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科技型中小企业技术创新基金实施五年来的实践证明：国家设立创新基金的决策是完全正确的。
1998年，创新基金筹划之初，正值亚洲金融危机刚刚平息。在那次金融危机中，中小企业发展比较好的国家和地区受到的影响较小，而以发展大企业为主的国家则遭受了沉重的打击。这次教训之后，发展科技型中小企业，已经逐步成为世界各国面临新一轮竞争的重要战略。中小企业是一个国家的活力所在，对整个国家的产业结构调整、提高自主知识产权等方面，都发挥着重要作用。对中国而言，科技型中小企业在推进高新技术产业化，提高产品附加值和竞争力，提高国民经济的整体效率和质量上，都有着非常重要的意义。我们经常说我国如今是世界的工厂、世界的加工车间，也就是说我们在世界产业分工上仍处于一个低层次。我们怎样才能改变这个面貌，而成为世界制造中心呢？答案就是要依靠高新技术产业的发展。而高新技术产业的发展所依靠的，正是千千万万个科技型中小企业。因此，科技型中小企业对整个国民经济来讲，具有举足轻重的作用。
从我国改革开放以来经济发展的情况来看，科技型中小企业发展有其自身规律——他虽然创新活跃，但比其他企业面临更多的风险。主要表现在两个方面：首先是技术风险。即使是企业的技术非常好，但并不是所有的先进技术产品都能被市场接受。这种例子不胜枚举：其次是管理风险。科技型中小企业大多由科技人员创业，而科技人员虽然有很好的技术创新能力，但未必都是一个很好的管理者。因此，科技型中小企业面临的各种风险，比起其他企业更大，获得资金的能力相对较差。针对这些问题，目前，世界各国都在积极采取各种方式支持中小企业发展，除法律制定、培育市场、政府采购、建设企业孵化器之外，国家财政直接引导性的资助是各国比较普遍的一种做法。几乎所有的发达国家，也包括很多发展中国家，都在用这种方法支持科技型中小企业发展。
我国设立创新基金五年来取得的显著成绩，完全实现了设立之初的预计目标。创新基金体现了中国政府的政策导向。它不单是一个资金的投入，也是一个政策的体现。创新基金用少量的种子基金起到了巨大的带动作用。据统计，创新基金投入后，引导投入企业的资本放大了17倍。五年来，已完成验收的近1700个企业取得了非常好的效果：虽然每个项目平均投入只有70万元，但单位产出平均能够增加产值2000多万元，增加税收也达200多万元。这种可观的效果充分证明我们的政策和措施是非常有效的，应当坚定不移地走下去，应当根据需求逐步扩大对创新基金的支持。
五年来，我国科技型中小企业虽然有了长足发展，但影响科技型中小企业发展的一些因素依然存在，有的问题还比较突出。主要表现在以下几点：
1.科技型中小企业的投融资环境亟待改善。
科技型中小企业面临的风险大，因此它的发展方式和投融资方式与其他企业也有很大不同。为此，我们要发展风险投资。目前，我们发展风险投资的最大问题在于缺少资金退出机制。虽然中小企业板块已获启动，但它仍沿用主板政策，这对风险投资资金的撤出带来很大问题。有了中小企业板固然是好事，因为它增加了科技型中小企业的融资渠道。但它仍需改进，如在法人股不能全流通等问题上，还需进一步解决；另外，关于投融资体系里企业间的兼并、收购的政策也很缺乏。
2.中小企业创新基金设立时的定位是风险投资的最前端，支持创新性最强的创业阶段。
但从目前的情况看，整个创新基金的支持没有完全实现预期目标。在工作中，为了降低基金投资的风险，如果创新基金的初期执行情况不够理想，或效益太差，再获得继续支持就会有较大困难。从总的情况来看，创新基金对创新性最强的创业阶段的支持还是很不够的。这与设立创新基金的初衷并非完全一致。按照基金设立最初的思想，基金今后的发展方向应该是要支持前端创新，至少是拿出部分资金来支持前端创新，推动其发展，引导风险投资后续的资金再介入。
3.文化因素的影响不容忽视。
中小企业，在创新基金的扶持下，顺利地度过了创业阶段后，还必须坚持走持续创新的道路，力求把企业做大做强。中国的科技型企业一个重要问题就是小企业太多，而大的太少。如软件企业，我国跟印度的差距主要就在规模上。究其原因，除了中小企业的资金问题外，还有文化背景的差异性。中国人更偏好于自己当小老板，而不愿意被人家兼并。而国外很多高新技术企业的发展，都是在不断兼并、收购、重组的过程中发展起来的。
归纳起来，我国的科技型中小企业发展，存在着外部环境不完善、发展政策不健全、本身文化观念有差距等问题。我们的任务是支持中小企业，并让其中的一部分发展为科技型大企业。创新基金今后应该更多地关注如何认真构建企业和企业家的统一体系、加强政府与市场的结合，努力改善科技型中小企业的成长环境等问题；要充分利用高新区和地方创新基金等力量，整合相关资源，形成系统化的科技型中小企业服务网络，形成政府资金、民间创业投资、商业和资本市场相衔接的科技型中小企业技术创新平台，推进科技型中小企业更大的发展，为我国全面建设小康社会做出更大贡献。