于春媛[1]2004年在《基质金属蛋白酶-2基因启动子区多态与肺癌及食管癌发生和转移风险的研究》文中研究表明基质金属蛋白酶-2(MMP-2)在肿瘤发生发展中起重要作用。本研究探讨MMP2基因启动子-735C／T和-1306C／T单核苷酸多态的功能改变以及这两个多态与肺癌及食管癌发生和转移风险的关系。 电泳迁移率变动分析和报告基因表达实验结果显示，-735C→T突变破坏了转录因子Sp1结合位点从而使MMP2转录水平降低。含C_(-1306)-C_(-735)单体型启动子驱动的报告基因表达水平比含T_(-1306)-T_(-735)单体型启动子驱动的报告基因表达水平高约7倍。逆转录PCR检测表明，携带-1306CC基因型和C_(-1306)-C_(-735)单体型者食管组织中MMP2 mRNA水平是其它基因型或单体型的5倍和3.7倍。 肺癌(n=770)和食管癌(n=527)病例对照(n=777)研究发现，-1306CC基因型者患肺癌和食管癌的风险比-1306TT或CT基因型高2.12倍(95％CI，1.64-2.72)和1.52倍(95％CI，1.17-1.96)。-735CC基因型者患肺癌和食管癌的风险比-735CT或TT基因型高1.57倍(95％CI，1.27-1.95)和1.30倍(95％CI，1.04-1.63)。C_(-1306)-C_(-735)单体型者患肺癌和食管癌的风险比T_(-1306)-T_(-735)单体型高5.01倍(95％CI，2.57-9.78)和6.53倍(95％CI，2.78-15.33)。此外，-735CC基因型肺癌患者发生肿瘤浸润及淋巴结转移风险比-735CT或TT基因型高1.65(95％CI，1.04-2.60)和1.42(95％CI，0.97-2.06)倍；C_(-1306)-C_(-735)单体型食管癌患者发生肿瘤远处转移风险比其它单体型高3.34倍(95％CI，1.16-9.63)。-1306CC和-735CC基因型或C_(-1306)-C_(-735)单体型与吸烟有交互作用。 本研究证明MMP2单核苷酸多态与肺癌和食管癌发生和转移风险相关，是决定肺癌和食管癌个体易感性的重要因素。
郭洪[2]2010年在《基质金属蛋白酶基因3’端非翻译区多态性与食管癌的关联及其机制研究》文中提出背景食管癌是人类最常见的恶性肿瘤之一,以其高发病率和高致死率成为威胁人类生命和健康的杀手。我国是食管癌大国,其中尤以鳞癌为主,每年有数十万的新发病例。因此,研究食管癌的发病机制,寻找其早期诊断、预防以及预后的标志就显得非常重要。食管癌是一个多基因参与、多因素作用的复杂疾病。近年来大量研究从基因多态性出发筛选出了很多与食管癌发病风险以及转移、预后相关的遗传标记。除了少部分位于蛋白编码序列或者启动子区域的位点功能得到阐明外,大部分的位点并没有发现其参与食管癌发病的机制,仅仅是作为一个分子标志物。microRNA(miRNA)是一种内源性的长22nt的单链小分子RNA,是一组不编码蛋白质的短序列RNA。通过与靶基因mRNA的3’端非翻译区(3’Untranslated Region, 3’UTR)的结合,在转录后水平降解mRNA或抑制翻译,从而调节基因的表达。miRNA与靶基因结合的关键部位称为“种子区域”(seed region, microRNA 5’末端开始2-7个核苷酸),与mRNA的3'UTR通过碱基配对结合。在人类基因组中目前已发现有超过一千万个SNP位点,在多态性数据库中可以发现其中有相当一部分落在了3’端非翻译区。最近的研究已经证实,这些位于3’端非翻译区的SNPs可能会通过影响miRNA的功能从而参与靶基因的表达调控。肿瘤细胞外基质与肿瘤基质细胞在肿瘤的发生发展过程中发挥着举足轻重的作用,基质金属蛋白酶通过对细胞外基质的降解来调节细胞的微环境。基质金属蛋白酶是一类依赖锌离子的蛋白水解酶,在人类己发现有20多种,几乎所有类型的人类肿瘤包括食管癌中都有基质金属蛋白酶,尤其是MMP1、2、3和9的表达异常。大多数基质金属蛋白酶由肿瘤细胞产生和分泌,但也可由肿瘤细胞周围的间质细胞分泌。研究表明,基质金属蛋白酶高表达与肿瘤进展,癌细胞侵袭和转移程度,病人的生存期等临床转归密切相关,是肿瘤病人预后的重要指标之一。前期大量研究关注基质金属蛋白酶基因的多态性位点与肿瘤的关联性,并发现部分位于启动子以及编码区的SNP位点与肿瘤的发生、转移以及临床分级分期相关。但迄今为止,还未有研究关注基质金属蛋白酶3’端非翻译区(3’UTR)的多态性位点与肿瘤易感性的关联研究。因此,本研究通过生物信息学预测,筛选基质金属蛋白酶基因3’端非翻译区中潜在的miRNA靶点,发掘这些靶点区域中的SNP位点,结合病例-对照研究,探讨基质金属蛋白酶基因3’端非翻译区中的基因多态性与食管癌发病的关系,并通过荧光素酶报告基因实验研究这些多态性位点的生物学功能。目的1、筛选与食管癌密切相关的基质金属蛋白酶基因3’UTR区域中的单核苷酸多态性位点,评价其对miRNA作用的影响。2、在重庆地区的食管鳞癌病例和正常对照中对以上位点进行关联研究。3、在细胞模型中,探讨阳性关联位点的生物学功能。方法与结果1、在NCBI数据库中下载与食管癌密切相关的基质金属蛋白酶基因(MMP1、2、3、7、8、9、10、11、12、13、14、15、21、26)的3’UTR序列,综合利用Diana、Targetscans、microCosm、miRanda、PicTar、microinspector以及PolymiRTS几个在线工具预测这些序列当中的miRNA结合位点。然后在dbSNP数据库中进行BLAST-SNP,筛选其中的SNPs位点,接下来使用RNAhybrid工具中的自由能总值(△△G)评价这些SNPs对“microRNA-靶基因”相互作用的影响。最后通过最小等位基因频率大于10%的标准选出一批位点进行下一步研究。最后共筛选到了位于基质金属蛋白酶基因3’UTR区域的13个SNP位点,在其中选取MMP8(rs12284255)、MMP2(rs7201)和MMP10 (rs470168)叁个中国汉人中的高频位点进行下一步的研究。2、在444例食管鳞癌病人以及匹配的468例正常对照中,采用SNPshot的分型方法对以上筛选出来的SNP位点进行分型。结果发现对照人群中叁个位点的基因型分布均符合哈代-温伯格平衡,将基因分型数据与HapMap数据库中的数据作比较,结果显示叁个SNP位点在重庆地区正常汉族人群中的分布与中国北京汉人基本一致,与日本东京人无明显差异,但与欧裔美国人、非裔美国人以及非洲约鲁巴人相比有显着差异。采用病例-对照研究分析了叁个SNP位点与食管鳞癌发病风险以及临床分期的关系。结果发现,MMP10(rs470168)位点和食管鳞癌发病风险间无相关性,而MMP8(rs12284255)和MMP2(rs7201)位点在共显性、显性、隐性和乘法模型中都显示出与食管鳞癌发病风险显着相关。MMP8(rs12284255)位点的AA基因型对食管鳞癌的发病风险有保护作用(OR为0.31, 95%CI为0.15-0.62),而MMP2(rs7201)位点的CC基因型是食管鳞癌发病的危险因素(OR为2.29,95%CI为1.44-3.64)。进一步在临床分期分析中发现,MMP8(rs12284255)位点在临床I/IIa分期组中A等位基因的频率为0.26,而在临床IIb/III/IV分期组中为0.17,CA基因型与较早的临床分期有关联(OR为0.48,95%为0.31-0.74)。