串联重复序列名词解释
2023-01-10阅读(303)
问：什么叫可变数目串联重复序列
- 答：分开来解释就理解了 重复序列就是一段序列的多个拷贝，串联在一个染色体上，可变数目就是指拷贝数是可以变化的。
- 答：比如TATAbox 都是有一定功能的吧
问：什么是短串联重复序列？
- 答：人类基因组DNA有3×109bp，其中10%是串联重复序列，称为卫星DNA。按重复单位的长短，又可分为大卫星、中卫星、小卫星和微卫星。其中重复单位仅由2-6bases组成的叫微卫星（microsatellite analysis），又称它为短串联重复序列(Short Tandem Repeat. STR)，STR是存在于人类基因组DNA中的一类具有长度多态性的DNA序列，不同数目的核心序列呈串联重复排列，而呈现出长度多态性，通常多态性片段长度在100-300bp。一般认为，人类基因组DNA中平均每6～10kb就有一个STR位点，其多态性成为法医物证检验个人识别和亲子鉴定的丰富来源。不同人体基因组卫星DNA重复单位的数目是可变的，因此， 形成了极其复杂的等位基因片段长度多态性。
问：4️⃣ 核酸序列特征分析(8):重复序列的查找
- 答：基因组序列主要构成成分是 基因序列，重复序列和基因间序列 。
基因组注释包括基因组结构注释和基因组功能注释
结构注释的核心是基因识别，为了提高基因识别效率需要首先寻找并标记去除
重复的和低复杂性的序列。
重复序列（repetitive sequence）是在基因组中不同位置出现的相同或对称性序列片段，一般不编码多肽。组织形式有两种： 串联重复序列和分散重复序列。 前者成蔟存在于染色体的特定区域，后者分散于染色体各位点。
一般在顺式调控元件如启动子，增强子，终止子等出大量发行，真核生物中广泛分布。
大致分三类：
GC含量低，AT含量高，3'和5'端有直接重复序列存在，有利形成环形结构。
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