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使用优良的菌种栽培食用菌是夺取耳菇优质、高产、高效的重要保证。如何鉴别优质菌种是广大菇农亟待解决的问题。菌种质量的优劣主要包括三个方面，一是鉴定所用菌株是不是所要栽培的菌株，如厂家不能确认，必须进行栽培试验；二是鉴别菌株性状的优劣，需要进行定性定量分析，最可靠的还是进行小面积栽培，测试产量高低、品质优劣及抗逆性状；三是鉴别菌种长势长相是否优良。前两个问题主要靠科研单位和厂家介绍，第三个问题需要广大菇农在购种时识别，以免造成损失。但当前还没有仪器进行测试，必须靠自己挑选。笔者根据３０多年的实际经验，将识别菌种优劣的方法简介于下：
一、鉴别菌种的方法
（一）长相 系指菌种的外观形态。菌丝和整个菌丝体是否丰满、浓密，如菌丝干瘪、稀疏、散乱，说明品种不良或菌龄过长；菌体干缩，说明菌种老化。若菌种表面出现一层厚菌膜即老皮，色黄，瓶底出现大量黄化；菌体干缩，大量出现子实体原基，说明菌种已老化，不可使用。
（二）长势
菌丝生长健壮有力，整齐、均匀，上下一致，说明菌种生长良好。反之，说明菌种活力差，品种有退化或培养环境条件不适宜，不宜使用。
（三）颜色
生长正常的菌种菌丝体颜色纯正、鲜亮，均为白色。如有杂菌污染，会出现其他颜色的菌落，如出现绿色则说明有青霉、木霉污染；出现桔红色说明有链孢霉；如果出现黄色，很可能出现黄曲霉，若有黑以出现，说明有毛霉、根霉和黑曲霉污染。同一瓶菌种，上下颜色应一致，若上部出现灰暗色也不能使用。
（四）气味正常的菌种，打开瓶盖可闻到浓郁的耳菇香味，若气味清淡或无香味，不宜使用，若闻有臭味、酸味或其他气味，则更不能使用。
（五）镜检用生物显微镜观察菌丝的形态、粗细、颜色、有无分枝、锁状联合、突起、隔膜，与该菌种的镜检标准相对照鉴别。
二、原种及栽培种的鉴别方法
（一）香菇菌种
１菌丝洁白、粗壮、舒展、均匀，边缘整齐，生长速度快；在瓶壁呈扇面羽毛状发展，生长健壮，会分泌酱油色的水珠。菌丝长满瓶后，１０～１５天内常见到琥珀色透明液体，并具有香菇特有的芳香气味，无臭味和霉味。
２如瓶内菌丝柱与瓶壁脱离，说明培养料水分过多所致；若既脱离，菌丝柱又开始萎缩，表面菌皮增厚并变为深褐色，说明菌种已开始老化，不能久存，应立即使用。
３若菌种柱表面已出现小菇蕾，是好菌种的特征之一，应去掉菇蕾尽快使用；若出现大量菇蕾，则说明菌龄较大已老化，不宜使用。
４如果菌种瓶内可以看到木屑颗粒，是培养时间不足，应再继续培养一段时间。若所用的米糠质量太差（含谷壳太多），致使菌丝生长不良，应更换培养基，重新生产。
（二）黑木耳菌种
１菌丝洁白，像细羊毛状，毛短整齐，浓密，粗壮有力，齐头并进地延伸直至瓶底，生长均匀，上下一致，挖出来成块，不松散。
２菌丝长满瓶后，在菌体表面一般会分泌出褐色水珠。以后
在瓶壁四周和表面出现浅黄色透
明胶质耳芽。
３菌种柱与瓶壁紧贴，瓶内壁附有少量白色水珠的为新鲜菌种。若瓶底有浅黄色积水，菌柱离壁干缩，为老化菌种，不能使用。
４正常的菌种有黑木耳特有的芳香气味，若有臭味和霉味，或出现斑块状及球状不发菌的现象，是细菌污染，若有其他红、绿、黄、黑等色，说明已被杂菌污染，也不能使用。
５培养基与瓶壁之间若出现浅黑色的胶质物（耳基），说明是早熟或扩接次数过多的菌种，栽培后耳片小，数量多，不易长大，品质差，产量低，应予淘汰。
６若瓶内可以看到木屑颗粒而菌丝很少，说明培养时间太短，应继续培养。若培养一段时间后没什么显著变化，说明培养基营养不足，应予补充。
７如果菌种长至一半左右或一个角落不再继续生长，可能是太干或太湿之故。若菌丝生长整齐，浓密，突然出现稀疏，并有一明显的分界，说明上部料适中，下部压得过实过密。