MMP2(rs7201)位点在临床I/IIa分期组中C等位基因的频率为0.32,而在临床IIb/III/IV分期组中为0.45,CC基因型与较晚的临床分期有关联(OR为2.85,95%为1.65-4.23)。按照吸烟史对样本进行分层分析,结果发现,在不吸烟人群中,两个位点的基因型分布在食管癌患者组和对照组中没有显着差异(P值分别为0.29和0.39);而在吸烟人群中,两个位点的基因型分布与食管鳞癌发病风险显着相关(P值均小于0.001)。位点MMP8(rs12284255)和MMP10(rs470168)的单倍型分析分析显示,这两个位点不存在连锁不平衡关系(D’为0.423,r2为0.135),在单倍型的关联研究中也发现,四种单倍型在食管鳞癌病例组和对照组中均没有显着差异。3、第二部分研究分别探讨了MMP2(rs7201)和MMP8(rs12284255)两个位点的生物学功能。RT-PCR和Western-blot检测MMPs基因在食管癌组织中的mRNA和蛋白表达,统计相应SNP位点不同基因型与表达量的关系,探讨SNP位点影响基因表达调控的层面。然后分别构建SNP位点不同等位基因的报告基因载体pMIR-REPORT,与经生物信息学预测的相应miRNA的mimics/controls分别共转染到细胞株中,检测荧光素酶报告基因的表达,比较SNP位点不同基因型对“miRNA-靶基因”作用的影响,证实SNP位点的生物学功能。最后再选择基因分型为功能等位基因纯合子的细胞株,转染与生物信息学预测相应的miRNA的mimics和controls到细胞中,检测目的基因的蛋白表达,比较两组的差异,进一步验证SNP位点的功能意义。(1)MMP2(rs7201)位点的生物学功能研究检测并统计了rs7201位点不同基因型的食管鳞癌样本中MMP2基因的mRNA和蛋白表达水平。结果发现,叁组的mRNA表达水平没有明显差异(P=0.85);而在蛋白表达水平,CC组明显高于CA组和AA组,CC组与AA组之间存在显着差异(P<0.05)。提示位点rs7201可能是在转录后水平发挥作用。在随后的荧光素酶报告基因实验中,选择miR-520g表达较低的KYSE150细胞株,将miR-520g mimics/controls与pMIR-REPORT-C/pMIR-REPORT-A共转染到细胞中,结果发现,与miR mimics + pMIR-REPORT-C组相比,miR mimics + pMIR-REPORT-A组中荧光素酶表达量明显下降(P<0.05)。证实了MMP2(rs7201)位点的不同等位基因能够影响miR-520g与靶位点的结合能力,A等位基因的亲和力明显高于C等位基因。MMP2(rs7201)位点在食管癌细胞株TE-1中的基因型为AA,分别转染miR-520g的mimics和controls到细胞中,检测MMP2的蛋白表达。结果发现,与转染之前相比,miR-520g的mimics转染组MMP2的蛋白表达明显降低,而controls组没有显着变化,验证了miR-520g对MMP2基因的调控作用。(2)MMP8(rs12284255)位点的生物学功能研究检测并统计了MMP8(rs12284255)位点不同基因型的食管癌样本中MMP8基因的mRNA和蛋白表达水平,结果发现,叁组的mRNA表达水平没有明显差异(P=0.79);而在蛋白表达水平,CC组明显高于CA组和AA组,CC组与AA组之间存在显着差异(P<0.05)。提示位点rs12284255可能也在转录后水平发挥作用。在随后的荧光素酶报告基因实验中,选择miR-495表达较低的KYSE150细胞株,将miR-495 mimics/controls与pMIR-REPORT-G/pMIR-REPORT-T共转染到细胞中,结果发现,与miR mimics + pMIR-REPORT-G组相比,miR mimics + pMIR-REPORT-T组中荧光素酶表达量明显下降(P<0.05)。证实了MMP8(rs12284255)位点的不同等位基因能够影响miR-495与靶位点的结合能力,T等位基因(对应于正义链上rs12284255位点的A等位基因)的亲和力明显高于G(对应于正义链上rs12284255位点的C等位基因)等位基因。结论1、生物信息学预测并筛选到叁个位于基质金属蛋白酶基因3’UTR区域的SNP位点,在重庆地区食管鳞癌病例和正常对照中的研究发现,MMP8(rs12284255)位点和MMP2(rs7201)位点与食管鳞癌的发病风险以及临床分期存在显着关联。2、位点MMP2(rs7201)的不同等位基因能够影响miR-520g与靶位点的结合能力,A等位基因的亲和力明显高于C等位基因。该多态性位点可能通过影响miR-520g与MMP2基因3’UTR靶位点的结合能力而参与食管癌的发病。3、位点MMP8(rs12284255)的不同等位基因能够影响miR-495与靶位点的结合能力,T等位基因(对应于正义链上rs12284255位点的A等位基因)的亲和力明显高于G等位基因(对应于正义链上rs12284255位点的C等位基因)。该多态性位点可能通过影响miR-495与MMP8基因3’UTR靶位点的结合能力而参与食管癌的发病。综上所述,本研究从与食管癌发生发展密切相关的基质金属蛋白酶基因家族出发,利用生物信息学在其3’UTR区域发掘位于miRNA结合位点的SNP位点,并通过病例-对照研究发现MMP8(rs12284255)位点和MMP2(rs7201)位点与食管鳞癌的发病风险以及临床分期存在显着关联,最后在细胞模型中证实了这两个SNP位点的生物学功能。研究为我们采用候选基因SNP关联分析策略开展散发性食管癌遗传易感性的研究提供了一条崭新的思路,关联研究结果可能可以用于食管癌的早期诊断,但这两个位点的关联性需要在更大的样本以及其它人群中得到验证。阳性关联SNP位点的功能研究结果不仅阐述了食管癌中基质金属蛋白酶异常表达的可能机制,还为miR-520g和miR-495参与食管癌发病的可能性提供了线索,值得进一步深入研究。
佚名[3]2004年在《肿瘤流行病学与肿瘤病因学》文中认为肿瘤高发人群上消化道肿瘤筛查方法的应用与体会贺立绩黄瑞德山西省阳城县肿瘤防治办公室,山西阳城,048100 摘要目的:肿瘤筛查是癌症“叁早”的唯一途径,应用胃液隐血技术隐血珠+胃镜+活检的筛查方法在肿瘤高发人群中对30岁以上的居民进行了叁级筛查,以期降低人群晚期肿瘤发生率及死亡率,提高患者生存率。方法:1、全县30岁以上人群均为筛查对象;2、《防癌自查隐血试剂盒》即隐血珠为筛查药具;3、筛查方法采用一级隐血珠初筛,二级电子胃镜检查,叁级病理确诊的.“叁级法”。结果:1、隐血珠人群筛查,
