谢若泽[1]2002年在《DNA结构的实验数据数据库管理建立方法研究》文中研究说明数据采集与处理，在所有涉及到数字信息处理的领域中都占有核心的地位。近年来，实验力学的发展与计算机密切相关，计算机数据处理技术将实验力学带到了一个新的高度，使之成为具有重大技术经济意义的现代高新技术。 随着科学技术的发展，采集、处理的原始数据量越来越大，且在处理过程中将产生大量的中间数据和结果数据；数据已经从纯粹的数字数据发展到声音、图像等多媒体数据，对数据管理的要求越来越高；系统集成度越来越高，在许多场合要求联机实时处理，并需要考虑与网络的集成，进行分布处理。在这种背景下，采用数据库技术进行数据管理也就成了一种必然。 现代科学技术实验的数据采集处理已不满足于单机管理模式，数据的采集和存储、处理以及演示等在空间上的分离，要求对之进行网络化管理，这就必然涉及到对网络结构的选择。Windows DNA是Microsoft公司在Windows平台上，针对如何开发一个强健、稳固、可扩充性好的分布式网络应用系统而推出的解决方案，它以叁层体系结构为基本构架，以COM／DCOM作为其核心技术。 本文回顾了数据管理方式的发展历史，对数据库，特别是SQL Server 2000进行了比较详细的介绍，讨论了叁种数据访问对象：DAO、RDO、ADO，详细讨论了Windows DNA叁层结构，对软件系统集成方法进行了概述，然后在此基础上编制了一套针对实验数据的数据库管理软件，实现了对实验数据的数据库管理，另外还在导师原有科研工作的基础上，进行理论分析，并改进编制了一套视频点播管理系统软件，实际运行证明，可保证视频点播系统的正常运转和有效管理。
赵军民[2]2015年在《基于PPI网络的生物信息数据挖掘关键技术研究》文中研究说明蛋白质是基因表达的产物,生命活动的重要物质基础,几乎参与所有的生命活动和生物过程。研究发现,大多数蛋白质不能独立地执行生物功能,而是通过相互作用以协作的方式发挥其生物功能。日前,随着蛋白质相互作用数据的不断积累和完善,复杂生物网络中蛋白质相互作用网络逐渐成为系统生物学研究的热点问题之一。本文利用蛋白质相互作用网络,就蛋白质复合物的挖掘、关键蛋白质的识别、致病基因的预测等热门问题进行了较为深入的研究,具体研究如下：1.基于蛋白质复合物“核-附属物”的内部结构及核内蛋白质高度共表达的新发现,提出了一种基于基因共表达的蛋白质复合物挖掘算法。首先,根据编码相互作用蛋白质的基因之间存在共表达的特性,本文利用基因表达数据,构建了带权的蛋白质相互作用网络。然后,从边的角度选择权重大的边作为种子,识别出蛋白质复合物的核蛋白质。最后,根据为每个蛋自质复合物的核识别附属蛋白质,与核一起形成蛋白质复合物。2.结合已有关键蛋白质识别算法的优点,本文提出了一种基于局部连通强度的关键蛋白质识别算法。算法利用关键蛋白质往往对应着蛋白质相互作用网络中的高度蛋白质这样的事实,从源节点出发根据局部连通度的大小逐步逼近网络中的核心节点,以此识别山蛋白质网络中的高度关键蛋白质；然后,根据网络中蛋白质节点的局部中心性,识别蛋白质相互作用网络中处于稀疏区域的关键蛋白质。该算法既能识别蛋白质网络中处于稠密区域的关键蛋白质,又能识别蛋白质网络中稀疏区域的关键蛋白质,有效地提高了关键蛋白质识别的准确度。3.研究发现,关键蛋白质往往聚集于蛋白质复合物或功能模块,本文也对标准蛋白质复合物数据集进行了统计,结果发现超过60%的蛋白质复合物中都有关键蛋白质的存在。基于这种发现,并结合蛋白质复合物的“核-附属物”内部结构,提山了一种基于关键蛋白质的蛋白质复合物挖掘算法。首先,关键蛋白质节点为中心,根据一阶连通强度进行第一次扩展识别核蛋白质。然后,根据二阶连通强度为每个蛋白质复合物的核识别附属蛋白质,并与核一起生成蛋白质复合物。实验结果显示,本文提出的算法能够有效地从蛋自质网络中挖掘蛋白质复合物。4.研究发现,相同或相似疾病的致病基因所编码的蛋白质倾向于在蛋白质相互作用网络中聚集。基于这种发现,本文提出了基于功能流的致病基因识别算法,根据基因与蛋白质问的对应关系,利用蛋白质相互作用网络识别致病基因。文章首先基于基因本体GO计算基因之间的功能相似性,构建了带权的人类蛋白质相互作用网络,并将已知的致病基因以及同在一个关联区域的候选基因映射到蛋白质网络中。然后,以已知致病基因为源点模拟功能流算法过程,计算网络中每个蛋白质(基因)获得来自致病基因的功能得分。最后,根据功能得分对关联区域的候选基因进行排序,排序靠前的基因被认为更可能成为致病基因。总之,本文基于蛋白质相互作用网络的实际应用展开研究,利用蛋白质相互作用,基因表达、基因本体等生物数据,分别从边和点的角度设计了两种蛋白质复合物挖掘算法,基于连通强度设计了一种关键蛋白质识别算法,基于功能流思想设计了一种致病基因预测算法,并在真实数据集上进行了实验分析,结果显示本文提出的算法是有效的。
