武胜勇
第二军医大学 200433
【摘 要】目的:筛选肝纤维化相关microRNA,并试分析其功能。方法:制备模型大鼠与正常大鼠,取肝活组织,提取RNA,进行RNA筛选与表达量分析,并测定行CoL-1、CTGF、TIMP-1 水平,并进行相关性分析。结果:正常大鼠239 个MicroRNA 片段,肝纤维化模型大鼠250 个,相交片段212 个,其中9 个存在较大变化,microRNA-138 上调表达差异倍数达3.843123;正常组与模型组MicroRNA-138 表达量与CoL-1、CTGF、TIMP-1 水平差异具有统计学意义(P<0.0),且存在相关性。结论:microRNA-138 可能具有抑制肝纤维化作用。
【关键词】肝纤维化;microRNA;调控
【中图分类号】R331.3+6【文献标识码】A【文章编号】1276-7808(2015)-06-499-01
肝纤维化是指各类损伤因素反复刺激性发生的肝脏病理改变,是各类肝病常见临床表现,具有不可逆性,可进展为肝硬化、肝癌。MicroRNA 是一类小分子非编码RNA,参与调控各类细胞生长、分化、凋亡等,研究证实其在肝纤维化发生、进展过程中发挥重要作用。本次研究试筛选肝纤维化相关microRNA,并探讨其在肝纤维化中发挥的功能,以供借鉴。
1 资料及方法
1.1 研究对象
取健康清洁级雄性大鼠40 只,3~4 周、体重(150±10)g,常规试验,正常食水。
1.2 仪器与试剂
猪血清、10%水合氯醛、4%多聚甲醛、无水乙醇、中性树胶、TRIzolR RNA 提取试剂盒,CR 型高速冷冻离心机、制冰机、4℃冰箱、低温冰箱、酶标仪、台式离心机、石蜡切片机、PV 扫描仪、,PCR 扩增仪IHi-Seq2000 高通量测序仪、超净工作台等。
1.3 方法
1.3.1 实验一
参照陈述所给出方法,制备肝纤维化模型大鼠。分别取5 份正常大鼠肝组织、5 份模型大鼠肝组织,提取RNA。主要步骤:①-80℃冰箱留存,分批取出;②液氮处理,碾碎,预称重,定量组织100mg,置入离心管;③加入1.5mlTRIZOL,摇匀,室温放置5min,加入0.3ml氯仿,混匀15s,留置2-3min,12000r/min 离心,15min,取上清液0.8m;④加入0.7ml 异丙醇,室温静置10min,10000r/min,持续10min,弃上企业,加入75%乙醇1.4ml,7000r/min,5min,弃上清液,干燥5min,100mlDEPC 灭菌处理,-70℃保存,留用。RNA 纯度分析:以infinite 酶标仪测定标本,进行样品完整性检测、纯度分析,最后进行表达差异检测。表达定量分析采用去PCR 技术检测,77℃-60min 接着85℃-5min 反应条件逆转录,所得产物以灭菌水稀释后-20℃保存,以SDS RQ 7500 software V2.0 软件计算样本Ct。
1.3.2 实验二
取正常大鼠40 只、肝纤维化模型大鼠40 只的肝组织,参照实验一测定表达差异最大的MicroRNA-138 表达量,并进行CoL-1、CTGF、TIMP-1 水平,并进行相关性分析。
1.4 统计学处理
数据资料以SPSS18.0 软件处理。计量资料以均数±标准差( x ±s)表示,若服从正太分布,组间比较采用t 检验,若不服从正太分布,组间比较采用非参数检验,相关性分析采用单因素相关性分析,P<0.05 表示差异具有统计学意义。
2 结果
2.1 MicroRNA 数目差异与表达差异
修剪低质量片段后,正常大鼠肝组织共获得704821 个片段,肝纤维化模型大鼠共获得795643 个片段,参考SOAP 比对程序,结果显示正常大鼠肝组织中3805343 个片段存在,肝纤维化模型大鼠中有3705440 个片段真实存在。再次对比寻找,正常大鼠肝样本中有239个MicroRNA 片段,肝纤维化模型大鼠中有250 个MicroRNA 片段,相交片段212 个,占前者88.70%,占后者84.80%。进行高通量检测,结果显示212 个相交MicroRNA 片段,有9 个存在较大变化,正常大鼠与肝纤维化模型大鼠表达量差异倍数>2 倍,分别是-1、-30b-5p、-144、-451、-674-3p、-27a、-138、-146b、-342-5p,前5 个位下调表达,后5 个为上调表达,其中-138 上调表达十分显著,差异倍数为3.843123。
2.2 细胞因子表达
研究显示,正常组与模型组MicroRNA-138 表达量与CoL-1、CTGF、TIMP-1 水平差异具有统计学意义(P<0.05)(见表1)。相关性分析,MicroRNA-138 表达量与CoL-1、CTGF、TIMP-1 水平均有相关性,r 分别为0.818、0.912、0.843、0.82,且P<0.01,具有统计学意义(P<0.05)。
3 讨论
研究显示,MicroRNA 可能为肝纤维化有关,相交片段212 个,中有9 个表达量差异倍数在2 倍以上,占4.25%,其中MicroRNA-138差异最为显著,其与人I 型胶原(CoL-1)、结缔组织生长因子(CTGF)、基质金属蛋白酶的组织抑制剂( TIMP-1 ) 密切相关, 提示MicroRNA-138 上调,可能通过以上三种物质抑制肝纤维化,但具体作用机制尚有待深入研究。
参考文献:
[1]王晓军,张荣珍,胡苑笙,等.我国病毒性肝炎流行现状研究[J].疾病监测2004,19(8):290-292.
[2]陈超.肝纤维化化相关microRNA 的筛选及其功能研究[D].上海:第二军医大学,2012.
论文作者:武胜勇
论文发表刊物:《世界复合医学》2015年第6期供稿
论文发表时间:2015/7/24
标签:大鼠论文; 肝纤维化论文; 片段论文; 差异论文; 模型论文; 相关性论文; 组织论文; 《世界复合医学》2015年第6期供稿论文;