王斌[4]2010年在《基质金属蛋白酶基因多态性与非小细胞肺癌的关联研究》文中认为目的:基质金属蛋白酶(matrix metalloproteinases,MMPs)是人体内降解细胞外基质(extracellar matrix,ECM)的主要酶类,在肿瘤发生和侵袭转移的过程中起着非常重要的作用。基质金属蛋白酶基因启动子区存在的多态性位点可以通过调控基因转录或蛋白表达水平而影响肿瘤的发生和发展。本研究旨在探讨MMP-12基因启动子区-82bp A/G和MMP-13基因启动子区-77bp A/G单核苷酸多态性( single nucleotide polymorphisms,SNPs)与我国北方人群非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)遗传易感性的关系。方法:采用基于医院的病例-对照研究方法,收集300例非小细胞肺癌患者(其中鳞癌161例,腺癌139例)和300例健康对照个体的静脉抗凝血5mL,同时记录其病史、年龄、性别、吸烟状况等个人相关资料。以蛋白酶K消化-饱和氯化钠盐析法提取外周血白细胞DNA,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)方法对MMP-12 -82A/G和MMP-13 -77A/G两个单核苷酸多态性进行基因分型,比较非小细胞肺癌病例组与健康对照组之间等位基因及基因型分布。数据统计分析采用SPSS13.0版软件包(SPSS Company,Chicago,Illinois,USA)进行,P<0.05认为有统计学意义。健康对照组基因型频率进行Hardy-Weinberg平衡分析。非小细胞肺癌病例组与健康对照组的基因型、等位基因频率分布比较采用行×列表卡方检验。单体型频率分析采用EH软件和2LD软件(1.2 version,Rockefeller University,New York)。以非条件Logistic回归法计算经年龄、性别、吸烟状况校正的相对风险度比值比(odds ratio,OR)及其95%可信区间(confidence interval,CI)。结果:1.非小细胞肺癌病例组中吸烟个体的比例(62.0%)明显高于健康对照组(36.3%)(χ2=39.54,P=0.00)。表明吸烟可显着增加非小细胞肺癌的发病风险,经年龄、性别校正后的OR值为3.74(95%CI=2.451~5.705)。2.健康对照组中的MMP-12基因启动子区转录起始点上游82bp处A/G SNP的基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。MMP-12基因-82A/G SNP基因型和等位基因频率分布在非小细胞肺癌病例组和健康对照组之间均无显着性差异(P>0.05)。根据个体吸烟状况和非小细胞肺癌病理类型进行分层分析的统计学结果均未发现MMP-12基因-82A/G SNP对非小细胞肺癌发病风险的影响。3.健康对照组中的MMP-13基因启动子区转录起始点上游77bp处A/GSNP的基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。MMP-13基因-77A/G多态性位点的A等位基因频率在非小细胞肺癌病例组为50.33%,显着高于健康对照组的44.33%(χ2=4.332,P<0.05)。MMP-13基因-77A/G SNP基因型分布在非小细胞肺癌病例组和健康对照组之间亦有显着性差异(χ2=8.638,P<0.05)。与G/G基因型相比,A/A基因型能显着增加非小细胞肺癌的发病风险,(OR=1.309,95%CI=1.033~1.659)。根据个体吸烟状况进行分层分析未发现MMP-13基因-77A/G SNP对非小细胞肺癌发病风险的影响。但与G/G基因型相比,A/A基因型有增加吸烟个体非小细胞肺癌发病风险的趋势,经年龄、性别校正后的OR值为1.410(95%CI=0.992~2.003)。根据非小细胞肺癌病理类型进行分层分析发现MMP-13基因-77A/G SNP与肺腺癌的发病风险相关(χ2=10.668,P=0.005);与G/G基因型相比,A/A基因型能够显着增加肺腺癌的发病风险,经年龄、性别和个体吸烟状况校正后的OR值为1.512(95%CI=1.128~2.028)。4.应用EH软件和2LD软件对MMP-12基因-82A/G SNP和MMP-13基因-77A/G SNP进行的联合分析显示,MMP-12A/MMP-13G单体型是人群中最常见的,占54.5%。MMP-12A/MMP-13A单体型频率在非小细胞肺癌病例组为49.6%,显着高于健康对照组的43.4%(χ2=4.315,P<0.05)。与MMP-12A/MMP-13G单体型相比,MMP-12A/MMP-13A单体型可显着增加非小细胞肺癌的发病风险(OR=1.275,95%CI=1.014~1.603)。结论:1.吸烟可以显着增加非小细胞肺癌的发病风险。2. MMP-12基因-82A/G SNP可能与非小细胞肺癌的发病风险无关。3. MMP-13基因-77A/G SNP与非小细胞肺癌的发病风险相关,进一步分析发现,这种作用在肺腺癌组更加明显。与G/G基因型相比,A/A基因型可显着增加非小细胞肺癌尤其是肺腺癌的发病风险。4. MMP-13基因-77A/G SNP可能与吸烟个体中非小细胞肺癌的发病风险相关,即与G/G基因型相比,A/A基因型有增加吸烟个体非小细胞肺癌发病风险的趋势。5.对MMP-12基因-82A/G SNP和MMP-13基因-77A/G SNP两个多态位点联合分析显示:MMP-12A/MMP-13G单体型是人群中最常见的。与MMP-12A/MMP-13G单体型相比,MMP-12A/MMP-13A单体型可显着增加非小细胞肺癌的发病风险。
贾书霄[5]2009年在《MMP-2和TIMP-2基因启动子区单核苷酸多态性与肺癌关系的研究》文中研究说明目的:基质金属蛋白酶(matrix metalloproteinases,MMPs)是一组依赖于锌离子的内切蛋白水解酶,通过降解细胞外基质和基底膜、促进肿瘤血管形成等,与肿瘤的发生发展、侵袭和转移密切相关。基质金属蛋白酶-2(matrix metalloproteinase-2,MMP-2)是MMPs家族成员之一,因在组织中广泛的表达及其多重的功能而颇受关注,存在于MMP-2基因上的单核苷酸多态性( single nucleotide polymorphism,SNP)可能通过影响其转录水平和蛋白质表达而与肿瘤的发生发展相关。另外,金属蛋白酶组织抑制剂-2(tissue inhibitor of metalloproteinase-2,TIMP-2)是一种重要的内源性MMP-2抑制剂,TIMP-2启动子区的SNP也可通过改变其转录活性影响TIMP-2和MMP-2的表达水平,从而影响肿瘤的发生发展。本研究旨在探讨MMP-2 -735C/T和TIMP-2 -418G/C单核苷酸多态性与中国河北省汉族人群肺癌易感性和淋巴结转移的关系。方法:采用病例-对照研究的方法。病例组选取2005年9月至2008年9月在河北医科大学第四医院呼吸内科住院治疗,经组织和/或细胞病理学确诊的肺癌患者共370例,所有患者均于放、化疗前采集静脉血标本。对照组选取同期在河北医科大学第四医院进行健康体检者共436例,经胸部X线、腹部B超等检查除外肺内及肺外肿瘤,且无遗传性疾病病史及肿瘤家族史。取每位研究对象静脉抗凝血5ml,以蛋白酶K消化-饱和氯化钠盐析法提取外周血白细胞DNA,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)方法检测MMP-2 -735C/T和TIMP-2 -418G/C基因多态性位点的各种基因型。数据统计分析采用SPSS11.5版软件包(SPSS Company,Chicago,Illinois,USA)进行,所有统计结果以P<0.05认为有统计学意义。采用卡方检验的方法比较对照组基因型频率的观察值与预期值,并进行Hardy-Weinberg平衡分析。