佚名[3]2011年在《自动化技术、计算机技术》文中认为TP112011011954一般成本环境下分散式多工厂资源调度/陈胜峰,蔚承建(南京工业大学信息科学与工程学院)//信息与控制.―2010,39(5).―640～645.研究多工厂一般成本结构特征,即工厂含有固定成本和单位成本,提出了一种分散式多工厂资源调度方法,该方法使用基于连续双向拍卖市场机制的ZI2策略。ZI2策略是一种包含价格和数量的二维报价策略,agent采用该策略在给定价格范围内随机提交报价。模拟实验结果验证了ZI2策略可以实现较高的调度效率,整体平均效率达到90%。图2表8参10
张锐[4]2008年在《生物序列模式挖掘的研究与应用》文中进行了进一步梳理人类基因组计划启动以来,越来越多物种的基因序列被测出,积累了大量的基因序列信息。与此同时各种蛋白质一级结构,即多肽链的氨基酸残基的排列顺序也在不断被探测出来。这些生物序列数据被存储在世界各地的数据库中,为生物的研究提供了巨量数据。但是有了巨量的数据并不意味着拥有了知识。如何从海量数据中获得有价值的知识、探求生物序列中的规律、挖掘蕴藏的意义,成为当前生物信息学研究的热点和难点。生物序列数据是最重要的生物数据之一,通过对生物序列的分析,我们可以发现物种的遗传规律、物种间的关系等。相关研究对于人类探求生命本质、寻找改造动植物的方法、治疗疾病的药物的研发等具有重要价值与意义。本文分析了生物序列数据的特征,并通过对当前生物序列模式挖掘方法研究中一些问题的探讨,本文取得了如下成果:1)生物序列模式具有复杂的特性,为了更有效地对其进行挖掘,本文设计了一个新的生物序列模式挖掘算法--MS-BioSM。MS-BioSM算法采用新的剪枝方法改进已有的prefixspan算法,同时综合考虑分布式支持度和局部支持度,从而寻找到满足一定阈值且更符合生物意义的序列模式。实验结果表明该算法有效降低了时间和空间的复杂度,并且挖掘出更有生物意义的序列模式。2)转录因子结合位点是一种重要的生物序列模式,同时具有自身的特点,为了更加准确的预测转录因子结合位点,本文设计了GBMM算法—基于遗传算法优化的多重马尔可夫模型。在实验中,通过对生物基因序列中的字符及字符片断间转移概率进行统计分析,建立多个马尔可夫状态转移矩阵,并采用遗传算法优化这些转移矩阵间组合,最终获得综合预测模型。在真实数据集上的实验表明算法具有较高准确率。3)本文结合数据挖掘技术提出了生物序列数据上的主要操作,给出了一个新型的生物序列数据库管理系统体系结构。为生物信息学研究提供一个有效的支持平台。
余敏[5]2007年在《凉山半细毛羊资源参考群信息数据库的初步构建》文中研究表明本研究以凉山半细毛羊为主要的研究对象，结合资料，系统整理了凉山半细毛羊资源参考群有关信息(系谱资料、生产性能资料和遗传信息)资料。实验研究人员每年到凉山州布拖县四川凉山半细毛羊核心育种场进行现场鉴定，获得羊毛性状和体重性状的表型资料数据，以及实验研究得到实验数据，将收集的数据整理后构建数据库。根据实际需要，研究了其信息系统的开发技术，介绍了凉山半细毛羊信息系统的实现。该系统有助于管理和实验人员迅速方便地获取相关信息，进而提高工作效率、改善科研和管理手段。开发中选择Microsoft中的Access数据库，用Macromedia Dreamweaver MX 2004，HTML(Hypter Text Markup Language)和FrontPage作为开发工具制作Web系统，实现ASP(Actire Server Pages)技术。主要内容包括：1．介绍了管理信息系统的基本概念，回顾了数据管理方式的发展历史，对各种生物数据库进行了较详细的介绍。2．介绍了凉山半细毛羊的种质特点以及目前的研究情况。3．介绍了系统的整体设计情况，探讨了系统数据库结构以及模块划分。4．介绍了各模块的功能实现流程及实现步骤。5．介绍了凉山半细毛羊Web系统的设计及开发情况。论文最后对完成的工作进行了总结，指出了今后的研究工作。
佚名[6]2010年在《自动化技术、计算机技术》文中提出TP11 2010021966离散网络化群体系统一致性H∞控制/李向舜,方华京(华中科技大学控制科学与工程系)//应用科学学报.―2009,27(5).―525～531.针对网络化群体的一致性问题给出了状态反馈H∞控制器存在的条件。通过状态分解将系统状态进行适当的分解,在此基础上结合线性矩阵不等
参考文献：
[1]. DNA结构的实验数据数据库管理建立方法研究[D]. 谢若泽. 四川大学. 2002
[2]. 基于PPI网络的生物信息数据挖掘关键技术研究[D]. 赵军民. 华中师范大学. 2015
[3]. 自动化技术、计算机技术[J]. 佚名. 中国无线电电子学文摘. 2011
[4]. 生物序列模式挖掘的研究与应用[D]. 张锐. 复旦大学. 2008
[5]. 凉山半细毛羊资源参考群信息数据库的初步构建[D]. 余敏. 四川农业大学. 2007
[6]. 自动化技术、计算机技术[J]. 佚名. 中国无线电电子学文摘. 2010