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乡镇企业要在更高的层次上获得长期稳定的发展，一个重要的方面就是要不断地进行技术创新。
农业部乡镇企业局、国务院发展研究中心技术经济部和原国家科委农村科技司联合开展了乡镇企业技术创新的调查，调查样本达4523家企业。通过对60余万个调查数据的综合分析，大致得出了如下结论。
在全部调查样本中，有3178家企业开展了技术创新活动，占70.3%。如果将技术创新细分为产品创新和工艺创新，那么开展产品创新的占全部样本的63.8%，开展工艺创新的占56.8%，两者均开展的占50.4%。
技术创新经费支出占1995年销售收入的比例为6.95%。考察整个“八五”期间，创新经费支出比例呈现逐年增大的趋势。
从创新经费支出结构看，一是机器设备的购买或引进比例过大。也就是说，乡镇企业的技术创新活动主要是围绕生产设备的更新换代进行的，其可能的结果是新产品的引入或现有产品功能的改善和质量的提高。这一结构，同国有企业（指福建、甘肃，下同）同类指标70%的水平大体相当。
二是新产品销售费用比例较大，占技术创新总费用的15.69%， 而国有企业和意大利的同类指标大致在5%左右。从中可以看出， 乡镇企业的新产品在市场进入方面需要付出比国有企业大得多的努力。
三是自主开发和合作开发的比例偏低。研究与发展经费、购买新技术经费分别占技术创新经费总支出的3.39%和3.44%。国有企业的同类指标分别为8%和2%。意大利工业企业的研究与发展经费占17.9%。显然，乡镇企业在自主研究开发投入和能力上仍存在较大差距。
乡镇企业技术创新方式的排序结果是：企业独立进行、同国内企业合作、同科研院所或高等院校合作、国际合并，并且密度分布主要集中在第一种方式。
调查发现，在创新企业中有34.4%的企业开展了研究与发展活动，其中有26.8%的企业连续开展研发活动；22.0%的企业设立了正式的研究与发展机构。
乡镇企业研究与发展经费占销售收入的比例为0.39%，国有企业为0.44%，后者略高。而1990年美国制造业的研发投入就达3.7%， 日本为3.29%。从此可见，无论是乡镇企业还是国有企业，在生产经营的链条中，研发投入过低，是导致产品特别是知识密集型产品缺乏竞争力和制约产品结构升级的主要原因。
抓企业的技术创新工作，既涉及当前瓶颈和障碍的消除，也涉及企业创新能力的逐步培育等长期性工作，头绪较多，是一项复杂的系统工程。从宏观创新环境而言，包括全社会创新意识的培养，政府创新政策的建立和完善，政府激励手段的强化，社会服务体系的建立；就微观层次而言，包括企业自主创新能力的培养，创新企业家的培育，职工素质的提高等。需要指出的是，企业技术创新的规律具有普遍性的意义，并不因企业“成分”（乡企、国有、私人）的差异存在特殊性。因此，政府创新政策的制定和实施应遵循普遍性的原则而“一视同仁”，换句话说，就是要将乡镇企业的技术创新纳入国家的创新战略中。
当前的政策要点应针对制约中小企业（包括乡镇企业）技术创新的外部因素，对症下药，消除障碍。具体内容有：完善乡镇企业和中小企业融资渠道、建立技术创新服务体系、调整经济结构、再造机制优势等。在市场经济体制下，尽管创新行为是市场行为，创新主体是经济体系中的企业，但政府在鼓励、扶持企业（当然包括乡镇企业）技术创新方面是应该“有所为”的。而如何促进中小企业的创新应该是创新政策的重要组成部分。
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