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雾霾对菌菇的危害，主要体现在菌菇生长过程中吸入有毒气体，或附着其他有毒有害物质微粒，或沾染细菌和病毒，轻则造成菌菇子实体畸形、色泽异变或发生大量死菇死蕾，或者沾染病毒病菌后，形成新的侵染性病害，或者不再出菇等，重则在菇体内残留有毒有害物质，对食用者造成人体伤害。在此提出几点减轻雾霾危害的措施：
1.采取设施化生产，减少对自然条件的依赖。所谓设施化，就是食用菌工厂化生产的基本状态，其关键的设施就是可控温菇房，有的还可加入控湿、控气等设备。该种设施化栽培，一定程度上解决了完全依靠自然条件的问题，不会因外界的气象状态对生产发生影响，从而摆脱了雾霾的危害，保证了生产按计划进行。
2.采取简单的单体设备，并实施内循环通风，防止或减少雾霾空气的进入。即便是菇农朋友的零散栽培，或者连片棚区的园区化生产，尽管依然在使用大棚设施，但是，目前已有不少菇农安装了诸如水温空调类设备，该种设备的最大优势就在于基本摆脱了靠天吃饭的境况，可以实现一定范围内的温度调控，比如夏季可以降温至23℃左右，有的甚至可降至10℃以下，冬季可以升温至20℃左右甚至更高，较好地实现了温控自如，基本满足了周年生产的要求。在此设备基础上，实施内循环通风，即可杜绝棚外雾霾中有害物质的进入，有效地保障了蘑菇的正常生长。
3.采取降温措施，降低蘑菇的生长速度，达到减少菇体呼吸、减少菇体代谢、减少对空气的需要量。如果不能实现棚温的向高调控，最有效的方法就是关闭通风口，同时降低棚温至菌菇可耐受的温度低限，借以减缓菌菇生长速度，以避过雾霾的危害。
4.采取早采收的管理措施。这是个最简便的措施，也是很有效的解决办法。当雾霾天气来临后，将正在生长的蘑菇集中采收，比如平菇最小可以采收至菌盖横径1厘米左右，1厘米以下的幼菇暂且保留。该措施有三大优势：第一、无需配置任何设施设备，即便是辅助性的设备也不需要添置；第二、幼菇的口感十分诱入，而且，较之长大后的菌菇，其蛋白质含量更高，同时因氨基酸含量高，其食用风味也更加嫩滑和鲜美；第三、早采后，既可避免雾霾对菌菇的危害，又能减少子实体继续从基料中吸收营养和水分。菌棒“保存实力”后，下潮菇会表现很旺盛，不但不会因此减产，而且增产的可能性较大。
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