８种木和枝条菌种的表面和内部均应长满白色绵状菌丝，若剖开后不见菌丝，说明种木和枝条太湿，菌丝发育时间太短，应继续培养。
（三）蘑菇菌种
１优良蘑菇菌的菌丝为灰白色，密集，蓬松，呈细绒状，上下内外生长均匀一致，抗高湿，抗病虫杂菌，吃料快，无扇形变异。匍匐型菌种的菌丝呈细绒状分布，无黄白色的菌被。
２培养料中的菌丝成粗索状或细线状，呈淡黄色。菌丝干瘪萎缩，生长无力，或者上方出现很厚的黄白色菌被，均为老化菌种。
３出现绿、黄、黑或桔红色等染菌孢子的菌种必须淘汰烧掉。
４培养基上部菌丝干缩变质，下部菌丝生长良好，说明培养基太干，培养温度过高。
５若培养料中几乎见不到菌丝，内容物成糊状，说明湿度过
大，菌种过老，不能使用。
（四）平菇菌种
１优良的平菇菌种，菌丝洁白、粗壮、密集，菌丝生长均匀、整齐，呈粗羊毛状，爬壁性强。培养半个月左右，在瓶壁内可形成少量珊瑚状的小菇蕾或白色原基。
２多数品种在培养基上方表面形成绒毛状气生菌丝，低温品种气生菌丝常分泌黄褐色色素，特别是在高温季节，低温品种常出现红褐色或黄褐色的气生菌丝或黄水，这属正常现象。
３若培养基上方出现大量珊瑚状子实体或从瓶盖缝隙处长出子实体，说明菌龄过大，应尽快使用。若培养基干缩，瓶底积存黄水，为老化菌种不能使用。
４上部菌丝稀疏、灰暗、无力、干瘪，下部菌丝正常，说明初期培养温度过高，通气不良，或有细菌污染。如果出现黄、绿、桔红色，说明已被青霉、木霉和链孢霉污染，必须淘汰。
５菌丝在瓶中生长一半左右，不再向下生长，说明培养基过干、过湿、过紧，可用上部正常菌种，不再继续培养。
（五）草菇菌种
１菌丝密集，健壮，分布均匀，透明，有光泽，呈淡黄白色。有大量黄白色或锈红色的厚垣孢子堆，为正常的小粒草菇菌种；若厚垣孢子较少，为大粒草菇菌种。
２若瓶内菌丝萎缩、凋零，生长无力，培养基干涸或腐烂，为老化菌种，不能使用。
３若菌丝洁白、浓缩或瓶内长出墨汁状伞菌为鬼伞，也不能使用。
４栽培种的菌龄一般不超过２０天。
５若菌种中出现螨害，应予淘汰。
（六）银耳菌种
１香灰菌丝呈羽毛状，生长健状，初期分布均匀，白色，后期在耳基下方出现成束根状分布，表面黑色疤圈多，无其他色斑，说明香灰菌生长良好。
２银耳菌丝深入培养基即“吃”料深，在耳基下方有厚厚的一层银耳菌丝，木屑颜色变淡，说明菌丝分解力强。
３银耳菌丝和香灰菌丝二者比例适中，在培养基表面形成洁白体大的白毛团。白毛团生长旺盛，耳基大，说明菌龄小，生活力强，适合木段栽培；若白毛团很小、很多，或瓶内很快出现子实体，说明扩接次数过多，菌龄过大；若白毛团易胶质化变为小耳片，说明菌种已接近生理成熟，均宜代用料栽培。
４若香灰菌稀疏，不深入培养料中，子实体呈胶团状或胶刺状，不开片，说明培养基太湿或装得过实。
５如果已有羽毛状的香灰菌，没有白毛团，则必须如银耳酵母状分生孢子才能使用，否则不能使用。
６如果上半瓶菌丝稀疏或消失，下半瓶菌丝生长正常，而且耳基变淡红色，产生大量红褐色液体，多半是发生螨害。若发现白色絮状菌膜，则为杂菌污染，均不能使用。
（七）猴头菌种
１优良的猴头菌种，菌丝洁白、浓密、粗壮，上下内外生长均匀一致。在培养料上容易形成子实体。
２若菌丝干缩或瓶底有黄色粘液积存，为老化菌种，不能使用。
３菌丝生长缓慢无力、纤细，可能是培养料酸度不够或有机氮不足，应在培养料中增加麸皮或细米糠的用量，以改善菌种的营养条件。
４被杂菌污染的菌种不能使用。
（八）金针菇菌种
１菌丝呈絮状，洁白、浓密、健壮、富有弹性。有时表面可见到粉状的粉孢子，为优良菌种。
２如有坚韧的菌膜出现，只要除去菌膜也可使用。
３如果菌种干涸，菌柱收缩或菌丝自熔，产生大量红褐色液体，说明菌种生活力弱；如出现黄色，则说明菌种老化。
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