对不同基因型与产羔性状的关系进行了探索。主要研究结果如下： 1．利用Forced PCR-RFLP技术证实：在所检测的波尔山羊、海门山羊、马头山羊和努比山羊4个山羊群体中没有发现FecB基因突变和BMP15基因的FecX~I、FecX~H、FecX~G、FecX~B四个点突变。 2．在4个山羊品种抑制素a亚基基因(INHA)中发现G~(128)-A~(128)(Accession number：L28815)突变，该突变引起Hae Ⅱ酶切位点改变；利用PCR-RFLP技术进行基因型判定，发现波尔山羊和努比山羊基因型频率差异显著(P＜0.05)，努比山羊与海门山羊基因型频率差异极显著(P＜0.01)；G等位基因可能与山羊高产性状呈正相关。 3．在4个山羊品种褪黑激素1型受体a亚型基因(MTNR1A)中共发现7个点突变，分别是AY524665序列T~(246)-C~(246)突变(引起Xba Ⅰ酶切位点改变)和T~(278)-C~(278)突变，AF419334序列T~(155)-C~(155)突变、A~(239)-G~(239)突变、A~(277)-G~(277)突变、G~(353)-A~(353)突变(引起Bst4CI酶切位点改变)和T~(425)-C~(425)突变，对其中4个点突变进行了基因型判定，其中三个位点(AF419334序列T~(155)-C~(155)突变、A~(239)-G~(239)突变、A~(277)-G~(277)突变)用AS-PCR方法进行基因型判定，AY524665序列T~(246)-C~(246)突变用Xba Ⅰ-RFLP进行基因型判定。 4．4个山羊品种褪黑激素1型受体a亚型基因(MTNR1A，Accession number：AF419334)T~(155)-C~(155)突变用AS-PCR技术判定基因型，并进行性状关联分析，结果发现：波尔山羊和海门山羊基因型频率差异极显著(P＜0.01)，其它品种间差异不显著；A_1等位基因可能与海门山羊和波尔山羊产羔数呈正相关。 5．4个山羊品种褪黑激素1型受体a亚型基因(MTNR1A，Accession number：AF419334)A~(239)-G~(239)突变用AS-PCR技术判定基因，并进行相关分析，结果发现：
马巍[4]2005年在《应用AFLP分析七种警犬的遗传多样性及其与体形外貌和繁殖性能的关系》文中提出为保证警犬繁育基地向公安机关、边防、消防及武警部队提供量足、质优的作业受训犬,建立一套适于我国警犬事业发展的繁育体系。本研究应用AFLP技术通过分析德国牧羊犬(German shepherd dog)、罗威纳犬(Rottweiler)、拉不拉多犬(Labrador retriever)、史宾格犬(English spring)、马里努阿犬(Belgian malinois)、昆明犬(Kunming dog)和杜伯文犬(Doberman pinscher)7个品种,共221只警用犬种的遗传多样性,以及AFLP标记多态性与德国牧羊犬和罗威纳犬的体形外貌和繁殖性能的关系,旨在:建立测定犬池DNA的AFLP方法,分析AFLP标记的多样性及其与德国牧羊犬和罗威纳犬体形外貌、繁殖性状的关系,为探讨警犬重要性状的分子调节机制、建立标记辅助选择方法、进行基因定位与基因作图等奠定基础。 1 应用AFLP技术分析7个警用犬种的遗传多样性 实验警犬共221只,其中德国牧羊犬40只、罗威纳犬31只、拉不拉多犬30只、史宾格犬21只、马里努阿犬45只、昆明犬35只、杜伯文犬19只。分别提取DNA,按品种构建DNA池。应用25对选择性引物组合进行AFLP分析,其中21对引物组合得到特异性标记,特异性标记总数75个。21个引物组合共扩增出清晰的标记5081条,平均每个引物组合34.57条/犬,并按UPGMA法对7个警用犬种进行聚类。结果表明,应用AFLP方法可很好地揭示我国现有警用犬种的遗传差异。 