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为了全面实现生态环境建设的目标，必须明确我国生态环境建设的区域配置问题。生态环境建设的实质是生态环境的保育，指保护、改良与合理利用。因此，生态环境建设是指水、土、气、生等自然资源（或再生自然资源）的保护、改良与合理利用。
我国地域辽阔，区域差异大，生态经济系统类型多样。根据各地的自然特点和生态环境现状，《全国生态环境建设规划》将全国生态环境建设划分为8个生态环境建设类型区，确定了各区生态环境建设的主要内容。
但是，每个大区的面积仍然太大。如何落实《规划》提出的各大区生态建设的措施配置，仍然存在着“因地制宜”的问题。
以“三北”风沙综合防治区为例，《规划》明确指出该区生态环境建设主攻方向是：在沙漠边缘地区，采用综合措施，大力增加沙区林草植被，控制荒漠化的扩大趋势。“三北”风沙区包括我国八大沙漠、四大沙地，各个沙漠边缘地区不仅自然条件差别很大，而且社会经济条件也很不相同。
因此，我们建议在各个大区之内还有必要以省（或自治区、直辖市）为单元，进行生态环境建设分区。生态环境建设分区着重考虑自然因素、社会经济条件和人类活动干扰程度的内部同质性与外部分异性，采用定量与定性相结合的方法。在分区的基础上，合理确定该区的生态环境建设目标（如林草覆盖率、乔灌草比例、治理程度、允许侵蚀模数、人均口粮、人均纯收入、实施年限等）。在建设目标的基础上，根据多年来治理与开发的典型经验，确定各区的生态建设模式，包括土地合理利用模式、综合防治措施配置模式、自然资源开发利用模式等。