病例组与对照组的年龄差异行t检验。两组间的基因型和等位基因频率分布比较采用行×列表卡方检验。以非条件Logistic回归方法计算表示相对风险度的比值比(odds ratio,OR)及其95%可信区间(confidence interval,CI)。结果:1 MMP-2 -735C/T多态的基因型和等位基因频率在病例组和对照组分布均无显着性差异(P=0.55和P=0.26)。与携带T等位基因(C/T和T/T基因型)相比,尽管携带MMP-2 -735 C/C基因型与肺癌总的发病风险无关( OR=1.17 ,95%CI=0.86~1.57),但根据病理类型分层分析发现,携带C/C基因型可能会使肺鳞癌的发病风险增加1.46倍(95%CI=1.00~2.14),而与肺腺癌的发病风险无关。2 TIMP-2 -418G/C多态的基因型和等位基因频率在病例组和对照组分布均无显着性差异(P=0.74和P=0.44)。与携带C等位基因(G/C和C/C基因型)相比,携带TIMP-2 -418G/G基因型与肺癌总的发病风险无关( OR=0.91 ,95%CI=0.67~1.23),根据病理类型分层分析也未发现该多态与不同病理类型肺癌的发病风险相关。3病例组的吸烟者为177例(47.8%),而对照组为152例(34.9%),两者相比有显着性差异(χ~2=13.95,P=0.00)。4根据个体吸烟状况分层分析,均未发现MMP-2 -735C/T、TIMP-2 -418G/C多态对吸烟人群或非吸烟人群肺癌发病风险的影响。5 MMP-2 -735C/T和TIMP-2 -418G/C多态的基因型分布在有淋巴结转移组和无淋巴结转移组相比,无显着性差异(P=0.92和P=0.18)。MMP-2 -735C/T和TIMP-2 -418G/C多态均与肺癌患者的淋巴结转移风险无关(OR=1.03,95%CI =0.64~1.65和OR=0.72,95%CI=0.44~1.17)。6对MMP-2 -735C/T和TIMP-2 -418G/C多态的联合基因型分析结果显示,-735C/C﹡-418G/G联合基因型在人群中最常见,其在健康人群中占47.7%。与-735C/T+T/T﹡-418GG联合基因型相比,其它3种基因型并不影响肺癌的发病风险,也不影响肺癌患者的淋巴结转移风险。结论:1与携带T等位基因相比,携带MMP-2 -735C/C基因型可能会增加肺鳞癌的发病风险,而与肺腺癌的发病风险无关。2 TIMP-2 -418G/C单核苷酸多态性与肺癌的发病风险无关,根据病理类型分层分析也未发现该多态对肺癌发病风险的影响。3 MMP-2 -735C/T、TIMP-2 -418G/C单核苷酸多态性均与吸烟人群或非吸烟人群肺癌的发病风险无关。4 MMP-2 -735C/T、TIMP-2 -418G/C单核苷酸多态性均与肺癌淋巴结转移无关。5 MMP-2 -735C/T和TIMP-2 -418G/C单核苷酸多态的联合基因型与肺癌的发病风险无关。6 MMP-2 -735C/T和TIMP-2 -418G/C单核苷酸多态的联合基因型与肺癌淋巴结转移无关。
张晓娟[6]2007年在《基质金属蛋白酶基因多态性与食管癌、贲门癌的关联研究》文中研究指明目的:基质金属蛋白酶(metrix metalloproteinase,MMP)是一个具有降解细胞外基质功能的蛋白水解酶家族,在肿瘤发生和侵袭转移的过程中起着十分重要的作用。基质金属蛋白酶基因启动子区存在的多态性位点可通过调控基因转录或蛋白表达水平而影响肿瘤的发生和发展。本研究旨在探讨MMP-2启动子区-735bp C/T、MMP-12启动子区-82bp A/G、MMP-13启动子区-77bp A/G单核苷酸多态性( single nucleotide polymorphism,SNP)与河北省食管癌、贲门癌高发区-磁县和涉县人群食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma , ESCC )、贲门腺癌( gastric cardiac adenocarcinoma,GCA)遗传易感性的关系。方法:采用基于人群的病例-对照研究方法,收集559例肿瘤患者(316例ESCC,243例GCA)和609例健康对照个体的静脉抗凝血5mL,同时记录其病史、个人史、肿瘤家族史。以蛋白酶K消化-饱和氯化钠盐析法提取外周血白细胞DNA,用聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)-限制性片段长度多态性分析(restriction fragment length polymorphism analysis,RFLP)方法对MMP-2 -735C/T、MMP-12 -82A/G和MMP-13 -77A/G叁个SNP进行基因分型。数据统计分析采用SPSS11.5版软件包(SPSS Company,Chicago,Illinois,USA)进行,P<0.05认为有统计学意义。对照组基因型频率进行Hardy-Weinberg平衡分析。病例组与对照组的基因型、等位基因频率分布比较采用行×列表卡方检验。单体型频率分析采用EH软件。以非条件Logistic回归法计算经经性别、年龄、吸烟状况、上消化道肿瘤(upper gastrointestinal cancers, UGIC)家族史校正的相对风险度比值比(odds ratio,OR)及其95%可信区间(confidence interval,CI)。结果1 ESCC和GCA患者组中UGIC家族史阳性个体的比例(分别为49.4%和50.2%)显着高于健康对照组(36.0%)(χ2=15.51和14.68,P=0.00)。表明UGIC家族史可显着增加ESCC、GCA的发病风险,经性别、年龄、吸烟状况校正后的OR值分别为1.74(95%CI=1.32~2.29)和1.77(95%CI=1.31~2.39)。2健康对照组中的MMP-2基因启动子区转录起始点上游735bp处C/T SNP的基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。MMP-2基因-735 C/T SNP基因型和等位基因频率分布在ESCC、GCA患者组及健康对照组之间均无显着性差异(P>0.05)。但与C/C基因型相比,携带T等位基因(C/T或T/T基因型)有降低GCA发病风险的趋势,经性别、年龄、吸烟状况、UGIC家族史校正后的OR值为0.73(95%CI=0.53~1.01)。根据个体吸烟状况进行分层分析发现,与C/C基因型相比,携带T等位基因(C/T或T/T基因型)显着降低非吸烟个体GCA的发病风险,经性别、年龄、UGIC家族史校正后的OR值为0.62(95%CI=0.39~0.98)。根据UGIC家族史分层分析的统计学结果未发现MMP-2基因-735C/T SNP对ESCC和GCA发病风险的影响。但与C/C基因型相比,携带T等位基因(C/T或T/T基因型)有降低UGIC家族史阳性个体GCA发病风险的趋势,经性别、年龄、吸烟状况校正后的OR值分别为0.64(95%CI=0.40~1.02)。3健康对照组中的MMP-12基因启动子区转录起始点上游82bp处A/G SNP的基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。