违法犯罪人员DNA建库中检测板的四种复核方法论文

违法犯罪人员DNA建库中检测板的四种复核方法论文

违法犯罪人员DNA建库中检测板的四种复核方法

李 阳1,高林林1,王之钦2

(1.杭州市公安局刑事科学技术研究所,杭州 310016;2.江苏赛奥生化有限公司杭州分公司,杭州 310012)

摘 要: 违法犯罪人员DNA数据库建设工作内容繁杂、工作量大,故必须避免实验操作过程中的人工失误,为此需有一套复核和自纠程序。因为在检测环节,不排除可能会发生错摆各板的次序而导致检测样本和已导入基因分析仪运行软件中的跑样表均无法“对号入座”,最终使各板都结果错误的情况。如此,既影响工作质量和效率,又会浪费试剂和耗材。对此,结合日常建库工作积累的经验,本文总结了四种复核方法:前后板间连锁复核法、计算机C语言板间复核程序法、本板内选定孔号复核法和“假入库”复核法。四种方法各有所长,甚至可联合应用,从而提高板间复核的准确率,保证违法犯罪人员DNA数据库的准确性和可靠性。

关键词: 违法犯罪人员DNA建库;板间连锁复核;程序复核;选定孔号复核;“假入库”复核

违法犯罪人员DNA数据库,简称前科库,是将犯罪高危人群或犯罪人群的DNA分型结果建库[1]。故DNA分型结果的质量直接关系到数据库的准确性和可靠性。前科库建设内容繁杂:从受理、排序编号到提取、扩增、检测到分析数据、入库、失败样本重检直至统计数据、前科复核、整理档案等步骤,流程长、重复性高、工作量大。仅本地每年就完成均量8万份左右样本;甚至有在两月内突击完成4.5万份左右的情况,平均每天约1 260份。因此,必须要避免实验操作过程中的人工失误,为此应有一套复核和自纠程序[2]

1 方法

检测环节,3130和3500基因分析仪一次可以同时放置2块待检测96孔板,3730基因分析仪则一次可放10块,在工作强度大时,不排除会发生错摆各板次序的可能性,导致检测样本和已导入基因分析仪运行软件中的跑样表无法“对号入座”,致使各板均检测错误,如此带来的后果是批量式的,待入库DNA数据就会批量式地作废,试剂和耗材也批量式地浪费[3]。针对这种情况,结合日常建库工作的经验积累,本文总结以下四种板间复核方法。

第一种,前后板间连锁复核。默认每块96孔板的A1、E12孔为LADDER孔,B1、C1孔为阳、阴性对照孔,D1、E1孔为复核孔,其余为样本孔。比如1、2、3……n 共n 板,从第1板的样本孔中随意挑出两个样本作为第2板的复核样,固定在第2板的复核孔,与第2板其他样本一起检验;从第2板的样本孔中随意挑出两个样本作为第3板的复核样,固定在第3板的复核孔,与第3板其他样本一起检验……以此类推。检验后分析数据,并通过人工比对,如果后板的复核样同前板的原样本分型结果一致,说明检测时前后板摆放次序正确,基因分析仪运行软件内跑样表和基因分析仪内的检测板“对号入座”;如果分型结果不同,说明检测时前后板摆放次序错误,跑样表和检测板“交叉入座”。

湖泊面积大,岸线长,以高邮湖为例,760.67 km2的水域面积,仅仅依靠湖泊管理人员的眼观脚量,不仅成本高、难度大,而且也很难准确掌握湖泊流域的综合情况。

第二种,用计算机C语言自制简单板间复核程序[4]。前期实验操作和结果判定同前后板间连锁复核法,不同之处在于程序比对代替了人工比对。程序设计原理是通过导出数据分析软件GeneMapper ID-X中前后板DNA分型信息的两张table,用计算机算法找出两张table中相同的Sample Name并对其对应的分型信息进行比对。具体操作步骤如下:首先通过GeneMapper ID-X的Report Manager功能键导出前后板关于 Sample Name、Marker、Allele 1、Allele 2的信息且格式为txt的两张Report。运行复核程序后,结果可显示:第1板与第2板的板间复核有错误提示;如果无误,将提示为“板间无差别”。进一步设想,如果在分析每板数据时,都从GeneMapper ID-X中导出关于实验室样本编号和DNA分型数据信息的Report,优化这个自制程序后,利用每一板的Report,一次性依次连续复核各板,来代替每两板逐次复核,那么工作效率将得到大大提高,并且这个优化不难实现。

第四种,“假入库(是指只点击导入但不点击确定)”测定摆放次序正误。在受理环节,待检验前科人员的背景信息(包括姓名、性别、样本实验室编号、保存号等)已录入数据库中,因此,在将一板(90个样本)DNA分型数据入库时,如果数据库跳出多个“样本与背景信息性别不符”的提示时,严重怀疑是由于各板摆放次序错误而导致待入库样本性别基因分型结果与数据库人员背景信息中性别信息不匹配;如果仅跳出个别样本与背景信息性别不符的提示,并不能确定是因摆放次序错误而致,此时需要将同时检测的临近板,再次以“假入库”考察错误的可能性。

