(仁寿县妇幼保健院儿保科 四川 眉山 620020)
【摘要】目的:研究仁寿县新生儿人群常见耳聋基因突变位点的分布情况。方法:纳入958例2016年1月至2016年12月期间在我院行常规耳聋基因检测的新生儿作为研究对象。采集研究对象足跟血进行DNA提取,采用遗传性耳聋基因芯片对研究对象进行检测,观察耳聋基因突变位点的分布情况。结果:SLC26 A4基因以IVS 7-2 A>G位点突变最为常见,均高于其他基因位点的突变率,P<0.05。结论:仁寿县新生儿人群中GJB2、SLC26 A4基因突变率较高,GJB2基因以235 del C位点突变率最高,SLC26 A4基因以IVS 7-2 A>G位点突变率最高。
【关键词】新生儿;耳聋;基因位点;分布
【中图分类号】R722 【文献标识码】A 【文章编号】2095-1752(2018)02-0371-02
先天性耳聋是目前我国新生儿最常见的先天性缺陷之一,发病率约为0.1~0.3%,且部分地区呈明显上升趋势,引起人们的关注和重视[1]。目前研究认为[2],先天性耳聋可由环境因素、基因突变等原因导致,其中50%的儿童期耳聋认为和遗传等因素有关。因此对新生儿进行耳聋筛查尤为重要。本文对我院新生儿采用耳聋基因芯片法进行筛查,分析仁寿县新生儿常见耳聋基因突变的位点分布情况,现报道如下。
1.资料与方法
1.1 一般资料
本次选取958例2016年1月至2012年12月期间在我院行常规耳聋基因检测的新生儿作为研究对象,采取新生儿足跟血提取DNA。所有研究对象均经家属同意并签字入组研究。被检测DNA组符合100~200ng/ul,纯度D(260)/D(280)=1.7~2.0。
1.2 方法
1.2.1主要试剂 由深圳华大基因有限公司提供的遗传性耳聋基因检测试剂盒。洗液配置:洗涤液I(0.3×SSC,0.1%SSD);洗涤液II(0.06×SSC)。杂交缓冲液,杂交芯片。
1.2.2 PCR扩增 PCR反应体系为20ul,每个DNA分别配置A、B反应体系。A:12.5ul引物混合物A1,4.5ul引物混合物A2,3.0ul模板DNA。B:12.5ul引物混合物B1,4.5ul引物混合物B2,3.0ul模板DNA。
1.2.3 PCR扩增步骤 在37℃下预变10min,95℃下预变15min,96℃下预变1min。之后94℃下30s,55℃下30s,72℃下45s为一个循环,共进行32个循环。72℃下45s,60℃下10min。94℃到55℃速率为0.4℃/s,55℃至70℃速率为0.2℃/s。
1.2.4杂交 PCR产物95℃下变性5min,放入冰水混合物冰浴3min。将杂交缓冲液加入融化(50℃),分为10ul每份,相同样品模板A、B体系各取2.5ul产物,加入各个杂交缓冲液中,混匀后加入芯片微阵列区域,封闭后放置于50℃水浴中1h。
1.2.5洗片 分别将洗涤剂I和II在42℃下进行混匀,80r/min。取出芯片后分别加入洗涤剂I和II,每加入一种均在80r/min下震荡摇匀,洗涤2次。甩干后采用微阵列芯片法进行检测,以晶芯LuxScanTM 10K-B微阵列芯片进行扫描。
1.3 统计学处理
采用SPSS 18.0统计软件,计量资料用(x-±s)表示,采用t检验,计数资料用百分比表示,采用χ2检验,P<0.05为差异有统计学意义。
2.结果
2.1 检出率
所有研究对象中检测GJB2基因突变频率为2.8%,SLC26 A4基因突变频率为2.1%。12S rRNA基因突变频率为0.1%。
2.2 耳聋基因突变在新生儿人群中的分布情况
其中GJB2基因以235 del C位点最为常见,SLC26 A4基因以IVS 7-2 A>G位点突变最为常见,均高于其他基因位点的突变率,P<0.05。见表1。
3.讨论
听力是人体五大感官之一,与语言能力息息相关。据研究显示[3],通过早期诊断和干预听力障碍儿童可有效提高患儿的语言水平。流行病学显示不同地区的耳聋突变基因不同,多数是有GJB2基因突变导致,占耳聋基因突变患儿的20%以上,另一部分是由线粒体DNA 12S rRNA 1555 A>G突变引起,占耳聋患儿的10%左右。还有部分地区主要由SLC26 A4基因突变引起,占到耳聋患儿的9%左右。因此针对部分地区耳聋患儿基因突变的研究,可有效制定筛查方式,从而提高耳聋的早期诊断率。
GJB2是常见的耳聋突变基因之一,在本文研究中显示,仁寿县儿童通过筛查,其中GJB2基因突变频率高达2.8%,其中以235 del C位点突变为主,占2.0%,可见GJB2基因突变是仁寿县患儿最常见的基因突变之一,其中以235 del C位点突变为主。SLC26 A4属于离子转运体家族,认为在耳聋中是仅次于GJB2突变的基因。
综上所述,仁寿县新生儿人群中GJB2、SLC26 A4基因突变率较高,GJB2基因以235 del C位点突变率最高,SLC26 A4基因以IVS 7-2 A>G位点突变率最高。
【参考文献】
[1]吕康模,熊业华,俞皓等.17000名新生儿遗传性耳聋基因突变筛查[J].中华医学遗传学杂志,2014,31(5):547-552.
[2]唐军,胡敏,苏艳等.518例新生儿听力及耳聋基因联合筛查结果分析[J].听力学及言语疾病杂志,2017,25(2):197-200.
[3]相丽丽,林倩,聂文英等.济南市部分新生儿听力和耳聋基因联合筛查结果分析[J].中华耳鼻咽喉头颈外科杂志,2015,50(5):401-405.
论文作者:杨旭,韩峰,向英,王菊容,陈雪梅,白玉芹(通讯作者
论文发表刊物:《医药前沿》2018年1月第2期
论文发表时间:2018/3/1
标签:仁寿县论文; 基因论文; 新生儿论文; 突变论文; 基因突变论文; 位点论文; 引物论文; 《医药前沿》2018年1月第2期论文;