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优良纯化菌种，是食用菌栽培成功的根本保证。如何对常见食用菌试管母种外观鉴别，是栽培户尤其是制种工作者应掌握的技术。现将几种最常见的方法介绍如下。
1、香菇菌丝 在马铃薯葡萄糖琼脂培养基（即PDA）上，菌丝纯白色，粗壮，呈现絮状或绒状。长满试管后有一定爬壁能力，边缘呈不规则波曲状。在24℃左右温度下，菌丝生长速度中等，一般12～15天即可长满试管斜面，具香菇特殊香味。
2、平菇菌丝 在PDA培养基上，菌丝洁白、浓密、粗壮，菌丝爬壁力强，可布满试管空间。在25℃条件下，菌丝生长快，一般6天可长满试管斜面，具平菇特殊香味。
3、金针菇菌丝 在PDA培养基上，菌丝灰白色，呈绒状或平贴状，稍有爬壁现象。菌丝老化后，表面常出现污褐色斑状，斜面上常产生粉孢子和小子实体。在23℃下，菌丝生长速度中等，一般10～12天可长满试管斜面，香菇不突出。
4、黑、毛木耳菌丝 在PDA培养基上，菌丝初始纤细透明，后渐变为白色粗壮的次级菌丝，呈棉絮状，丛生密集，菌丝前端较齐短，后期易产生分生孢子，使表层覆盖有一层粉状物。菌丝不爬壁，久置见强光后，斜面上出现斑块胶质体，近似耳片。在28～30℃下，菌丝生长速度中等，分泌深浅不同的色素，毛木耳多为深褐色，黑木耳多为琥珀色。其颜色深浅也与培养时间长短有关，香味不突出。
5、气生型双孢蘑菇菌丝 在PDA培养基上，孢子萌发7～9天出现灵芝状菌落，菌丝健壮细密，尖端粗直清晰，整齐一致，呈扇形伸展，气生菌丝似绒毛状，易在试管中形成菌皮。
6、银耳混合菌丝 银耳菌与羽状菌按一定比例混合，形成的菌丝短而密，前端整齐，始期菌丝呈茸毛状，生长速度较慢，随着培养时间延长，在白毛团周围有一圈紧贴培养基的晕环。
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