2 AFLP标记多态性及其与德国牧羊犬体形外貌和繁殖性能的关系 应用试验一中多态性较好的7对选择性引物组合对26只雌性德国牧羊犬血样DNA进行扩增,共得到可变标记23个。t检验表明:标记E39/T33-22和E39/T38-35与德国牧羊犬的躯干部形态显著相关;标记E39/T49-5与德国牧羊犬的四肢步态显著相关;标记E39/T38-16与德国牧羊犬的受胎率显著相关,表明这些标记可能是调控相关性状的主基因或主效基因,或与之连锁。 3 AFLP标记多态性及其与罗威纳犬体形外貌和繁殖性能的关系 应用试验一中多态性较好的7对选择性引物组合对23只雌性罗威纳种犬血样
刘昌林[5]2007年在《肉牛生长发育性状杂种优势与微卫星遗传距离的关系研究》文中认为引入西门塔尔牛、利木赞牛、黑安格斯牛、红安格斯牛、金黄阿奎顿牛、劳莱恩牛、海福特牛、德国黄牛等8个肉用品种及肉乳兼用品种冻精或种公牛与本地黄牛(川南山地黄牛)杂交，通过对本地黄牛及其与引进品种的杂交后代初生、3、6、12、18、24月龄的生长发育性状的测定，研究不同杂交细合对本地黄牛的体尺体重改良效果，计算超亲优势。选用11个微卫星标记分析这8个引入品种以及川南山地黄牛的群体遗传结构和遗传变异；通过肉牛生长发育性状杂种优势与亲本遗传距离的关系，探索肉牛杂种优势的预测方法。研究结果如下：(1)在生长发育性状方面，杂种牛的体尺体重均高于川南山地黄牛。在整个测定期内体重增长速度较快的为海杂牛、西杂牛、红杂牛和德杂牛，体高总体增长较快的为海杂牛和西杂牛，体斜长总体增长较快的为西杂牛、海杂牛、红杂牛和德杂牛，体直长总体增长较快的为海杂牛和西杂牛，胸围和管围总体增长较快的是西杂牛、海杂牛和红杂牛。总的看来，用海福特牛、西门塔尔牛和红安格斯牛改良川南山地黄牛体尺体重效果较好。(2)11个微卫星位点在9个群体中共检测到80个等位基因，每个位点平均为7.27个等位基因，每个位点平均有效等位基因数为3.0069～4.9912，每个位点平均多态信息含量为0.3566～0.4098，各位点平均杂合度为0.6854～0.7918，各群体平均杂合度为0.6591～0.8413。(3)川南山地黄牛遗传一致性低，11个微卫星位点的平均杂合度为0.8413。(4)根据11个微卫星位点在9个种群中的等位基因频率，计算种群之间的标准遗传距离。川南山地黄牛与引进品种的遗传距离大小依次是：黑安格斯牛、利木赞牛、海福特牛、劳莱恩牛、红安格斯牛、西门塔尔牛、德国黄牛和金黄阿奎顿牛，分别为0.5068、0.3257、0.2910、0.2409、0.2082、0.1500、0.1447和0.1009。并且对部分群体进行聚类：西门塔尔牛与德国黄牛聚为一类，再与本地黄牛聚为第二类，然后与红安格斯牛、利木赞牛聚为第三和第四类，最后与黑安格斯牛聚在一起。(5)采用Spearman等级相关分析微卫星遗传距离与杂种优势的关系，结果r_s=0.16071(P＞0.05)，等级相关不显著。(6)采用分子数量遗传学综合评定方法对各杂交组合优劣进行评估，三峡库区肉牛杂交组合优劣的排序(以父本为代表)为：海福特牛、红安格斯牛、西门塔尔牛、金黄阿奎顿牛、黑安格斯牛、利木赞牛、德国黄牛和劳莱恩牛。
参考文献：
[1]. 应用RAPD和AFLP分析波尔山羊和江苏本地山羊的遗传多样性及其与生长发育和繁殖的关系[D]. 曹少先. 南京农业大学. 2000
[2]. 山羊高繁殖力候选基因抑制素Alpha亚基基因研究[D]. 王瑞芳. 南京农业大学. 2008
[3]. 山羊繁殖性状五个候选基因多态性及其与产羔数性状关联分析[D]. 滑国华. 华中农业大学. 2006
[4]. 应用AFLP分析七种警犬的遗传多样性及其与体形外貌和繁殖性能的关系[D]. 马巍. 南京农业大学. 2005
[5]. 肉牛生长发育性状杂种优势与微卫星遗传距离的关系研究[D]. 刘昌林. 西南大学. 2007
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