金帆, 袁淑慧, 黄荷凤[1]2004年在《单细胞DOP-PCR多基因位点检测的研究》文中认为目的:探索单细胞DOP-PCR,后续巢式PCR同步检测多基因位点的可行性。方法:显微操作获取单个淋巴细胞和胚胎细胞,DOP-PCR全基因组扩增,后续特异性巢式PCR,检测β地中海贫血突变基因CD17、nt-28及其连锁基因ATTTT、囊性纤维病突变基因CF△F508及连锁基因(GATT)、杜氏肌营养不良症DMD基因外显子17和48、18和21号染色体短串联重复序列(STR)D18S51、D21S11和D21S1411、以及Y染色体性别决定基因SRY。结果:单个淋巴细胞扩增成功率、阴性率和假阳性率在分别为为88.9%(160/190)、0.95%(2/210)和6.00%(12/200),单个胚胎细胞扩增成功率和假阴性率为85.56%(77/90)和3.0(3/100)。其中两类单细胞STR叁位点的扩增成功率分别仅75.0%(45/60)和66.7%(20/30),较其它位点(95.4%(124/130),95.8%(115/120))显着性降低(P<0.01)。结论: 单细胞DOP-PCR后续巢式PCR结构基因位点扩增有较高的敏感性和特异性,其产物在后续CGH分析植入前胚胎染色体组成的同时,还可应用于多基因多位点检测,实现单次胚胎活检,性别、单基因病和染色体病的同步诊断;但该法应用于STR位点检测应慎重。
袁淑慧[2]2001年在《PEP、DOP-PCR单细胞多基因位点检测研究》文中指出植入前遗传学诊断（Preimplantation genetic Diagnosis，PGD）通过体外辅助受精、胚胎细胞遗传学分析，选择正常胚胎移植，能将人类遗传病控制推进到胚胎植入子宫内膜之前，避免了异常妊娠的发生，具明显的遗传优生学意义。但由于PGD的分析材料仅限于1-2个活检卵裂球细胞，单细胞多聚酶链反应（Polymerase chain reaction，PCR）和荧光原位杂交（Fluorescencein-situ hybridization，FISH）能提供的遗传信息非常有限，难以满足同时检测多个基因位点或重复检测的需要。 全基因组扩增（Whole genome amplification，WGA）技术通过扩增微量DNA模板甚至单个细胞的整个基因组，再将扩增产物分为多份，作为模板，进行后续分析，增加微量DNA分析的遗传信息量。应用于PGD，实现了单次胚胎活检，可分析多种不同基因病或多次重复检测同种基因病。WGA技术主要有扩增前引物延伸（Primer extension preamplification，PEP）、退变寡核苷酸引物PCR（Degenerate oligonucleotide primer-PCR，DOP-PCR）。PEP以随机组成 2001年浙江人学帧十学位论义 的 15碱基寡核昔酸作为引物，在低温下连接、延伸，随机扩增整个基因组 DNA。 DOP—PCR引物序列为 5’－CCGACTCGAGN’N’N’NNNATGTGG－3’，经低温引物 随机连接和常温特异引物连接延伸两步法扩增，按比例均匀扩增整个基因组 D「A。？2P和D0？－？［R的随机引物众多，单一循环的PCR条件无法使所有随机引 物同时处于良好的复性和延伸状态，其扩增全基因组DNA的完整性和扩增效率 尚存许多亟待探讨之处。 单细胞PEP用于检测基因位点的研究国外开展较早，迄今已有利用PEP 进行性别、神经节昔脂病GM。I型、口地中海贫血．、IU：ln血型、高度多态短串 联重复序列（short tandem repeat，STR）等基因位点的研究，但尚未见p地中 海贫血 CD17和 nt－28突变基因及连锁基因（An？rlyl？T）、18和 ZI号染色体特异短 串联重复序列 D18551、D21511和 D2151411位点的报道。国内研究才刚刚起步， 仅徐晨明和王敏分别进行单个淋巴细胞、单个胚胎细胞和单个胎儿有核红细胞 的杜氏肌营养不良症基因的检测。单细胞DOP－PCR全基因组扩增产物目前局 限于比较基因组杂交，检测全基因组或染色体组缺失和重复，应用于基因病的 检测报道甚少。若能在DOP－PCR全基因组扩增，CGH染色体非整倍体检测的 同时，利用其DOP－PCR产物，开展基因病的检测或筛查，将具有明显的临床 应用价值。 