MMP-12基因-82A/G SNP基因型和等位基因频率分布在ESCC、GCA患者组和健康对照组之间均无显着性差异(P>0.05)。根据个体吸烟状况以及UGIC家族史分层分析的统计学结果未发现MMP-12基因-82A/G SNP对ESCC和GCA发病风险的影响。但与A/A基因型相比,A/G基因型有增加吸烟个体GCA发病风险的趋势,经性别、年龄、UGIC家族史校正后的OR值为2.13 (95%CI=0.94~4.83)。4健康对照组中的MMP-13基因启动子区转录起始点上游77bp处A/G SNP的基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。MMP-13基因-77A/G SNP基因型和等位基因频率分布在ESCC、GCA患者组和健康对照组之间均无显着性差异(P>0.05)。根据个体吸烟状况进行分层分析发现,与A/G或G/G基因型相比,A/A基因型显着增加吸烟个体GCA的发病风险,经性别、年龄、UGIC家族史校正后的OR值为1.72(95% CI=1.02~2.87)。根据UGIC家族史分层分析未发现MMP-13基因-77A/G SNP对ESCC和GCA发病风险的影响。5应用EH软件对MMP-12基因-82A/G SNP和MMP-13基因-77A/G SNP进行的联合分析显示,MMP-12 A/MMP- 13G单体型是人群中最常见的,占50.6%。单体型分布在ESCC、GCA患者组与健康对照组间均无显着性差异(P>0.05)。结论1上消化道肿瘤家族史明显增加ESCC、GCA的发病风险。2 MMP-2基因基因启动子区-735 C/T多态可能与GCA发病相关,即与C/C基因型相比,携带T等位基因(C/T或T/T基因型)有降低GCA发病风险的趋势,进一步分析发现,这种作用主要表现在非吸烟个体及UGIC家族史阳性个体。3 MMP-12基因-82A/G SNP可能与吸烟个体GCA的发病风险相关,即与A/A基因型比较,A/G基因型有增加吸烟个体GCA发病风险的趋势。4 MMP-13基因-77A/G SNP可能与吸烟个体GCA的发病风险相关,即与A/G或G/G基因型相比,A/A基因型可显着增加吸烟个体GCA的发病风险。5 MMP-12基因-82A/G SNP和MMP-13基因-77A/G SNP的单体型分布可能与ESCC、GCA的发病风险无关。
傅勇[7]2009年在《MMP-9基因多态性与食管鳞状细胞癌易感性的关联研究》文中进行了进一步梳理研究背景及目的:食管癌是影响人类健康的常见恶性肿瘤,我国是食管癌高发区,食管癌死亡占我国恶性肿瘤死亡率的23.53%。因此研究食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma, ESCC)的发病机制,寻找新的诊断和治疗靶点,成为提高其预防和治疗效果的当务之急。基质金属蛋白酶(Matrix Metalloproteinase, MMPs)是一类与肿瘤发生、侵袭密切相关的蛋白水解酶,已经发现人体内有5类23种MMPs;MMP-9,又称为明胶酶B,是MMPs家族中分子量最大的成员,它能够有效地降解细胞外基质,破坏基底膜的完整性,参与肿瘤细胞的发生、发展和转移。单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNPs)是基因多态性中最常见的形式,SNPs在人群中的频率大于1%,基因结构性的改变会对转录功能产生实质性影响,导致相应蛋白产物改变,因此单核苷酸多态性的研究对筛选和保护肿瘤易感人群具有十分重要的意义。MMP-9基因有C-1562T、R279Q、P574R、R668Q等若干单核苷酸多态性位点,并且这些多态性位点可能通过调控基因转录或蛋白表达水平而影响胃癌、乳腺癌、结直肠癌等肿瘤的发生、发展和转移;但目前国内外尚无MMP-9基因C-1562T、R279Q、P574R多态性位点与ESCC易感性的关联研究报道。本研究主旨是探讨在中国西南地区人群中,MMP-9基因C-1562T、R279Q、P574R等多态位点SNPs与ESCC及其淋巴结转移易感性的关系;为深化了解和认识ESCC发生、发展和转移的相关遗传背景提供实验依据;从基因水平探讨ESCC发病机制,为早发现、早诊断ESCC提供理论依据,为治疗ESCC提供新的方法。方法:1.研究对象的筛选。长期居住在中国西南地区、无血缘关系的汉族人群,包括235例ESCC病例组及300例健康对照组。2.MMP-9基因SNP分析方法:(1)从静脉血标本中提取全基因组DNA。(2)用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(polymerase chain reaction-restriction fragement length polymorphisms, PCR-RFLPs)分析方法分别检测MMP-9 C-1562T、R279Q、P574R等3个SNPs位点基因型分布频率。3.统计学分析方法:应用SPSS 13.0软件包(SPSS Company,Chicago,Illinois,USA)进行实验数据统计分析。(1)以χ2检验进行哈代-温伯格平衡(Hardy-Weinberg Equilibrium,HWE)分析。(2)用行×列表χ2检验分析基因型、等位基因频率分布差异。(3)以非条件Logistic回归法分析多态性位点在ESCC发病中的风险度。(4)用在线软件SHEsis(http://analysis.bio-x.cn)进行连锁不平衡分析。结果:1.MMP-9 C-1562T SNP分布与ESCC发病风险的关联分析:MMP-9基因C-1562T SNP基因型分布在对照组中符合哈代-温伯格平衡(P>0.05)。MMP-9基因C-1562T SNP等位基因和基因型频率在病例组和对照组中均无显着性差异(χ2值分别为3.08、4.27,P值分别为0.08、0.12,均>0.05)。与C/C基因型相比,C/T和T/T基因型不会改变ESCC的发病风险(P>0.05),经性别、年龄、吸烟和饮酒状况校正后的OR值为0.73 (95%CI为0.49～1.09)。根据性别进行分层分析发现,与C/T和T/T基因型相比,携带C/C基因型的男性人群患ESCC的发病风险明显降低,经年龄、吸烟及饮酒校正后的OR值为0.54,95%CI为0.33～0.87;根据年龄进行分层分析发现,与C/T和T/T基因型相比,携带C/C基因型、并且年龄≤50岁人群患ESCC的发病风险明显降低,经性别、吸烟和饮酒校正后的OR值为0.25,95%CI为0.09～0.72;根据个体吸烟状况进行分层分析发现,与C/T和T/T基因型相比,携带C/C基因型的吸烟人群患ESCC的发病风险明显降低,经性别、年龄、饮酒校正后的OR值为0.46,95%CI为0.24～0.86;根据个体饮酒状况进行分层分析发现,与C/T和T/T基因型相比,携带C/C基因型的饮酒人群患ESCC的发病风险明显降低,经性别、年龄、吸烟校正后的OR值为0.36,95%CI为0.18～0.72。2.MMP-9基因R279Q SNP分布与ESCC发病风险的关联分析:MMP-9基因R279Q SNP基因型分布在对照组中符合哈代-温伯格平衡(P>0.05)。MMP-9基因R279Q SNP等位基因和基因型频率在病例组和对照组中分布差异具有统计学意义(χ2值分别为4.08、9.69,P分别为0.04、0.007,均<0.05)。