徐斌
(上海市浦东新区人民医院 上海 201299)
【摘要】 目的:探讨常见的三种胆结石胆汁中微生物群落的差异性对比。方法:选择2011年3月—2013年3月我院收治的三种类型胆结石患者100例作为研究对象,对其运用末端限制性片断长度多态性(T—RFLP)技术,并对其胆汁细菌群落进行基因序列分析探讨。结果:根据统计结果来看,就细菌16SrDNA基因片段而言,其阳性检出率为76%,且三组间的差异比较无统计学意义,胆色素结石组主要包括厌氧消化球菌等,胆固醇组的细菌群落以金黄色葡萄球菌和肺炎克雷伯氏菌为主,混合性结石胆汁组主要是丙酸杆菌和厌氧消化球菌。结论:据我院统计分析看来,就检出率方面来看,较高的是胆结石患者胆汁标本中的细菌,但各组细菌群落构成各有不同,具有较为复杂的成分
【关键词】 微生物群落;胆结石;差异性
【中图分类号】R31 【文献标识码】A 【文章编号】2095-1752(2015)16-0063-02
近年来,我国的胆结石发病率呈逐渐上升趋势,目前约为5.6%,就其发生机制方面来看,已然从胆汁郁滞、肺道感染及胆汁理化性质紊乱发展为了胆囊内微生物环境的改变,基于此,我院选择收治的三种类型胆结石患者,并利用末端限制性片断长度多态性技术对患者的胆囊内微生物菌落16SrDNA进行了统一分析,现报告如下:
1.资料和方法
1.1 一般资料 选取我院2011年3月~2013年3月收治的100例三种类型胆结石患者为研究对象,其均接受择期胆囊切除术,其中男36例,女64例,患者的平均年龄为55岁,我院结合对胆石化学成分用红外光谱法的分析,将患者分为三组,分别为混合性结石组28例,纯胆固醇结石组50例,另外,有22例为胆色素结石组。
1.2主要仪器和试剂 为了提高实验的准确性,用了ABI3100全自动遗传分析仪、ABI2720 PCR热循环仪、ZF型紫外分析仪以及低温高速台式离心机MR23i等,Hi-Di 甲酰胺,Liz500和细菌16S r DNA PCR扩增试剂盒。
1.3 胆汁DNA的提取 研究中,取胆汁1 ml与1mlBuffer I,并涡旋振荡充分混匀,在此基础上,加入溶菌酶( 50 g/L)100μl,在37℃下培育1h,并将离心管置于液氮中5 min,继而迅速向水浴锅(65℃)转移,进行3min解冻,进行反复3次,接下来加0.5ml bufferⅡ,上下摇匀后,向其中加蛋白酶K共5μl,进行1h水浴。
期刊文章分类查询,尽在期刊图书馆完成上述操作后,按照1:1比例向上述溶液中加入比例为25:24:1的加酚/氯仿/异戊醇混合液,离心5min,用一灭菌塑料离心管吸上层水相800μl,并将上述三种的混合液进行等体积加入,加入两倍体积的无水乙醇,离心30min,13000 r/min,继而将上清去弃去,进行真空干燥后,将30~50μlTE缓冲溶液加入其中,对DNA进行充分溶解,并保存于-20℃的条件下。
1.4 T-RFLP分析 在此环节,我院研究人员将0.2μl的Liz500、10μl Hi-Di甲酰胺与纯化、酶切后的PCR产物进行混合,继而于ABI3130遗传分析仪中实施毛细管电泳,所取基线的荧光强度50 RFU,并对大于基线的峰高和出峰处的T-RF长度用Genemapper软件进行计算,标准化处理大于50 bp的峰面积,对其丰度进行计算,完善整个过程。
1.5 克隆文库的构建、测序 研究中,借助于非荧光标记的引物,PCR扩增各组阳性样品的细菌16S r DNA片段,继而采用E.coli DH5α菌株和 pGEM-Teasy 载体、进行细菌16S r DNA文库的建立,在此基础上,对细菌克隆文库中随机挑选的阳性克隆利用PCR-T-RFLP分析进行分型筛选,然后进行测序,在此基础上获得细菌16S r DNA部分序列,接下来用Blast与GenBank中核酸数据实施序列比对,完成整个分析。
1.6 统计学处理 本次研究中,我院在统计分析方面采用了SPSS17.0统计学软件,率的比较采用Fisher's Exact test分析来进行,试验中三组间差异比较具有统计学意义用P<0.05表示。
2.结果
研究统计结果显示,参与研究的100例患者中,检出细菌 16S r DNA 基因片段的有76例,所以其对应的阳性率达到了76%,三组中纯胆固醇结石胆汁组阳性检出率为80%,混合性结石胆汁组为78.5%(22/28),胆色素结石胆汁组为63.6%(14/22),三组阳性检测率比较差异不具统计学意义(P>0.05)。
本次研究中,在胆汁细菌16S r DNA PCR的T-RFLP分析方面。较高的是胆结石患者胆汁标本中的细菌,但各组细菌群落构成各有不同,具有较为复杂的成分。
3.讨论
本次研究中,我院对于胆囊结石患者体内的胆汁标本,运用PCR技术进行了16S r RNA 基因片段扩增,其不同于常规细菌培养分析,具有灵敏度高、特异性强等优势,能检出1个细胞或1个细菌存在的单拷贝基因,并能结合细菌染色体上16S r RNA这种最保守的基因序列设计引物,使得从胆汁提取的DNA中特异性能对16S r RNA基因片段进行的有效扩增,从后续的实验统计及分析来看,100例胆汁标本中,检出细菌16S r DNA基因片段的达到了76例,检出率达76%,这一结果与以前的相关研究一致[1],相比于胆色素组及混合性结石组,纯胆固醇结石组中胆汁细菌阳性率更高,但三组细菌的阳性检测率间的差异比较不具统计学意义,经我院后续研究来看,可能是因患者有反复慢性胆囊炎发作病史所致,使得其对应的细菌阳性率较高。
厌氧菌和需氧菌是胆汁检测细菌的两大分类,前者从菌株上主要由丙酸杆菌、消化球菌等组成,后者则是以大肠杆菌为主,序列测定细菌的DNA后,统计分析显示,纯胆固醇结石胆汁组存在单一细菌群落,深入研究后发现,其以需氧菌为主,此组外的两组,也就是混合性结石胆汁组、胆色素结石胆汁组与前组不同,其具有丰富的细菌群落,厌氧菌及需氧菌都有,本研究未测出耐胆汁酸盐菌株序列,可能与该菌在胆囊中数量过低等有关。
综上,据我院统计分析看来,就检出率方面来看,较高的是胆结石患者胆汁标本中的细菌,但各组细菌群落构成各有不同,具有较为复杂的成分。
【参考文献】
[1]刘晶华,王敏,邹玉.常见三种类型胆结石胆汁中细菌群落的检测[J].临床肝胆病杂志,2012,07:522-524+527.
论文作者:徐斌
论文发表刊物:《医药前沿》2015年第16期供稿
论文发表时间:2015/8/10
标签:胆汁论文; 细菌论文; 胆结石论文; 结石论文; 群落论文; 检出论文; 患者论文; 《医药前沿》2015年第16期供稿论文;