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制定年度审计项目计划前的准备工作
每年在上年末和本年初，审计机关要对上年完成的全部审计项目和专项审计调查情况进行全面总结，重点是审计查出问题分类，以及此类问题发生在何单位。对那些内部控制不健全、几次审计都发生违纪问题的单位要特别关注，一般要将这样的单位再纳入本年的审计计划。除对上年的审计情况进行总结外，还可以组织调研组选择有关部门、单位进行分类调研，如可以选几个企业、选几个行政执法部门等，与单位领导及财务负责人座谈调研财政财务收支情况，探讨加强财务管理、提高资金效益的措施。
在认真梳理总结和调查研究的基础上，初步拟定本年度审计计划草案。从当前的审计工作来看，一般有财政预算执行审计、企业审计、专项资金审计、行政事业单位财务收支审计、金融审计和经济责任审计等审计项目。按照审计署《２００３至２００７年审计工作发展规划》，到２００７年，力争审计和审计调查项目各占一半、真实合法审计与效益审计各占一半。从一般意义上分析，以下情况的单位在制定审计计划时应予以关注：财政预算资金量大、有预算资金分配权和下属单位多的部门；与群众切身利益关系密切的重点专项资金，如城镇居民最低生活保障金、失业保险基金、农业综合开发资金、资源环保建设资金等；行政事业性收费多、具有罚没职能的行政执法机关；财政资金投入较多的国家重点建设项目；群众普遍关注的、与群众生活直接相关的事业部门，如医院、学校等；以前年度审计中查出问题较多、屡查屡犯的部门单位；群众反映较大、信访反映财务问题较集中的部门单位。
年度审计项目计划草案的调整和确定
现行的国家审计机关管理体制是，地方审计机关受本级人民政府和上一级审计机关双重领导，业务上以上级审计机关领导为主。所以，草拟的审计计划要根据上级审计机关的安排和本级人民政府的部署进行调整。一般的程序是，在地方党委的全会和上级审计机关组织的审计工作会议后，结合贯彻落实会议精神，围绕地区确定的本年中心工作和按照上级审计机关的工作重点，对草拟的审计计划进行补充和再修订，充分体现围绕中心，突出重点。审计机关局务会议确定的年度审计计划，要报地方政府主管领导书面批准，报上一级审计机关备案，然后再有条不紊地组织开展全年的审计工作。
年度项目审计计划安排一定要突出重点
年度项目审计计划应体现全面审计，突出重点。从当前来看，审计任务越来越重，政府及社会公众对审计的期望越来越高，而国家审计人力、物力资源相对薄弱，矛盾比较突出。在这种情况下，审计万不可眉毛、胡子一把抓，如果被审计项目和单位定得过多，加之地方政府委托项目的工作任务越来越多，审计人员少与审计工作量大的矛盾越加突出，审计时间难以保证，审计质量也将难以保证，也必将加大审计成本，审计监督的职能作用就难以得到充分发挥。基于此，笔者认为：所谓“全面审计，突出重点”，就是可以全面审计，必须突出重点。审计项目和单位要少而精，抓住重点，力求突破。审计署６号令《审计机关审计项目质量控制办法》（试行）第五条规定，审计机关制定年度审计项目计划时，应当考虑审计项目的时间、经费和人员要求，为审计项目质量控制提供保障。计划安排的项目单位少一些，审计机关通过积极整合有限审计资源，能够集中优势兵力打攻坚战，抓住重点项目，合理安排时间，注重计算机审计的应用，审深审透，力争审计出成果，达到事半功倍的效果。
此外，还有一个多开展行业审计和审计调查的问题，对一个行业、一个系统、一个主管部门开展审计和审计调查，视审计情况搞好延伸，综合分析，找出带有普遍性、典型性的问题，从宏观管理和制度管理上提出意见建议，这样可以提升审计成果层次。而且相对来说，审计调查比审计更具灵活性，适用面也更宽些。
以区县审计机关业务为例，行政事业科每年可只安排对三至四个部门审计，视情况搞好延伸。如安排对区县卫生局的财务收支审计，延伸审计一定比例的（一般应达到６０％）二级医院和卫生院；安排对区县公安局的审计，延伸审计一定比例的下属支队及派出所；安排对区县教育局的审计，延伸审计一定比例的中小学校。相应地，财政科可只安排同级审和一定比例乡镇（一般达到６０％）的财政预算执行审计。也就是说，审计机关成绩的大小，不在审计的部门、单位数量多，重要的是必须审深审透。通过突出审计重点，集中优势兵力，力争审计出成果、出效益。
至于一名审计人员每年承担几个审计项目、审计多少单位为最佳，不可能也不必要规定出标准，原则上要少而精，要使审计人员能够有充分的时间按照审计实施方案的要求进行审计，按照相关审计准则的要求充分实施必要的审计程序。要把严谨细致的要求贯穿到审计的全过程，着力提高审计质量。