根据性别进行分层分析发现,与Q/Q基因型相比,携带R/R基因型的女性人群患ESCC的发病风险显着增加,经年龄、吸烟及饮酒校正后的OR值为3.39,95%CI为1.37～8.04;根据年龄进行分层分析发现,与Q/Q基因型相比,携带R/R基因型并且年龄≤50岁人群患ESCC的发病风险显着增加,经性别、吸烟和饮酒校正后的OR值为3.39,95%CI为1.23～9.29;根据个体饮酒状况进行分层分析发现,与Q/Q基因型相比,携带R/R基因型的饮酒人群患ESCC的发病风险亦显着增加,经性别、年龄、吸烟校正后的OR值为2.40,95%CI为1.13～5.11。与Q/Q基因型相比,携带R/Q基因型的人群患ESCC的发病风险没有改变。3.MMP-9基因P574R SNP分布与ESCC发病风险的关联分析:MMP-9基因P574R SNP基因型分布在对照组中符合哈代-温伯格平衡(P=0.14>0.05)。MMP-9基因P574R SNP等位基因和基因型频率在病例组和对照组中都有显着性差异(χ2值分别为10.85、35.01,P值分别为0.001、0.000<0.05)。当分别按性别、年龄、吸烟和饮酒状况进行分层分析发现,与R/R基因型相比,携带P/R基因型的人群患ESCC的发病风险显着降低;与R/R基因型相比,携带P/P基因型的人群患ESCC发病风险的发病风险没有改变。4.MMP-9基因C-1562T、R279Q、P574R SNPs分布与ESCC伴淋巴结转移风险的关联分析:(1) MMP-9 1562C/C、C/T+T/T基因型在ESCC有和无淋巴结转移患者中的频率分别为82.4%、17.6%和71.7%、28.3%,二者差异无统计学意义(χ2 = 2.34, P>0.05)。(2) MMP-9 279R/R、R/Q、Q/Q基因型在ESCC有和无淋巴结转移患者中的频率分别为39.2%、43.1%、17.7%和40.7%、31.5%、27.8%,二者差异无统计学意义(χ2 = 3.19, P>0.05)。(3) MMP-9 574P/P、P/R、R/R基因型在ESCC有和无淋巴结转移患者中的频率分别为62.7%、23.5%、13.7%和70.7%、14.7%、14.7%,二者差异无统计学意义(χ2 = 2.27, P>0.05)。5.将MMP-9 C-1562T、R279Q、P574R SNPs进行连锁不平衡分析,C-1562T与R279Q、R279Q与P574R、C-1562T与P574R叁对位点的D'值分别为0.229、0.067、0.018,r2值分别为0.006、0.002、0.000。结论:1.携带MMP-9 574P/R、1562C/C基因型的人群患ESCC的发病风险明显降低;MMP-9 C-1562T、P574R基因多态性是中国西南地区人群患ESCC的保护因素。2.携带MMP-9 279R/R基因型的人群患ESCC的发病风险明显增加;MMP-9 R279Q基因多态性是中国西南地区人群患ESCC的危险因素。3.MMP-9基因C-1562T、R279Q、P574R SNPs与中国西南地区ESCC伴淋巴结转移无关联性。4.MMP-9 C-1562T、R279Q、P574R叁个SNPs位点在本实验研究中不存在连锁不平衡。
要凯[8]2013年在《MMP-12、MMP-13基因多态性与结直肠癌发病风险的关联研究》文中认为目的： MMP-12、MMP-13基因启动子区存在单核苷酸多态(singlenucleotide polymorphism，SNP)变异，这些SNPs位点与机体对结直肠癌的易感性相关联。本研究探讨MMP-12、MMP-13基因rs2276109A/G和rs2252070A/G单核苷酸多态性与结直肠癌遗传易感性的相关性，为结直肠癌高危人群的筛检及诊治提供有利的分子生物学依据。方法：选取2012年2月-2013年2月间就诊于河北医科大学附属第四医院的129例结直肠癌患者和74例健康人群做病例-对照研究。采用蛋白酶K消化-饱和氯化钠盐析法提取白细胞中DNA，采用聚合酶链反应-连接酶检测反应（Polymerase Chain Reaction-ligase detection reaction，PCR-LDR）方法对MMP-12、 MMP-13基因的rs2276109A/G和rs2252070A/G两SNP位点等位基因基因型频率分布进行检测。实验数据使用SPSS13.0版软件包（SPSS Company，Chicago，Illionis，USA）进行统计学分析。对直肠癌组、结肠癌组和对照组年龄之间差异进行t检验；并分别对两组的性别差异、等位基因分布频率及基因型分布频率进行χ2检验。并利用Hardy-Weinberg对两个组别基因型频率的分布进行连锁平衡分析。使用logistic回归方法计算相对风险度的比值比(oddsratio, OR)及其95%可信区间(confidence interval, CI)。采用EH软件和2LD软件对MMP-12MMP-13基因rs2276109A/G和rs2252070A/G两位SNPs行联合分析，P <0.05作为差异有显着性的标准。结果：1实验对照组中MMP-12rs2276109A/G MMP-13rs2252070A/G两位点基因型分布频率均遵从Hardy-Weinberg平衡（P>0.05）。2MMP-12基因rs2276109A/G多态性与CRC相关性分析：MMP-12基因rs2276109A/G位点上A和G等位基因频率在病例组中分别为98.7%和1.4%，在实验组结肠癌患者中分别为99.0%和1.0%，两组相比在统计学上无意义（P＞0.05），在实验组结肠癌患者中，A/A、A/G、G/G基因型出现的频率分别为98%、2.0%和0%，在对照组中叁种基因型出现的频率分别为97.3%、2.7%和0%，两组相比无统计学意义（P＞0.05），与A/A基因型个体相比较，携带A/G基因型个体与结肠癌的发病风险无相关性（OR=0.345，95％CI=0.019-6.145）；而在实验组直肠癌患者中，A和G等位基因出现的频率为93.6%、6.4%，与对照组相比在统计学具有显着性差异（P=0.049），说明MMP-12rs2276109A/G上等位基因出现G的频率升高会增加直肠癌的发病风险，在实验组直肠癌患者中A/A、A/G、G/G叁种基因型出现的频率为87.2%、12.8%、0%，与对照组相比在统计学上具有显着性差异（P=0.044），与A/A基因型个体相比较，携带A/G基因型个体能增加直肠癌的发病风险（OR=10.193，95％CI=1.552-66.939）。3MMP-13基因rs2252070A/G多态性与CRC相关性分析：MMP-13基因rs2252070A/G位点上A和G等位基因频率在实验组结肠癌中分别为47.1%和52.9%，在对照组中分别为32.4%和67.6%，两组相比较具有显着性差异（P=0.019），说明MMP-13rs2252070A/G上等位基因A的频率升高会增加结肠癌的发病风险，在实验组结肠癌患者中，A/A、A/G、G/G基因型出现的频率分别为15.7%、62.7%和21.6%，在对照组中叁种基因型出现的频率分别为13.5%、37.8%和48.6%，两者相比具有统计学意义（P=0.007），与G/G基因型个体相比较，携带A/G基因型个体能增加结肠癌的发病风险（OR=6.787，95％CI=2.392-19.253），携带A/A基因型个体对结肠癌的发病风险无影响（OR=3.378，95％CI=0.912-12.514）；而在实验组直肠癌患者中，A和G等位基因出现的频率为42.3%、57.7%，与对照组相比在统计学上无意义（P＞0.05），在实验组直肠癌患者A/A、A/G、G/G叁种基因型出现的频率为21.8%、41.0%、37.2%，与对照组相比在统计学上无显着性差异（P＞0.05），与G/G基因型个体相比较，携带A/G、A/A基因型个体对直肠癌的发病风险无影响（OR=1.475，95％CI=0.656-3.317，OR=2.404，95％CI=0.871-6.640）。