第一部分 单细胞PEP多基因位点检测的研究 目的：探索建立单细胞PEP全基因组扩增，后续巢式PCR 6地中海贫血 CD17和 nt－28突变基因及连锁基因（ATTTTTT）、18和 21号染色体短串联重复序 列 D18S51、D21Sll和 D2lS1411位点检测技术，考察单细胞陀P同步检测上述 基因位点以及囊性纤维病CF A F508及连锁基因（GATT）、杜氏肌营养不良症DMD 2 2001年浙江人学J袖十学位论义基冈外显子尸和48、Y染色体性别决定基因SRY的扩增准确率，分析单细胞陀P扩增全基【间mA的完整性。方法：显微操作获取单个人淋巴细胞和胚胎细胞，PEP全基回组扩增，后续特异性巢式PCR，检测上述川个基囚位点的单细胞扩增率（特异产物扩增出现的比率）、假阳性率（阴性管内山现扩增产物的比率）、假阴性率（川性管内未出现扩增产物的比率）。扩增准确率（单细胞利阴性、川性扩增产物的符合率）。结果：1．成功建立单细胞陀P全基回组扩增，后续巢式 PCR D地中海贫血 CD17 t［ nt－28突变基因及连锁基因 （ATI”TT）、18和 21号染色体短串联重复序列 D18551、D21511和 D2151411位点检测技术。2．成功进行单细胞PEP－巢式PCR，上述基因位点以及缀性纤维病CF八F508及连锁基因（GATTTT）、杜氏肌营养不良症皿D基因外显子17和48、Y染色体性别决定基因 SRY 10个位点的同步分析，单个淋巴细胞和单个胚胎细胞扩增准确率分别达97．17％（583／600）和 gi．58％（174／190）。3．单个淋巴扩增PEP后续巢式PCR扩增准确率高于单个胚胎细胞，假阳性率低于胚胎细胞，两者有显着性差异（P＜0．05）。 第二部分 单细胞DOP－PCR多基因位点检测的研究 日的：探索建立单细胞DOP－PCR全基因组扩增，后续巢式PCR上述10个基冈位点的同步检测技术?
袁淑慧, 金帆, 黄荷凤[3]2002年在《单细胞扩增前引物延伸多基因位点检测研究》文中提出目的 :考察单细胞扩增前引物延伸 (PEP)全基因组扩增 ,后续巢式 PCR同步检测β地中海贫血突变基因 CD17、nt- 2 8及连锁基因 (ATTTT)、18和 2 1号染色体短串联重复序列 D18S5 1、D2 1S11和 D2 1S14 11、囊性纤维病 CFΔ F5 0 8及连锁基因 (GATT)、杜氏肌营养不良症 DMD基因外显子 17和 4 8以及 Y染色体性别决定基因 SRY的可行性。方法 :显微操作获取单个淋巴细胞和胚胎细胞 ,PEP全基因组扩增 ,后续特异性巢式 PCR,检测上述 10个基因位点的单细胞扩增成功率、假阳性率、假阴性率。结果 :上述 10个位点的单个淋巴细胞扩增成功率、假阳性率和假阴性率分别为 89.5 %、0 .4 8%和 2 .5 0 % ,单个胚胎细胞扩增成功率和假阳性率分别为 85 .5 6 %和 3.0 %。结论 :单细胞 PEP后续巢式 PCR同步检测上述 10个基因位点有较高的扩增成功率和很低的假阳性率和假阴性率 ,具有应用于植入前遗传学诊断的实际可行性。
韩秀君, 金帆, 黄荷凤, 严力行[4]2004年在《单细胞人白细胞抗原多基因位点检测的配型预选性研究及意义》文中研究指明目的 探索单细胞扩增前引物延伸法 (PEP)全基因组扩增 ,后续多重巢式聚合酶链反应 (MN PCR)同步扩增人类白细胞抗原 (HLA) A、B和DR基因位点检测技术 ,进行配型预选研究的价值。方法 采用PEP MN PCR方法测定单个淋巴细胞和单个胚胎细胞的HLA A、B和DR基因型。结果 PEP MN PCR对单个淋巴细胞的扩增率、扩增准确率、假阴性率和假阳性率分别为 91 7%、95 7%、3 0 %和 1 7% ,而单个胚胎细胞则分别为 97 7%、97 5 %、2 3%和 2 6 % ,两种细胞检测结果比较差异均无显着性意义 (P >0 0 5 )。结论 单细胞PEP MN PCR检测HLA多基因位点有较高的扩增效率和扩增准确率 ,具有应用于植入前胚胎遗传学分析 ,筛选HLA匹配胚胎 ,提供脐血造血干细胞移植治疗同胞疾病的应用价值。
参考文献：
[1]. 单细胞DOP-PCR多基因位点检测的研究[C]. 金帆, 袁淑慧, 黄荷凤. 中国优生科学协会2004年优生科学学术交流大会论文集. 2004
[2]. PEP、DOP-PCR单细胞多基因位点检测研究[D]. 袁淑慧. 浙江大学. 2001
[3]. 单细胞扩增前引物延伸多基因位点检测研究[J]. 袁淑慧, 金帆, 黄荷凤. 浙江大学学报(医学版). 2002
[4]. 单细胞人白细胞抗原多基因位点检测的配型预选性研究及意义[J]. 韩秀君, 金帆, 黄荷凤, 严力行. 中华检验医学杂志. 2004
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