四川福森特司法鉴定所 610041
【摘要】目的:分析法医学组织病理切片STR分型影响因素。方法:取20例尸检新鲜组织样本,取出心、肝、脑、肾、脾、肺、肠七个部位组织做组织病理切片,保存切片时间分别在7d、14d、30d、90d、180d、360d、720d,提取切片DNA,并以STR分型,对比新鲜尸体DNA样本基因型。结果:保存时间越长,STR等位基因检出率越低,肺部STR基因检测率较其他部位检出率较高,数据有统计学意义,P<0.05。结论:时间是影响STR分型的主要因素,保存时间越长,STR分型成功率降低显著。
【关键词】法医学;组织病理切片;STR分型;影响因素
近年来法医学实验室在DNA物证提取中,多是应用组织病理学及细胞形态学。在病理切片检测中,各种案件均需检测组织切片DNA,并确定组织切片真实来源。而在组织切片保存检测时,甲醛固定及染色等操作步骤均会破坏组织切片DNA,使细胞含量降低,进而降低了细胞STR分型准确性。因此需明确组织病理切片STR分型影响因素,进而提高实验检测准确性。本文就分析法医学组织病理切片STR分型影响因素,其结果分析如下。
1 材料与方法
1.1 样本与分组
取20例尸检的新鲜组织样本,均为本鉴定中心尸检心、肝、脑、肾、脾、肺、肠七个部位组织样本,脑保存7d,为0-3个月婴儿;心保存14d,为4个月-3岁幼儿;肝保存30d,为3-6岁少儿;肺保存90d,为7-17岁少年;脾保存180d,为18-35岁青年;肾保存360d,为36-60岁中年;肠保存720d,为>60岁老年。
1.2 检测方法
分别取心、肝、脑、肾、脾、肺、肠七个部位组织样本,以10%甲醛固定2d,制成石蜡包埋组织,HE染色,作5μm组织切片厚度,分别保存7d、14d、30d、90d、180d、360d、720d。组织切片以二甲苯脱蜡,无水乙醇洗,自然晾干切片后,刮取组织置入离心管 ,以去离子纯净水洗涤,离心去上清。以硅珠法提取组织切片DNA,取70μLTNE、10%SDS 10μL、PK10μL置入离心管,振荡混匀后以56℃环境内保存半小时后,置入99℃加热12min。随后取硫氰酸胍150μL振荡混匀,离心,去上清置入离心管。随后取硅珠悬液10μL振荡混匀后置入室温,振荡混匀5s,离心,弃上清。以70%乙醇150μL洗涤,60℃烘干。取TE100μL置入,振荡混匀,56℃环境内保存20min,离心,制备成DNA模板,在4℃环境内保存。
1.3 STR基因分型
STR基因座分型:取ABI Identifiler试剂盒行STR基因座荧光扩增,以10μL Hi-Di甲酰胺、1.5μL PCR产物、0.2μL分子量内标GS-500 LIZ 振荡混匀,采取毛细管电泳,时间10s。
1.4 统计学方法
研究数据采取SPSS20.0统计学软件处理。组间计数数据样本以x2检验,当数据检验P<0.05时,说明数据存在统计学意义。
2 结果
STR检测分型结果分析
以新鲜尸体STR基因型为阳性对照,不同年龄 STR等位基因检测分型差异无统计学意义,P>0.05,组织类型、保存时间STR等位基因检出率比较,而在保存90d后肺、脾两部位STR基因型检测率较高,而肠STR检出率较低,数据有统计学意义P<0.05。见表1所示。
3 讨论
当前法医学在识别个体及判定身源时,多是采用组织病理切片,也是低拷贝模板DNA分型的主要检测方法。等位基因脱扣(ADO)、杂合基因座丢失(LOH)是导致STR基因分型错误的主要原因,当DNA模板浓度不足PCR体系有效阈值时,易出现ADO或LOH;DNA模板溶液存在扩增抑制物,致PCR扩增效果降低,进而出现ADO或LOH,并会影响STR等位基因分型[2]。另外单细胞等位基因片段越长,则越容易出现ADO。本次研究结果显示,肺部STR基因型检测率较高,而肠STR检出率较低,数据有统计学意义P<0.05。究其原因是脑组织、肠组织切片DNA检测中,浓度较低,则会出现ADO、LOH等情况,致STR基因检测率降低,影响STR分型结果。在个体识别STR等位基因时,若组织切片DNA模板检测的STR基因超过12个,则个体STR等位基因个数累计就能满足统计学要求。有研究资料[3]显示,当各类组织细胞DNA切片保存时间不足一个月,STR等位基因型就能检出超过12个;若切片保存时间超过3个月,保存DNA模板的细胞含量显著降低,基因组拷贝数也会随之减少,且扩增抑制物会影响PCR扩增影响度,进而会出现ADO情况,致STR等位基因型降低,检出率也随之减少。若组织切片保存时间超过6个月,STR基因座较容易出现ADO、LOH等情况,若组织切片保存时间越长,也更容易出现杂峰,致LOH出现数量增多,使STR等位基因型数量降低,且个数检出个数不足10个。若组织切片保存时间超过1年,随机扩增效应明显,STR等位基因型检出个数不超过5个,而保存时间超过2年,细胞组织切片基因组含量随之降低,进而容易出现LOH现象,因此STR等位基因分型难以检测。本次结果显示保存时间越长,STR等位基因检出率越低,数据差异有统计学意义,P<0.05。因此组织切片保存时间越长,则会影响STR分型检出率。保存时间越长,组织切片DNA也会随之降低,进而STR基因分型检测成功率也随之下降。
总而言之,时间是影响STR分型的主要因素,保存时间越长,STR基因分型检测成功率降低显著。一般组织切片保存时间在3个月内,能准备行本源认定。而通过肺组织切片检测,可作为STR基因分型检测的理想样本。
参考文献:
[1]冯杏玲,陈晓晖,陈玲,等.六色荧光标记同步检测27个STR基因座的法医学应用评估[J].基础医学与临床,2016,36(7):969-975.
[2]张文琼,刘宇轩,黄代新.Y-STR突变及快速突变Y-STR的法医学应用价值[J].中国法医学杂志,2015,30(4):380-383.
[3]陈勇,王瑛,彭珊,等.三个STR分型体系在法医学中的应用[J].中山大学学报(医学科学版),2014,35(5):685-689.
论文作者:陈梅君 钟倩 代瑶
论文发表刊物:《医师在线》2018年4月上第7期
论文发表时间:2018/7/5
标签:切片论文; 组织论文; 检出论文; 时间论文; 法医学论文; 基因论文; 统计学论文; 《医师在线》2018年4月上第7期论文;