4运用EH软件及2LD软件对MMP-12、MMP-13基因的rs2276109A/G和rs2252070A/G两位点SNPs进行联合分析，结果认为：4.1在对照组与实验组结肠癌患者中， MMP-12、 MMP-13基因的rs2276109A/G和rs2252070A/G两位点间存在较强的连锁不平衡现象（D'=0.992）,出现频率最高的单体型是rs2276109A-2252070G，出现频率为66.2%，其次依次为rs2276109A-2252070A、rs2276109G-2252070G和rs2276109G-2252070A，出现的频率依次32.4%、1.4%、0%。人群中rs2276109A-2252070A单体型可以增加结肠癌发病风险（OR=1.783,95％CI=1.060-2.997），rs2276109A-2252070G、rs2276109G-2252070G单体型则可减少结肠癌发病风险（OR=0.573,95％CI=0.342-0.961、OR=0.023,95％CI=0.001-0.454）,而rs2276109G-2252070A单体型由于样本数量少，单体型漏检。4.2在对照组与实验组直肠癌患者中， MMP-12、 MMP-13基因的rs2276109A/G和rs2252070A/G两位点间存在较弱的连锁不平衡现象（D'<0.001）。人群中rs2276109A-2252070G单体型可减少直肠癌发病风险（OR=0.615,95％CI=0.387-0.978）,而rs2276109G-2252070A单体型可能由于样本数量少，单体型漏检，其他两种单体型OR值分别为0.1.329（95％CI=0.829-2.128）、2.290（95％CI=0.432-12.138），此两种单体型可能与该病发病风险无关。结论：1MMP-12基因rs2276109A/G SNP可能与结肠癌的发病风险无关；但与直肠癌的发病风险有关，与A/A基因型个体相比较，携带A/G基因型个体能增加直肠癌的发病风险。2MMP-13基因rs2252070A/G SNP与结肠癌的发病风险相关，与G/G基因型个体相比较，携带A/G基因型个体能增加结肠癌的发病风险，携带A/A基因型个体与结肠癌的发病风险无相关性；但该基因位点SNP可能与直肠癌的发病风险无关。3MMP-12、MMP-13基因的rs2276109A/G和rs2252070A/GSNPs位点间在结肠癌存在较强连锁不平衡（D’=0.992）；在直肠癌中存在较弱的连锁不平衡（D’<0.001）。
杨洁[9]2009年在《基质金属蛋白酶-2基因多态性与2型糖尿病视网膜病变的关联性研究》文中研究表明目的:糖尿病(diabetes mellitus,DM)是广泛存在于世界各地,以高血糖为主要标志的内分泌代谢性疾病,是严重威胁人类健康的主要慢性病之一。糖尿病视网膜病变(diabeticretinopathy,DR)是糖尿病最常见的微血管并发症,是糖尿病患者致盲的重要原因之一。DR的发病机制目前还没有完全阐明,一些研究表明DR是一种多因素协同作用的并发症,身体长期处于高血糖的状态,导致一系列的代谢异常与DR的发生有关,但是并不能完全由生理生化和环境因素来解释DR的发病时间和严重程度。有些患者DR与DM几乎同时发病,而部分患者DR的发生却在DM发病十几年或几十年后;同时有研究发现DR具有家族聚集倾向,不同种族和地域的糖尿病人群DR的发病率也不尽相同。综上所述,遗传因素在DR的发生、发展过程中起着很重要的作用。目前国内外的学者主要从DR发生发展的分子生物学角度着手,筛选出可能有影响的候选因子,从基因多态性及基因表达调控方面分析这些因子在DR中的作用。故在此我们对基质金属蛋白酶-2与2型糖尿病视网膜病变的关联性进行研究。基质金属蛋白酶(matrix metalloproteinases,MMPs)是一个蛋白水解酶家族,几乎能降解细胞外基质(extracell matrix,ECM)和基底膜(basement membrane,BM)的所有成分,在许多生理和病理过程中发挥重要作用,存在于MMPs基因上的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)可能影响其基因的转录水平和蛋白质的表达,从而与一些疾病的发病有关。本研究旨在探讨MMP-2基因启动子区-1306C/T及-735C/T多态性与中国北方汉族人群2型糖尿视网膜病变的关系。方法:本研究采用病例.对照研究方法,病例来源于2006年3月至2008年2月在河北医科大学第四医院眼科及内分泌科住院、以及在石家庄市区进行DR筛查时发现的糖尿病患者,其中患有糖尿病而无DR的患者(DM组)139例,糖尿病视网膜病患者(DR组)151例,DR组中包括118例非增殖期糖尿病视网膜患者(NPDR组)、33例增殖期糖尿病视网膜病变患者(PDR组),所有病例均经国际WHO糖尿病诊断标准及国际糖尿病视网膜病变临床分类标准确诊。150例健康对照(Control组)为同期在河北医科大学第四医院进行健康体检的无关个体。用一次性真空管采集外周静脉血4 ml,采用蛋白酶K消化-饱和氯化钠盐析法提取外周血白细胞DNA。采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(polymerase chainreaction-restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)分析方法检测MMP-2的基因型及等位基因分布频率。数据统计分析采用SPSS11.5版软件包(SPSS Company,Chicago,Illinois,USA)进行,认为P＜0.05有统计学意义,卡方分割法认为P＜α′=0.0125有统计学意义。比较各位点基因型频率的观察值与预期值并进行卡方检验,并对正常对照组行Hardy-Weinberg平衡分析。连锁不平衡分析采用2LD软件(1.2 version,Rockefeller University,New York)进行。病例组与对照组的基因型和等位基因频率分布比较采用行×列表χ~2检验。以非条件Logistic回归法计算相对风险度的比值比(odds ratio,OR)及其95%可信区间(confidence interval,CI)。结果:1对照组MMP-2两个多态位点的基因型频率分布符合Hardy-wemberg平衡(P＞0.05)。2 MMP-2基因启动子区-1306C/T多态性与糖尿病视网膜病变的关系:Control、DM、DR叁组C、T等位基因频率分别为90.0%、10.0%;92.1%、7.9%;94.7%、5.3%,叁组C和T等位基因频率之间无显着差异(χ~2=4.686,P=0.096)。