第三种,本板内选定孔号复核。每板随意挑取本板2个原样本作为待复核样,并选定在本板除原样本所在孔号的另两个孔号检验该复核样,且同时检测的各板的复核样所在孔号须不同。应用3130或3500基因分析仪检测时,例如第1板的复核样在H6、B11孔,第2板的复核样则须在除H6、B11孔和本板原样本所在孔之外的其他孔号;应用3730基因分析仪时,则需要同时放置的10板复核样所在96孔板孔号位置均不相同。借助GeneMapper ID-X分析一板(90个样本)数据时,选择Tools-Profile Comparison功能,如果显示具有相同DNA分型的是原样本和已知选定孔号的复核样,则说明检测时摆放次序正确,跑样表和检测板匹配;如果显示具有相同分型的是原样本和非已知选定孔号的其他样本,说明检测时摆放次序错误,跑样表和检测板不匹配。

2 结果与讨论

本文四种方法,第一种板间连锁复核法能直观表现符合前后板摆放次序的原意,如果出现3个或以上板摆放错误的情况,复核孔与“误以为的原样本”的分型结果也将无法一致;而默认2个复核孔一是为了板间复核,二是为了板内复核:一般从前板样本孔中挑两个孔号位置相隔开、分别在前后半板的原样本。若发现板间复核有误,也不能排除是因前板检样跳孔而致,此时可通过问题复核样的孔号来排查前板的大概跳孔位置[5]。第二种程序复核法在第一种方法的基础上优化了比对步骤,以计算机比对代替了人工比对,既准确又快速,提高了工作效率,而一次性连续复核多板数据摆放次序的优化设想又将是再一次的效率提升。第三种选定孔号复核法立意精巧、操作简单,只需要在分析数据时使用GeneMapper ID-X中的一个功能键并对照实验检验记录即可一目了然。第四种“假入库”复核法略欠精确,而且当所有检测的样本均为同一性别时,则无复核能力。但在实际工作中,较少出现整板同性别的情况,因此用于入库前二次检查比较合适,在实际工作中可作为保证入库DNA分型数据准确和可靠的最后一道防线。此外,板间复核属于事后复核,它只能保证入库正确,而事前的检测摆放环节还是需要实验人员的认真仔细。如果发生检测时相邻板摆放次序错误,那么在GeneMapper ID-X中对各板逐个修改Sample Name将是经济成本最低的做法。

对责任的条件进行分析,表明约纳斯试图为其责任原理的内涵和外延做出限定。通过将“责任”维度重新引入伦理学,使其成为新的伦理学理论的核心。由于这种条件的设定,与过去哲学和伦理学研究中的责任相比,约纳斯的责任概念具有了不同的特质。约纳斯对责任的首要和基本条件的分析,一方面指出了当前伦理学的新问题,另一方面也确立了伦理学研究的新内容。正是在这个基础上,约纳斯提出了自己的“未来”责任原理。然而,约纳斯所使用的“未来”责任与传统伦理学理论中出现的责任,究竟有何不同?约纳斯进一步对责任的两种含义及其两种责任进行了区分。

综上所述,违法犯罪人员DNA建库工作因重复性高,可以说是简中有难,简是前科人员样本形式单一,易于检出,在实验室环境、试剂、仪器设备和实验人员都相对稳定的条件下,能较好地掌握工作成果和进度;难是一旦有问题就是批量式的,既影响工作质量和效率,又浪费试剂和耗材。所以,如何保证前科人员DNA分型信息正确、如何提高工作效率以及如何合理地节约试剂和耗材是前科库建设工作的主题。

将探测器和Ellipse2-A固定在一起,进行姿态解算精度的分析和比较。通过串口将各自的姿态解算结果发送到上位机,使用MATLAB搭建姿态解算评估系统上位机,不仅可以保证探测器和Ellipse2-A同时采样,还可以对姿态解算结果和精度进行直观的实时显示和即时评价。

参考文献

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Four Methods to Check the Position of 96-well Plate for Sampling in Constructing DNA Database of Criminals

LI Yang1, GAO Linin1, WANG Zhiqin2
(1. Institute of Criminal Science and Technology, Hangzhou Public Security Bureau, Hangzhou 310016, China;2. Hangzhou-based Jiangsu SEL Biochem Co. Ltd, Hangzhou 310012, China)

ABSTRACT: The construction of DNA database of criminals is complicated and large of workload, likely rendering the occurrence of manual errors during experimental process, therefore a set of review and self-correction procedures must be built up in order to rule out the possibility of erroneously placing the sampling 96-well plate. Thus, the tested samples are able to “sit in right seat” against the running table that has been introduced into a genetic analyzing software, avoiding the errors emerging so as to secure the work quality and efficiency and prevent the waste of man efforts and consumables. Based on the accumulated experiences from our daily database operation, four review methods are here summarized: 1. reviewing between 96-well plates with the selected samples in previous added plate through testing the designated wells of the immediate following plate; 2. programming by computer C language to carry out the task of 1; 3. selecting samples to be added and tested in the other wells of same one plate; 4. checking the consistency of the tested individual's data against his/her already-stored background information in the database. The four methods have their respective advantages, capable of their combinatorial application to improve the accuracy of inter-plate review and ensure the reliability of criminal DNA database.

KEY WORDS: construction of DNA database of criminals; interlocking review between 96-well plates; review by program;review by selected wells; review by stored data

中图分类号: DF795.2

文献标识码: B

文章编号: 1008-3650(2019)06-0548-03

第一作者简介: 李阳,女,浙江平湖人,学士,法医师,研究方向为违法犯罪人员DNA建库。E-mail:756517298@qq.com

DOI: 10.16467/j.1008-3650.2019.06.016

收稿日期: 2017-10-25;修回日期:2018-01-14

引用 本文格式:李阳,高林林,王之钦. 违法犯罪人员DNA建库中检测板的四种复核方法[J]. 刑事技术,2019, 44(6):548-550.

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