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在农村，一些养殖户给猪打了猪瘟疫苗后，猪瘟的发病率还很高，其主要原因有以下几方面。
一、不按免疫程序注射 按目前猪瘟免疫程序要求，非疫区的仔猪在60日龄注射，疫区的仔猪在30日龄注射第一次，60日龄再注射第二次，可获得较好的免疫效果。但目前在乡、村两级做不到这一点，无论有疫情或没有疫情的地区，只注射一次。
二、注射方法不当 在普注中，防疫人员用装甲注射器，安上短头针，固定好后注射1毫升疫苗就走。这种做法，一是猪不老实，一动疫苗就容易带出来；二是针头短，针孔大，注射小猪还可以，注射大猪扎不到肌肉或皮里，一拔针疫苗就容易渗出来，疫苗进入猪体内量少，不能发挥免疫作用。
三、病猪、临产猪不应注射疫苗 病猪注射猪瘟疫苗后，不但不能产生好的免疫效果，还会加重病情。
四、使用疫苗时不检查质量 从厂家经过市、县、乡、村等多次长途运输装卸和震荡，少数疫苗震坏，加之贮存时间长，出入库次数多而失效。应在使用疫苗之前，对疫苗出厂日期、批号进行全面检查。
五、不按规定稀释、使用 有些人在注射疫苗时，不按比例配制，稀释时不注意稀释液的酸碱度，因猪瘟疫苗对碱性敏感，用碱性大的稀释液稀释猪瘟疫苗会影响疫苗活力。稀释后的疫苗要求在气温15℃时当天用完；15℃～20℃时6小时内用完；25℃以上时4小时内用完。超过上述时间还继续用，就有失效的可能。
六、使用消毒液的浓度过大 一般消毒用75%的酒精或2%～3%的碘酊。而有的人用较大浓度（如5%）的碘酊消毒猪皮肤、针头，影响了猪瘟疫苗的免疫效果。
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