叁组C/C、C/T、T/T基因型频率分别为80%、20%、0%;86.3%、11.5%、2.2%;90.7%、7.9%、1.3%。叁组之间有显着差异(χ~2=7.130,P=0.028)。卡方分割进行两两比较的结果:Control组与DM组之间无显着差异(χ~2=2.054,P＞0.0125);DM组与DR组之间无显着差异(χ~2=1.388,P＞0.0125);Control组与DR组之间有显着差异(χ~2=6.939,P＜0.0125)。与C/T+T/T基因型相比,C/C基因型可能会增加糖尿病视网膜病变的发病风险。Control组与DR组相比较经校正的OR=2.446(95%CI=1.239-4.829);DM组与DR组比较经校正的OR=1.549(95%CI=0.745-3.223)。3 MMP-2基因启动子区-735C/T多态性与糖尿病视网膜病变的关系:Control、DM、DR叁组C、T等位基因频率分别为84.0%、16.0%;84.9%、15.1%;80.1%、19.9%。叁组相比差异无统计学意义(χ~2=2.671,P=0.263＞0.05)。叁组C/C、C/T、T/T基因型频率分别为70.7%、26.7%、2.7%;71.9%、25.9%、2.2%;63.6%、33.1%、3.3%。叁组相比差异也无统计学意义(χ~2=2.789,P=0.248)。与C/T+T/T基因型,C/C基因型不增加糖尿病视网膜患者的发病风险,Control与DR组相比经校正的OR=0.725(95%CI=0.447-1.175);DM与DR组相比经校正的OR=0.681(95%CI=0.414-1.119)。4以国际糖尿病视网膜病变分型作为分层标准:NPDR组MMP-2 -1306C/T位点C/C、C/T、T/T等位基因型频率分别为90.7%、7.6%、1.7%,与PDR组(90.9%、9.1%、0%)之间无显着差异(χ~2=0.002,P=0.968)。携带C/C基因型的个体不比携带C/T+T/T基因型的个体发生PDR的风险高,经校正的OR=1.028(95%CI=0.269-3.923)。两组C、T等位基因频率分别为94.5%、5.5%;95.5%、4.5%,两组之间无显着差异(χ~2=0.095,P=0.758)。同样NPDR组MMP-2.735C/T位点C/C、C/T、T/T基因型频率分别为62.7%、33.9%、3.4%,与PDR组(66.7%,30.3%,13.0%)相比无显着差异(χ~2=0.174,P=0.676)。携带C/C基因型的个体不比携带C/T+T/T基因型的个体发生增殖性视网膜病变的风险高,经校正的OR值为1.189(95%CI=0.527-2.685)。两组C、T等位基因频率分别为79.7%、20.3%;81.8%、18.2%,相比差异也无统计学意义(χ~2=0.151,P=0.698)。结论:1在中国北方汉族人群中MMP-2基因启动子区-1306C/T多态性可能与2型糖尿病视网膜病变的发病风险有关。与C/T+T/T基因型相比,携带C/C基因型可能增加糖尿病视网膜病变的发病风险,糖尿病患者中携带C/C基因型的患者发生DR的可能性是其他基因型的2.446倍。2在中国北方汉族人群中MMP-2基因-735C/T多态性可能与2型糖尿病视网膜病变的发病风险无关。3在中国北方汉族人群中MMP-2基因启动子区-1306C/T及-735C/T多态性可能与2型糖尿病视网膜病变由非增殖期进展到增殖期的发生风险无关联性。
陆丽杰[10]2017年在《基质金属蛋白酶基因多态性与肺癌易感性的相关性研究》文中认为肺癌是目前全球范围内最常见的恶性肿瘤之一,发病率和死亡率均呈上升趋势。烟草等吸入性致癌物是诱发肺癌的主要因素,但近年研究表明肺癌发病与遗传因素关系密切。单核苷酸多态性(SNP)是人类基因组最常见可遗传变异的一种。研究表明,基质金属蛋白酶(MMPs)是一类依赖于Zn2+高度保守的蛋白水解酶家族,有效降解细胞外基质和细胞基底膜成分。MMPs主要在转录水平调节基因表达,与肿瘤的侵袭和转移密切相关。本文旨在研究湖南地区人群MMP9、MMP13基因SNP及其联合作用以及MMP7基因SNP与肺癌遗传易感性和临床病理学参数的相关性。主要研究内容如下:(1)采用病例-对照法,对湖南地区182例肺癌患者和169例健康对照人群进行分析。记录研究对象的个人资料和临床病理学参数。使用DNA抽提试剂盒提取DNA,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法和直接测序法分析MMP9-1562C/T基因SNP与肺癌遗传易感性的相关性,所有数据由SPSS软件处理。结果表明,吸烟是肺癌发病的危险因子,且存在显着差异性(P=0.001,χ2=17.33)。Logistic回归分析显示,与MMP9-1562CT基因型相比,CC基因型能增加肺癌发病风险(OR=2.39,95%CI=1.45-3.92)。MMP9基因SNP与肺癌临床病理学参数没有相关性。(2)采用同样方法,分析182例肺癌患者和215例健康人群的MMP13-77A/G基因SNP与肺癌发病风险的相关性。结果表明,吸烟能增加肺癌发病风险(OR=0.00,χ2=27.13)。MMP13-77AA基因型相比于GG基因型是肺癌的保护因子(OR=0.53,95%CI=0.29-0.98)。MMP13基因SNP与肺癌临床病理学参数无明显相关性。MMP9 CC基因型与MMP13 GG基因型的联合作用能显着增加肺癌发病风险(OR=4.39,95%CI=2.08-9.26)。(3)对260例肺癌患者和219例对照人群MMP7-181A/G基因SNP与肺癌相关性的研究发现,吸烟能使肺癌发病风险增加(OR=0.00,χ2=26.51)。MMP7 AG基因型是肺癌易感因子,约是AA基因型的1.75倍(OR=1.75,95%CI=1.45-2.69)。MMP7基因SNP与肺癌临床病理学参数无相关性。
参考文献：
[1]. 基质金属蛋白酶-2基因启动子区多态与肺癌及食管癌发生和转移风险的研究[D]. 于春媛. 中国协和医科大学. 2004
[2]. 基质金属蛋白酶基因3’端非翻译区多态性与食管癌的关联及其机制研究[D]. 郭洪. 第叁军医大学. 2010
[3]. 肿瘤流行病学与肿瘤病因学[C]. 佚名. 第叁届中国肿瘤学术大会论文集. 2004
[4]. 基质金属蛋白酶基因多态性与非小细胞肺癌的关联研究[D]. 王斌. 河北医科大学. 2010
[5]. MMP-2和TIMP-2基因启动子区单核苷酸多态性与肺癌关系的研究[D]. 贾书霄. 河北医科大学. 2009
[6]. 基质金属蛋白酶基因多态性与食管癌、贲门癌的关联研究[D]. 张晓娟. 河北医科大学. 2007
[7]. MMP-9基因多态性与食管鳞状细胞癌易感性的关联研究[D]. 傅勇. 第叁军医大学. 2009
[8]. MMP-12、MMP-13基因多态性与结直肠癌发病风险的关联研究[D]. 要凯. 河北医科大学. 2013
[9]. 基质金属蛋白酶-2基因多态性与2型糖尿病视网膜病变的关联性研究[D]. 杨洁. 河北医科大学. 2009
[10]. 基质金属蛋白酶基因多态性与肺癌易感性的相关性研究[D]. 陆丽杰. 湖南工业大学. 2017
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